69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_06220 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_06220  NUDIX family protein  100 
 
 		 181 aa  357  5e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6335  NUDIX hydrolase  73.1 
 
 		 181 aa  250  8.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1731  NUDIX hydrolase  65.09 
 
 		 190 aa  220  7e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4732  NUDIX hydrolase  65.32 
 
 		 179 aa  218  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4177  NUDIX hydrolase  66.47 
 
 		 170 aa  217  8.999999999999998e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.086433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3304  NUDIX hydrolase  57.69 
 
 		 187 aa  199  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360239  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1358  NUDIX hydrolase  58.28 
 
 		 184 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.097904  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1339  NUDIX hydrolase  58.28 
 
 		 184 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1322  NUDIX hydrolase  58.28 
 
 		 184 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245288  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0883  NUDIX hydrolase  55.29 
 
 		 199 aa  174  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402979  normal  0.0136644 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0535  hypothetical protein  56.97 
 
 		 185 aa  167  8e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.523865  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0941  NUDIX hydrolase  53.41 
 
 		 199 aa  167  8e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0785282  normal  0.918248 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1181  NUDIX hydrolase  51.79 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3734  NUDIX hydrolase  54.44 
 
 		 171 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.056814  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1524  NUDIX hydrolase  52.02 
 
 		 188 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.533164  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3801  NUDIX hydrolase  53.93 
 
 		 196 aa  159  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.225828  normal  0.040121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8348  hypothetical protein  53.05 
 
 		 181 aa  157  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2957  NUDIX hydrolase  50.3 
 
 		 188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330064  normal  0.14207 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0711  NUDIX hydrolase  44.72 
 
 		 197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5005  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 		 184 aa  99.8  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0781982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1786  NUDIX hydrolase  44.59 
 
 		 204 aa  99.8  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.346997 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13930  NTP pyrophosphohydrolase  44.74 
 
 		 181 aa  99  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06076  hydrolase, nudix family protein  40.76 
 
 		 182 aa  88.6  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000965129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00851  hydrolase, nudix family protein  40.76 
 
 		 182 aa  88.6  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000243046  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2393  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 		 181 aa  88.2  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1014  NUDIX hydrolase  42.66 
 
 		 195 aa  87.4  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1646  NUDIX hydrolase  30.72 
 
 		 178 aa  84.7  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.637473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11440  NTP pyrophosphohydrolase  37.67 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178204  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3483  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4093  NUDIX hydrolase  37.09 
 
 		 187 aa  67.8  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4848  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00240786  normal  0.150096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4916  NUDIX hydrolase  42.57 
 
 		 283 aa  61.6  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  hitchhiker  0.00516547 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1658  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2190  hypothetical protein  29.01 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1034  NUDIX hydrolase  25 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1047  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0581  NUDIX hydrolase  30.2 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.664417 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4860  NUDIX hydrolase  44.71 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0632  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1980  NUDIX hydrolase  27.92 
 
 		 194 aa  54.3  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3204  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 		 191 aa  54.3  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11570  NUDIX family protein  36.28 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0677  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 		 145 aa  48.5  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.0113225 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  27.27 
 
 		 548 aa  48.5  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1182  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 147 aa  48.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2862  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 		 210 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00008626  normal  0.0453514 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 		 252 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0164  NUDIX hydrolase  28.87 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1326  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.602099 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  33.59 
 
 		 163 aa  46.2  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  28.18 
 
 		 155 aa  45.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1309  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 122 aa  45.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2689  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 		 141 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0662  NUDIX family hydrolase  22.29 
 
 		 188 aa  45.1  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0202176  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0673  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 		 158 aa  44.7  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.612507  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0661  NUDIX domain-containing protein  22.29 
 
 		 186 aa  44.7  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00385243  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1062  NUDIX family hydrolase  28.08 
 
 		 149 aa  44.3  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0194838  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2784  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 141 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.801073  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22390  ADP-ribose pyrophosphatase  27.13 
 
 		 196 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2168  hypothetical protein  32.21 
 
 		 1580 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 286 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15360  ADP-ribose pyrophosphatase  31.25 
 
 		 152 aa  42  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314217  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3076  NUDIX hydrolase  26.39 
 
 		 149 aa  41.6  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  30.07 
 
 		 248 aa  41.6  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  31.25 
 
 		 143 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 252 aa  41.6  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 320 aa  41.2  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>