51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_06076 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00851  hydrolase, nudix family protein  100 
 
 		 182 aa  356  8e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000243046  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06076  hydrolase, nudix family protein  100 
 
 		 182 aa  356  8e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000965129  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1786  NUDIX hydrolase  65.73 
 
 		 204 aa  234  5.0000000000000005e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.346997 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2393  NUDIX hydrolase  50.31 
 
 		 181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1646  NUDIX hydrolase  47.41 
 
 		 178 aa  130  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.637473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1014  NUDIX hydrolase  49.29 
 
 		 195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5005  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 		 184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0781982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3483  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1047  NUDIX hydrolase  41.25 
 
 		 186 aa  107  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0535  hypothetical protein  49.62 
 
 		 185 aa  100  8e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.523865  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1658  NUDIX hydrolase  39.61 
 
 		 190 aa  97.8  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0883  NUDIX hydrolase  44.36 
 
 		 199 aa  97.1  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402979  normal  0.0136644 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2957  NUDIX hydrolase  42.95 
 
 		 188 aa  95.5  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330064  normal  0.14207 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0941  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0785282  normal  0.918248 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1524  NUDIX hydrolase  43.67 
 
 		 188 aa  92  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.533164  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3734  NUDIX hydrolase  41.01 
 
 		 171 aa  90.9  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.056814  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4177  NUDIX hydrolase  42 
 
 		 170 aa  90.5  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.086433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06220  NUDIX family protein  40.76 
 
 		 181 aa  88.6  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8348  hypothetical protein  42.11 
 
 		 181 aa  87  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6335  NUDIX hydrolase  42.41 
 
 		 181 aa  85.9  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1034  NUDIX hydrolase  27.62 
 
 		 185 aa  84.7  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3801  NUDIX hydrolase  41.3 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.225828  normal  0.040121 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13930  NTP pyrophosphohydrolase  43.1 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4732  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1731  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22390  ADP-ribose pyrophosphatase  36.36 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0661  NUDIX domain-containing protein  29.81 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00385243  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0662  NUDIX family hydrolase  29.19 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0202176  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1980  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1181  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0581  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.664417 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0711  NUDIX hydrolase  42.98 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3304  NUDIX hydrolase  36.24 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360239  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11440  NTP pyrophosphohydrolase  36.42 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178204  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  36.79 
 
 		 548 aa  64.7  0.0000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0632  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2190  hypothetical protein  31.36 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1358  NUDIX hydrolase  36.88 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.097904  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1339  NUDIX hydrolase  36.88 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1322  NUDIX hydrolase  36.88 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245288  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11570  NUDIX family protein  32.65 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4916  NUDIX hydrolase  34.46 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  hitchhiker  0.00516547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4848  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 		 198 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00240786  normal  0.150096 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4093  NUDIX hydrolase  33.55 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1062  NUDIX family hydrolase  29.84 
 
 		 149 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0194838  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4860  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 163 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0164  NUDIX hydrolase  35.87 
 
 		 145 aa  45.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 144 aa  45.1  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3204  NUDIX hydrolase  29.29 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0677  NUDIX hydrolase  47.17 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.0113225 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>