More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0504 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 163 aa  338  2.9999999999999998e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  39.45 
 
 		 548 aa  83.6  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5005  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0781982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4093  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 187 aa  77.4  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3483  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1646  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.637473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1752  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00295797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0632  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0883  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402979  normal  0.0136644 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4848  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 198 aa  70.5  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00240786  normal  0.150096 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0555  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00430973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0941  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0785282  normal  0.918248 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4916  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  hitchhiker  0.00516547 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  38.78 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1786  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.346997 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1658  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1277  hypothetical protein  37.5 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.744115  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6335  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1014  NUDIX hydrolase  37.62 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1047  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0164  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00851  hydrolase, nudix family protein  32.82 
 
 		 182 aa  60.8  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000243046  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06076  hydrolase, nudix family protein  32.82 
 
 		 182 aa  60.8  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000965129  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4732  NUDIX hydrolase  28.77 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4860  NUDIX hydrolase  32.85 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0581  NUDIX hydrolase  29.53 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.664417 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06220  NUDIX family protein  34.85 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0677  NUDIX hydrolase  31.88 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.0113225 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2393  NUDIX hydrolase  27.81 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1034  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1524  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.533164  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1725  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.430045  hitchhiker  0.00283332 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11570  NUDIX family protein  30.92 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1731  NUDIX hydrolase  30.2 
 
 		 190 aa  57  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4177  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.086433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16380  ADP-ribose pyrophosphatase  30.15 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1326  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.602099 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0661  NUDIX domain-containing protein  27.94 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00385243  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11440  NTP pyrophosphohydrolase  36.13 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178204  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3304  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360239  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0662  NUDIX family hydrolase  27.94 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0202176  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  36.15 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0535  hypothetical protein  35.29 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.523865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8348  hypothetical protein  31.88 
 
 		 181 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  30.94 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3734  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.056814  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3801  NUDIX hydrolase  27.7 
 
 		 196 aa  50.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.225828  normal  0.040121 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 		 140 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  28.23 
 
 		 165 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  28.57 
 
 		 146 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  60 
 
 		 133 aa  50.4  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  30.22 
 
 		 158 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1181  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 185 aa  50.8  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2957  NUDIX hydrolase  29.32 
 
 		 188 aa  50.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330064  normal  0.14207 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 237 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  31.85 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 314 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1062  NUDIX family hydrolase  32.8 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0194838  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  29.29 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  47.17 
 
 		 136 aa  49.7  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  40 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  28.23 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  40 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  40 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13930  NTP pyrophosphohydrolase  26.74 
 
 		 181 aa  48.9  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3885  hypothetical protein  28.37 
 
 		 192 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 147 aa  48.1  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4567  NUDIX hydrolase  28 
 
 		 158 aa  47.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.790014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3076  NUDIX hydrolase  28.91 
 
 		 216 aa  47.4  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  38.46 
 
 		 314 aa  47.4  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2976  NUDIX hydrolase  28.21 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1195  MutT/nudix family protein  42 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3377  MutT/Nudix family protein  40 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3327  MutT/Nudix family protein  40 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2689  NUDIX hydrolase  28.69 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2784  NUDIX hydrolase  28.69 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.801073  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1182  NUDIX hydrolase  29.36 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  27.34 
 
 		 193 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  65.62 
 
 		 143 aa  47.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  28.67 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  29.6 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0711  NUDIX hydrolase  40.28 
 
 		 197 aa  47  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 		 136 aa  46.6  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1157  MutT/NUDIX family protein  41.07 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  47.92 
 
 		 183 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0841  NUDIX hydrolase  26.81 
 
 		 201 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1385  NUDIX hydrolase  26.23 
 
 		 209 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  39.66 
 
 		 181 aa  46.2  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  52.27 
 
 		 303 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4874  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1990  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.635974 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  26.15 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1553  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000488772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>