More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0555 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0555  NUDIX hydrolase  100 
 
 
149 aa  295  1e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00430973 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  71.14 
 
 
149 aa  224  5.0000000000000005e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1752  NUDIX hydrolase  68.53 
 
 
142 aa  199  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00295797 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1725  NUDIX hydrolase  68.97 
 
 
146 aa  190  5e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.430045  hitchhiker  0.00283332 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0677  NUDIX hydrolase  34.01 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.0113225 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0164  NUDIX hydrolase  33.78 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860889  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2689  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1980  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 
209 aa  63.9  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.280065 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2784  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.801073  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1182  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 
147 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2570  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 
146 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.240186  normal  0.520915 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  30.2 
 
 
430 aa  56.2  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  31.16 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  40 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  40 
 
 
137 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
236 aa  54.7  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1277  hypothetical protein  32.63 
 
 
166 aa  54.7  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.744115  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0794  NUDIX family hydrolase  37.35 
 
 
171 aa  54.7  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147035  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4860  NUDIX hydrolase  28.19 
 
 
163 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1326  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 
157 aa  53.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.602099 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0782  MutT/nudix family protein, putative  36.14 
 
 
171 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1799  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 
205 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000483875  normal  0.809218 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  40.62 
 
 
536 aa  52.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  28.57 
 
 
258 aa  52.8  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  30.66 
 
 
155 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  46.03 
 
 
360 aa  51.6  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0454  MutT/NUDIX family protein  46.77 
 
 
153 aa  50.8  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000159368  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0830  NUDIX hydrolase  43.94 
 
 
291 aa  51.2  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0064  A/G-specific adenine glycosylase  44.44 
 
 
435 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0542  mutT/nudix family protein  46.77 
 
 
153 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16009e-47 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0596  mutT/nudix family protein  46.77 
 
 
153 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000504952  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  37.04 
 
 
138 aa  50.8  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0511  mutT/nudix family protein  46.77 
 
 
164 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0633443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0450  MutT/NUDIX family protein  46.77 
 
 
164 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290469  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 
136 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0542  mutT/nudix family protein  46.77 
 
 
164 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000238457  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  37.04 
 
 
138 aa  50.8  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  42.62 
 
 
316 aa  50.4  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 
144 aa  50.1  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  29.93 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  29.93 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4549  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0460835  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  43.33 
 
 
399 aa  50.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  44.83 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4949  NUDIX hydrolase  45.28 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.626782  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  29.93 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0946  ADP-ribose pyrophosphatase  25.98 
 
 
207 aa  50.1  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000804497  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0082  NUDIX hydrolase  27.92 
 
 
157 aa  50.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.348807  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5241  mutT/nudix family protein  43.4 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5260  mutT/nudix family protein  43.4 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  41.67 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5317  mutT/nudix family protein  43.4 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  29.93 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  45.28 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5005  mutT/nudix family protein  43.4 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5682  mutT/nudix family protein  43.4 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4834  MutT/Nudix family protein  43.4 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4849  MutT/Nudix family protein  43.4 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1017  NUDIX hydrolase  44.64 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803103  normal  0.224803 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5385  mutT/nudix family protein  43.4 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  28.93 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5275  mutT/nudix family protein  43.4 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2664  NUDIX hydrolase family protein  45.45 
 
 
161 aa  48.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472799  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  35.8 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  28.93 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  34.74 
 
 
163 aa  48.9  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0616  mutT/nudix family protein  45.16 
 
 
169 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189637  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  45.45 
 
 
142 aa  48.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  42.86 
 
 
396 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
135 aa  48.9  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0578  mutT/nudix family protein  45.16 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0632  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 
205 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4760  mutT/nudix family protein  45.16 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000960716  hitchhiker  5.01668e-23 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0227  hypothetical protein  41.67 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  28.57 
 
 
548 aa  48.5  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4567  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
158 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.790014  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  45.45 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  28.37 
 
 
167 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0457  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0641725  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0073  MutT/nudix family protein  42.55 
 
 
162 aa  48.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2971  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 
153 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000073091  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2862  NUDIX hydrolase  34.12 
 
 
210 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00008626  normal  0.0453514 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  48.21 
 
 
329 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  32.04 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.86 
 
 
132 aa  48.1  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1553  NUDIX hydrolase  42 
 
 
176 aa  47.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000488772 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003180  MutT/nudix family protein  35.29 
 
 
96 aa  47.4  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 
136 aa  47.4  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  28.36 
 
 
144 aa  47.8  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 
155 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 
154 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>