45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1326 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1326  NUDIX hydrolase  100 
 
 
157 aa  312  9e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.602099 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0082  NUDIX hydrolase  57.23 
 
 
157 aa  174  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.348807  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1990  NUDIX hydrolase  54.43 
 
 
159 aa  165  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.635974 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0164  NUDIX hydrolase  48.65 
 
 
145 aa  122  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860889  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0677  NUDIX hydrolase  49.33 
 
 
145 aa  121  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.0113225 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1062  NUDIX family hydrolase  30.52 
 
 
149 aa  87  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0194838  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2570  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 
146 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.240186  normal  0.520915 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2689  NUDIX hydrolase  33.97 
 
 
141 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1182  NUDIX hydrolase  34.93 
 
 
147 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2784  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
141 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.801073  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1752  NUDIX hydrolase  34 
 
 
142 aa  57.8  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00295797 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 
163 aa  55.5  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  32.38 
 
 
149 aa  54.7  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0555  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00430973 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1725  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
146 aa  52  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.430045  hitchhiker  0.00283332 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
144 aa  50.4  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  31.2 
 
 
548 aa  50.1  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4860  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 
129 aa  49.7  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  33.99 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06220  NUDIX family protein  33.33 
 
 
181 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.755665  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3204  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 
191 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4916  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 
283 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  hitchhiker  0.00516547 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  35 
 
 
137 aa  44.7  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8348  hypothetical protein  34.31 
 
 
181 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2097  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0651329  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5005  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 
184 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0781982  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3483  NUDIX hydrolase  40 
 
 
186 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3748  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.55 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0251963 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  70 
 
 
143 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  29.51 
 
 
128 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4567  NUDIX hydrolase  29.79 
 
 
158 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.790014  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2798  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.23 
 
 
167 aa  42  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.779042  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1047  NUDIX hydrolase  31.2 
 
 
186 aa  41.6  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  52.27 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  42.03 
 
 
184 aa  41.2  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 
136 aa  41.2  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
187 aa  40.8  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  65.52 
 
 
165 aa  40.8  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  27.88 
 
 
142 aa  40.8  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  28.12 
 
 
159 aa  40.8  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 
145 aa  40.4  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
146 aa  40.4  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0632  NUDIX hydrolase  50.88 
 
 
205 aa  40.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  28.38 
 
 
187 aa  40.4  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>