61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1062 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1062  NUDIX family hydrolase  100 
 
 		 149 aa  304  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0194838  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0164  NUDIX hydrolase  37.16 
 
 		 145 aa  102  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0677  NUDIX hydrolase  35.81 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.0113225 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1326  NUDIX hydrolase  30.52 
 
 		 157 aa  87  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.602099 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1990  NUDIX hydrolase  30.26 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.635974 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0082  NUDIX hydrolase  33.81 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.348807  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0711  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2570  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 146 aa  52  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.240186  normal  0.520915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4860  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 		 163 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6335  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 		 181 aa  51.2  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2689  NUDIX hydrolase  28.19 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2784  NUDIX hydrolase  27.52 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.801073  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1524  NUDIX hydrolase  29.01 
 
 		 188 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.533164  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  28.79 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1182  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4177  NUDIX hydrolase  27.08 
 
 		 170 aa  47.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.086433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  28.03 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00851  hydrolase, nudix family protein  29.84 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000243046  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06076  hydrolase, nudix family protein  29.84 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000965129  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8348  hypothetical protein  28.91 
 
 		 181 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2957  NUDIX hydrolase  29.01 
 
 		 188 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330064  normal  0.14207 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1786  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 204 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.346997 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  28.03 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  28.03 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2862  NUDIX hydrolase  27.48 
 
 		 210 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00008626  normal  0.0453514 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  35.23 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3204  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 		 191 aa  44.7  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06220  NUDIX family protein  28.08 
 
 		 181 aa  44.3  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1034  NUDIX hydrolase  28.79 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0869  NUDIX hydrolase  41.03 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.11667  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3304  NUDIX hydrolase  30.37 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360239  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11570  NUDIX family protein  26.61 
 
 		 194 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4942  mutT/nudix family protein  32.26 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4683  mutT/nudix family protein  32.26 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1725  NUDIX hydrolase  52.38 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.430045  hitchhiker  0.00283332 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4541  MutT/NUDIX family pyrophosphohydrolase  32.26 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5043  mutT/nudix family protein  32.26 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.672649  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4907  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  32.26 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0883  NUDIX hydrolase  25.38 
 
 		 199 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402979  normal  0.0136644 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4522  MutT family pyrophosphohydrolase  32.26 
 
 		 159 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.986145  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0330  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  32.26 
 
 		 159 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4620  nucleoside triphosphatase YtkD  32.26 
 
 		 159 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3459  nucleoside triphosphatase YtkD  32.26 
 
 		 159 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.160983  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4928  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  32.26 
 
 		 159 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  50 
 
 		 536 aa  42  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4908  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  32.26 
 
 		 159 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  41.07 
 
 		 548 aa  41.6  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4732  NUDIX hydrolase  27.4 
 
 		 179 aa  41.2  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16380  ADP-ribose pyrophosphatase  27.4 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  32.61 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0535  hypothetical protein  36.23 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.523865  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0227  hypothetical protein  22.9 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  34.44 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  41.54 
 
 		 131 aa  41.2  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4630  NUDIX hydrolase  27.88 
 
 		 158 aa  41.2  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1604  NUDIX hydrolase  27.21 
 
 		 369 aa  40.8  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000210752  hitchhiker  0.0000224711 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1277  hypothetical protein  30.61 
 
 		 166 aa  40.8  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.744115  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.77 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  44.23 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>