94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3483 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_3483  NUDIX hydrolase  100 
 
 
186 aa  383  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1646  NUDIX hydrolase  49.33 
 
 
178 aa  149  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.637473  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2393  NUDIX hydrolase  47.29 
 
 
181 aa  136  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5005  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 
184 aa  122  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0781982  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1658  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 
190 aa  117  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06076  hydrolase, nudix family protein  36.13 
 
 
182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000965129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00851  hydrolase, nudix family protein  36.13 
 
 
182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000243046  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1014  NUDIX hydrolase  37.28 
 
 
195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226826  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1786  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
204 aa  103  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.346997 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1047  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 
186 aa  101  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4093  NUDIX hydrolase  41.78 
 
 
187 aa  98.6  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331104  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4848  NUDIX hydrolase  39.69 
 
 
198 aa  89.4  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00240786  normal  0.150096 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  30.92 
 
 
548 aa  85.5  4e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1181  NUDIX hydrolase  30.57 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4916  NUDIX hydrolase  37.9 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  hitchhiker  0.00516547 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1034  NUDIX hydrolase  24.24 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06220  NUDIX family protein  33.33 
 
 
181 aa  79.3  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.755665  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0632  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
205 aa  79  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3304  NUDIX hydrolase  32.45 
 
 
187 aa  78.2  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360239  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0581  NUDIX hydrolase  33.74 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.664417 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0535  hypothetical protein  31.2 
 
 
185 aa  77.8  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.523865  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0661  NUDIX domain-containing protein  27.01 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00385243  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0662  NUDIX family hydrolase  27.01 
 
 
188 aa  77  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0202176  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1731  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8348  hypothetical protein  29.33 
 
 
181 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11570  NUDIX family protein  29.25 
 
 
194 aa  72.8  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6335  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3801  NUDIX hydrolase  27.81 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.225828  normal  0.040121 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4732  NUDIX hydrolase  28.89 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0941  NUDIX hydrolase  30.32 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0785282  normal  0.918248 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2190  hypothetical protein  25.61 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3734  NUDIX hydrolase  28.67 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.056814  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0883  NUDIX hydrolase  29.92 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402979  normal  0.0136644 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0677  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.0113225 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2957  NUDIX hydrolase  28.67 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330064  normal  0.14207 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0164  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 
145 aa  62.4  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860889  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4177  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
170 aa  62  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.086433  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1980  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 
194 aa  62.4  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130683  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1339  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 
184 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1322  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 
184 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245288  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1358  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 
184 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.097904  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1524  NUDIX hydrolase  29.01 
 
 
188 aa  60.1  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.533164  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22390  ADP-ribose pyrophosphatase  25.19 
 
 
196 aa  59.3  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0711  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 
197 aa  56.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 
179 aa  55.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0841  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
201 aa  55.1  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11440  NTP pyrophosphohydrolase  28.7 
 
 
215 aa  54.3  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178204  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2862  NUDIX hydrolase  27.91 
 
 
210 aa  53.9  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00008626  normal  0.0453514 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3885  hypothetical protein  30.23 
 
 
192 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3204  NUDIX hydrolase  23.53 
 
 
191 aa  52.4  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1990  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 
159 aa  50.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.635974 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0082  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 
157 aa  50.1  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.348807  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0727  NUDIX/MutT family protein  27.27 
 
 
150 aa  48.9  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.371838  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  39.19 
 
 
212 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  26.56 
 
 
139 aa  46.6  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  24.79 
 
 
149 aa  46.2  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13930  NTP pyrophosphohydrolase  27.74 
 
 
181 aa  45.4  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4860  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
163 aa  45.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1010  NUDIX hydrolase  28.28 
 
 
181 aa  44.3  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2394  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 
191 aa  44.3  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.772855 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0555  NUDIX hydrolase  25.93 
 
 
149 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00430973 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
536 aa  43.5  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  23.26 
 
 
142 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  36 
 
 
156 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0623  NUDIX hydrolase  29.81 
 
 
167 aa  43.5  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  26.21 
 
 
155 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  38.18 
 
 
143 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  29.41 
 
 
169 aa  42.4  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4949  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 
152 aa  42.4  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.626782  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1326  NUDIX hydrolase  40 
 
 
157 aa  42.4  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.602099 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
155 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
155 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
155 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  38.16 
 
 
156 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  25.51 
 
 
142 aa  42  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
155 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
155 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1725  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 
146 aa  42  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.430045  hitchhiker  0.00283332 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2925  mutT/nudix family protein  29.41 
 
 
164 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.38475e-24 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4889  hypothetical protein  25 
 
 
337 aa  41.2  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5260  mutT/nudix family protein  40.74 
 
 
152 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5317  mutT/nudix family protein  40.74 
 
 
152 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5275  mutT/nudix family protein  40.74 
 
 
152 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5682  mutT/nudix family protein  40.74 
 
 
152 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5241  mutT/nudix family protein  40.74 
 
 
152 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5385  mutT/nudix family protein  40.74 
 
 
152 aa  41.2  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2926  mutT/nudix family protein  30.61 
 
 
164 aa  41.2  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4849  MutT/Nudix family protein  40.74 
 
 
152 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4834  MutT/Nudix family protein  40.74 
 
 
152 aa  41.2  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2669  MutT/Nudix family protein  30.61 
 
 
164 aa  41.2  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277246  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5005  mutT/nudix family protein  40.74 
 
 
152 aa  41.2  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2718  mutT/nudix family protein  30.61 
 
 
164 aa  41.2  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215744  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2308  NUDIX hydrolase  24.03 
 
 
167 aa  40.8  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000433057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>