More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0496 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 142 aa  287  4e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  40.29 
 
 		 166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  38.85 
 
 		 182 aa  104  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  37.12 
 
 		 149 aa  103  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  35.37 
 
 		 248 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  36.88 
 
 		 270 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  36.88 
 
 		 270 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 150 aa  99.4  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 		 268 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  38.69 
 
 		 203 aa  99  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  36.88 
 
 		 270 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 		 282 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  36.5 
 
 		 143 aa  97.8  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  40.15 
 
 		 153 aa  97.1  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  35.07 
 
 		 174 aa  95.9  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  36.24 
 
 		 219 aa  94.7  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  34.03 
 
 		 182 aa  93.2  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  35.56 
 
 		 169 aa  93.2  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  37.04 
 
 		 430 aa  92.4  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1029  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 		 151 aa  92.8  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 		 272 aa  91.3  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  42.06 
 
 		 164 aa  90.9  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 		 174 aa  90.5  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  33.81 
 
 		 160 aa  87.8  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 		 158 aa  87  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 		 302 aa  85.1  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  36.15 
 
 		 258 aa  85.1  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  30.61 
 
 		 205 aa  77.4  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 		 146 aa  76.6  0.00000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  43.97 
 
 		 424 aa  75.1  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  37.3 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2468  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 		 172 aa  70.5  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0192019  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  36.03 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  37.3 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  30.95 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 		 333 aa  65.5  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0179  NUDIX hydrolase  31.34 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0431401  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  32.59 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  29.57 
 
 		 195 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0812  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00112519  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 143 aa  60.1  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0164  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2125  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 322 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30 
 
 		 315 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0673  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.51908 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 314 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 		 536 aa  57.4  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 322 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2333  NUDIX hydrolase  27.94 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  38.1 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2356  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1465  NUDIX hydrolase  38.74 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.650531 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  31.39 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  26.28 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3028  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  28.91 
 
 		 317 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  28.35 
 
 		 311 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  28.35 
 
 		 311 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  28.35 
 
 		 311 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  35.64 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1993  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  25 
 
 		 180 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 		 208 aa  53.9  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 303 aa  53.5  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  29.37 
 
 		 577 aa  53.9  0.0000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3794  NAD(+) diphosphatase  32.41 
 
 		 272 aa  53.5  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0019252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 		 211 aa  52.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  30.66 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 		 310 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  27.13 
 
 		 141 aa  52  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  28.93 
 
 		 159 aa  52  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1747  NAD(+) diphosphatase  29.27 
 
 		 282 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1443  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 		 261 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  26.62 
 
 		 161 aa  51.6  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>