258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4158 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  100 
 
 
166 aa  334  3.9999999999999995e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  93.98 
 
 
182 aa  313  5e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  74.5 
 
 
203 aa  233  1.0000000000000001e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  64.83 
 
 
174 aa  193  9e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  61.54 
 
 
158 aa  191  6e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  58.93 
 
 
182 aa  186  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  62.34 
 
 
205 aa  185  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  61.33 
 
 
206 aa  181  5.0000000000000004e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  58.04 
 
 
160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  59.06 
 
 
219 aa  171  5e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  55.48 
 
 
272 aa  163  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  56.62 
 
 
430 aa  160  6e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  55.48 
 
 
270 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  55.48 
 
 
270 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  55.48 
 
 
270 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  54.11 
 
 
268 aa  157  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  56.62 
 
 
258 aa  156  1e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  55.48 
 
 
248 aa  155  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  53.42 
 
 
282 aa  155  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  53.47 
 
 
302 aa  150  8e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  53.79 
 
 
174 aa  147  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  55.22 
 
 
141 aa  144  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  53.15 
 
 
158 aa  142  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  52.86 
 
 
169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  53.9 
 
 
151 aa  138  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  40.29 
 
 
142 aa  108  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  43.38 
 
 
149 aa  100  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
147 aa  95.5  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  42.65 
 
 
150 aa  92.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  42.66 
 
 
164 aa  90.9  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 
143 aa  87.4  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 
147 aa  84.3  7e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
153 aa  81.3  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1029  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
151 aa  73.6  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2468  NUDIX hydrolase  32.7 
 
 
172 aa  72  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0192019  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2333  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  34.21 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  31.94 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 
208 aa  63.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  29.71 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  34.45 
 
 
317 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
148 aa  60.8  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 
229 aa  60.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.07 
 
 
583 aa  60.5  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  29.93 
 
 
141 aa  59.7  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0152  mutT/Nudix family protein  36.28 
 
 
150 aa  58.2  0.00000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 
315 aa  58.2  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3460  mutT/nudix family protein  28.36 
 
 
137 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284792  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3377  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  28.36 
 
 
137 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3732  mutT/nudix family protein  28.36 
 
 
137 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 
322 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3688  mutT/nudix family protein  28.36 
 
 
137 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.237209 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  30.14 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.79 
 
 
315 aa  56.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 
289 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3705  mutT/nudix family protein  28.79 
 
 
137 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0812  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 
140 aa  55.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00112519  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 
146 aa  55.5  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1264  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 
146 aa  54.7  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.879303 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 
299 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 
129 aa  54.7  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  28.47 
 
 
144 aa  54.3  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 
310 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  30 
 
 
311 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  30 
 
 
311 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  30 
 
 
311 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1993  NUDIX hydrolase  32.38 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 
536 aa  53.9  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  37.89 
 
 
424 aa  53.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 
302 aa  53.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  34.56 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 
139 aa  52.4  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  27.4 
 
 
140 aa  52.4  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  30.53 
 
 
156 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  34.65 
 
 
322 aa  50.8  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 
137 aa  50.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  29.85 
 
 
143 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1535  mutT/nudix family protein  26.52 
 
 
137 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0265399 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 
146 aa  50.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  26.95 
 
 
252 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 
140 aa  50.4  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 
139 aa  49.7  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  27.46 
 
 
136 aa  49.7  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 
168 aa  48.9  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  29.29 
 
 
149 aa  48.9  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2036  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 
228 aa  49.3  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5237  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
150 aa  48.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.598281  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0717  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 
168 aa  49.3  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  30.72 
 
 
324 aa  48.9  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 
301 aa  48.9  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  31.62 
 
 
141 aa  49.3  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  32.11 
 
 
144 aa  48.9  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  32.09 
 
 
325 aa  48.5  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  31.25 
 
 
292 aa  48.5  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>