More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0037 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 229 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1651  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 		 194 aa  94  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  35.76 
 
 		 208 aa  88.6  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  41.22 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  37.1 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  34.06 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  37.69 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  39.42 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  38.58 
 
 		 140 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 		 147 aa  67.8  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 		 143 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  32.86 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  32.86 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1155  hypothetical protein  32.31 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 		 216 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 158 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 140 aa  63.9  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  33.96 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  34.33 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1465  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.650531 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  37.86 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 129 aa  62  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2668  hypothetical protein  32.28 
 
 		 255 aa  62  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  31.88 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 		 144 aa  61.2  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  31.69 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  30.86 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  30.86 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  32.85 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  30.86 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  33.83 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  34.51 
 
 		 314 aa  58.5  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.86 
 
 		 315 aa  58.5  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 		 150 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  31.65 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 		 166 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0179  NUDIX hydrolase  27.48 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0431401  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  38.69 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  38.79 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 145 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  28.66 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 		 536 aa  55.5  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  21.26 
 
 		 583 aa  55.5  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  30.22 
 
 		 268 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 351 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  30.32 
 
 		 282 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 		 167 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 147 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 		 167 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 302 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 139 aa  53.5  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 		 146 aa  53.5  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 		 229 aa  53.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  28.78 
 
 		 143 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 154 aa  52.8  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 		 162 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 		 296 aa  52.8  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0685  NUDIX hydrolase  33.56 
 
 		 218 aa  53.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  36.72 
 
 		 325 aa  52.8  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  24.63 
 
 		 150 aa  52  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 		 153 aa  52  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  30.94 
 
 		 203 aa  52  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0812  NUDIX hydrolase  29.01 
 
 		 140 aa  51.2  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00112519  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  30.66 
 
 		 157 aa  51.6  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1131  NUDIX hydrolase  34.82 
 
 		 132 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0202346 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  28.23 
 
 		 139 aa  51.2  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  34.92 
 
 		 336 aa  51.6  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16970  predicted NTP pyrophosphohydrolase  33.81 
 
 		 154 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.542075  normal  0.366756 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  48.94 
 
 		 138 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 		 141 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  31.11 
 
 		 174 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  43.84 
 
 		 152 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  30.37 
 
 		 473 aa  50.4  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  34.27 
 
 		 301 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  41.41 
 
 		 167 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  54.39 
 
 		 341 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3404  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 		 174 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 158 aa  50.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>