241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1402 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  100 
 
 
148 aa  302  1.0000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  85.82 
 
 
144 aa  259  1e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  85.51 
 
 
142 aa  255  2e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  85.4 
 
 
141 aa  253  9e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  84.78 
 
 
140 aa  249  1e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  41.84 
 
 
143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  41.3 
 
 
140 aa  102  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 
146 aa  100  7e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  38.69 
 
 
139 aa  99.4  1e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  36.03 
 
 
139 aa  97.8  4e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2333  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
143 aa  89.7  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1993  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
142 aa  82  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0673  NUDIX hydrolase  37.3 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.51908 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  36.15 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.31 
 
 
583 aa  76.6  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  35.51 
 
 
577 aa  70.5  0.000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2356  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0392  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000292752 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2125  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 
158 aa  62.8  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
166 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 
216 aa  60.8  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  32.64 
 
 
142 aa  60.5  0.000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  31.85 
 
 
160 aa  60.1  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  38.82 
 
 
424 aa  58.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 
182 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  32.41 
 
 
203 aa  59.3  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  29.45 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  39.09 
 
 
248 aa  57  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 
270 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  46.88 
 
 
272 aa  57  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 
270 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 
270 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  40.22 
 
 
174 aa  55.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 
282 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  32.89 
 
 
169 aa  56.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 
164 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  32.86 
 
 
158 aa  55.1  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  43.84 
 
 
268 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  34.17 
 
 
258 aa  54.7  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 
151 aa  54.7  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  29.45 
 
 
322 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  35.87 
 
 
129 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2065  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  29.46 
 
 
156 aa  54.3  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  31.09 
 
 
182 aa  53.5  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  30.07 
 
 
174 aa  53.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  25.83 
 
 
206 aa  52.8  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 
219 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 
536 aa  52.8  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  41.86 
 
 
430 aa  52.8  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  35.53 
 
 
208 aa  52.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  31.2 
 
 
308 aa  52  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8348  hypothetical protein  35.19 
 
 
181 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  36.61 
 
 
301 aa  51.6  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  27.41 
 
 
149 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 
315 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 
166 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  27.52 
 
 
205 aa  51.2  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 
302 aa  50.8  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  25.34 
 
 
161 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2006  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  27.61 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 
341 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.53 
 
 
315 aa  48.9  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4630  NUDIX hydrolase  27.74 
 
 
158 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  30.33 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1415  NUDIX hydrolase  27.42 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  26.28 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 
302 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 
351 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5172  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 
177 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  50 
 
 
343 aa  48.5  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 
303 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2798  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.27 
 
 
167 aa  47.8  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.779042  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1334  NUDIX hydrolase  50 
 
 
161 aa  47.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0310402  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2635  hypothetical protein  31.45 
 
 
313 aa  47  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  46.81 
 
 
144 aa  47  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2031  NUDIX hydrolase  31.88 
 
 
141 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.717245 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1059  NUDIX hydrolase  40.7 
 
 
156 aa  47.4  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.891979  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.05 
 
 
135 aa  47  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 
303 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  30.7 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  28.89 
 
 
187 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 
147 aa  46.2  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  30.14 
 
 
187 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  34.83 
 
 
324 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  30.37 
 
 
187 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  28.77 
 
 
187 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  25.85 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0730  NUDIX hydrolase  26.19 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.189359  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 
289 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  29.8 
 
 
187 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0983  NUDIX hydrolase  27.48 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246298 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>