68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_5172 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_5172  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 177 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2666  NUDIX hydrolase  84.97 
 
 		 175 aa  310  5.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.271242  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1356  putative MutT/NUDIX family protein  52.33 
 
 		 173 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2946  NUDIX hydrolase  50.89 
 
 		 180 aa  185  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.908367  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2723  NUDIX hydrolase  50.28 
 
 		 178 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.346967  hitchhiker  0.000510454 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000745  MutT/nudix family protein  48.55 
 
 		 172 aa  179  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04903  hypothetical protein  46.82 
 
 		 172 aa  176  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1553  NUDIX hydrolase  46.02 
 
 		 176 aa  175  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000488772 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0536  MutT/nudix family protein  50.6 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1157  MutT/NUDIX family protein  44.19 
 
 		 180 aa  174  6e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1918  NUDIX hydrolase  50.56 
 
 		 177 aa  174  8e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1812  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  44.19 
 
 		 205 aa  173  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0463  NUDIX hydrolase  46.82 
 
 		 172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1878  NUDIX hydrolase  48.88 
 
 		 176 aa  170  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1933  NUDIX hydrolase  48.31 
 
 		 176 aa  169  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.39617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2100  NUDIX hydrolase  48.31 
 
 		 176 aa  168  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00137936  normal  0.649808 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2443  NUDIX hydrolase  47.46 
 
 		 176 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2327  NUDIX hydrolase  47.46 
 
 		 180 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2327  NUDIX hydrolase  47.46 
 
 		 176 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.345384  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2448  MutT/nudix family protein  48.31 
 
 		 176 aa  166  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2019  NUDIX hydrolase  47.46 
 
 		 180 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.172298  hitchhiker  0.00570807 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0906  NUDIX hydrolase  46.3 
 
 		 187 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0760  NUDIX hydrolase  48.7 
 
 		 182 aa  154  9e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0782  MutT/nudix family protein, putative  32.91 
 
 		 171 aa  92.4  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0794  NUDIX family hydrolase  32.28 
 
 		 171 aa  90.9  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147035  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2646  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 145 aa  49.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0278305  normal  0.974409 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 		 148 aa  48.5  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2869  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 145 aa  48.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.855553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1208  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 		 145 aa  48.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00522859  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 		 141 aa  48.1  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 		 144 aa  47.8  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 		 142 aa  47.8  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 303 aa  47.8  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3486  NUDIX hydrolase  27.45 
 
 		 150 aa  47.8  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2888  NUDIX hydrolase  29.08 
 
 		 147 aa  47.8  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2925  mutT/nudix family protein  27.01 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.38475e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2926  mutT/nudix family protein  31.52 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2718  mutT/nudix family protein  31.52 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2669  MutT/Nudix family protein  31.52 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277246  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2965  mutT/nudix family protein  28.26 
 
 		 164 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.223919  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 341 aa  45.1  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2346  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 		 157 aa  45.1  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1155  hypothetical protein  23.28 
 
 		 231 aa  43.5  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2293  NUDIX hydrolase  35.23 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.843226  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5162  isochorismatase hydrolase  35.82 
 
 		 203 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.24 
 
 		 315 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2646  MutT/Nudix family protein  29.47 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.785802  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3008  NUDIX hydrolase  32.67 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  48.84 
 
 		 314 aa  43.5  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0170  dinucleoside polyphosphate hydrolase  30.53 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0411  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.76 
 
 		 173 aa  42.4  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229765 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0072  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 		 147 aa  42  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1457  NUDIX family hydrolase  25.47 
 
 		 174 aa  42  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0054523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  29.87 
 
 		 140 aa  42.4  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22390  ADP-ribose pyrophosphatase  40.43 
 
 		 196 aa  42  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 195 aa  41.6  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  46.15 
 
 		 343 aa  41.6  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  39.62 
 
 		 292 aa  41.6  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 		 237 aa  41.6  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  28.7 
 
 		 151 aa  41.6  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 303 aa  41.6  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  35.53 
 
 		 164 aa  41.2  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  28.7 
 
 		 151 aa  41.6  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0901  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.5 
 
 		 164 aa  41.6  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0912  NUDIX hydrolase  28.71 
 
 		 146 aa  41.2  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1950  NUDIX hydrolase  43.1 
 
 		 255 aa  41.2  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666959  hitchhiker  0.00341622 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  45.24 
 
 		 325 aa  41.2  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03249  mutator mutT protein  35.19 
 
 		 127 aa  40.8  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>