134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0906 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0906  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 187 aa  390  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0760  NUDIX hydrolase  71.02 
 
 		 182 aa  276  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000745  MutT/nudix family protein  57.39 
 
 		 172 aa  217  7e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1553  NUDIX hydrolase  55.56 
 
 		 176 aa  217  8.999999999999998e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000488772 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04903  hypothetical protein  56.25 
 
 		 172 aa  213  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0463  NUDIX hydrolase  61.39 
 
 		 172 aa  211  7e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1356  putative MutT/NUDIX family protein  57.06 
 
 		 173 aa  210  7.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1812  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  55.14 
 
 		 205 aa  210  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2946  NUDIX hydrolase  57.95 
 
 		 180 aa  209  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.908367  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2723  NUDIX hydrolase  57.78 
 
 		 178 aa  206  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.346967  hitchhiker  0.000510454 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1157  MutT/NUDIX family protein  55.31 
 
 		 180 aa  204  7e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0536  MutT/nudix family protein  53.8 
 
 		 186 aa  189  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1918  NUDIX hydrolase  54.22 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1878  NUDIX hydrolase  53.99 
 
 		 176 aa  179  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2100  NUDIX hydrolase  53.99 
 
 		 176 aa  180  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00137936  normal  0.649808 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2448  MutT/nudix family protein  53.33 
 
 		 176 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2327  NUDIX hydrolase  53.94 
 
 		 180 aa  178  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2019  NUDIX hydrolase  55 
 
 		 180 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.172298  hitchhiker  0.00570807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2327  NUDIX hydrolase  54.37 
 
 		 176 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.345384  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2443  NUDIX hydrolase  54.37 
 
 		 176 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1933  NUDIX hydrolase  53.37 
 
 		 176 aa  176  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.39617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5172  NUDIX hydrolase  46.3 
 
 		 177 aa  154  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2666  NUDIX hydrolase  46.5 
 
 		 175 aa  147  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.271242  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0794  NUDIX family hydrolase  36.6 
 
 		 171 aa  98.2  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147035  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0782  MutT/nudix family protein, putative  35.95 
 
 		 171 aa  97.1  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1155  hypothetical protein  28.57 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 		 322 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0912  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 146 aa  50.4  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2611  mutT/nudix family protein  33.05 
 
 		 148 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000504287 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3228  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 122 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043036  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5139  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 122 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2699  mutT/nudix family protein  32.2 
 
 		 148 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  30.56 
 
 		 314 aa  48.5  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4799  nudix hydrolase  32.86 
 
 		 159 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2453  MutT/Nudix family protein  30.53 
 
 		 148 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0206727  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1208  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00522859  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1319  ADP-ribose pyrophosphatase  30 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0720149  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 166 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4022  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2742  mutT/nudix family protein  30.53 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000947125  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  45.24 
 
 		 325 aa  46.2  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2869  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.855553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 137 aa  46.2  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  30.67 
 
 		 153 aa  46.2  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0578  mutT/nudix family protein  26.16 
 
 		 153 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 		 136 aa  45.4  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  48.72 
 
 		 356 aa  45.8  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  48.78 
 
 		 303 aa  45.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 		 156 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1530  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 137 aa  45.1  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.249617  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2714  mutT/nudix family protein  30.08 
 
 		 148 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0283427  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 314 aa  45.1  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2646  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 145 aa  45.1  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0278305  normal  0.974409 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  43.64 
 
 		 317 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2463  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 148 aa  45.1  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.101073  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0596  mutT/nudix family protein  27.64 
 
 		 153 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000504952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2424  MutT/Nudix family protein  30.53 
 
 		 148 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.919203  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2691  mutT/nudix family protein  30.53 
 
 		 148 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000651612 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 		 156 aa  44.7  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 		 156 aa  44.7  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0454  MutT/NUDIX family protein  33.75 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000159368  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0494  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 		 146 aa  44.3  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  30.09 
 
 		 146 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3699  NUDIX hydrolase  40.82 
 
 		 152 aa  44.3  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224452  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  31.31 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0542  mutT/nudix family protein  33.75 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16009e-47 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5143  NUDIX hydrolase  30.58 
 
 		 122 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753323  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  43.18 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0511  mutT/nudix family protein  29.7 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0633443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  43.18 
 
 		 140 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2492  mutT/nudix family protein  29.77 
 
 		 148 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0450  MutT/NUDIX family protein  29.7 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290469  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  43.18 
 
 		 140 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0542  mutT/nudix family protein  29.7 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000238457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  43.18 
 
 		 140 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  29.68 
 
 		 299 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3076  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  42.22 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.41 
 
 		 315 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 		 237 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 		 146 aa  43.5  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 341 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3733  mutT/nudix family protein  44.68 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1584  mutT/nudix family protein  44.68 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0325451 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  48.72 
 
 		 140 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  42.03 
 
 		 160 aa  42.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  48.08 
 
 		 148 aa  43.1  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  26.8 
 
 		 216 aa  42.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3486  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 		 150 aa  42.7  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  52.38 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0457  NUDIX hydrolase  33.75 
 
 		 153 aa  42.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0641725  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  29 
 
 		 229 aa  42.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  43.18 
 
 		 140 aa  42.4  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  45.28 
 
 		 146 aa  42.4  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  40.91 
 
 		 336 aa  42.4  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 		 153 aa  42.4  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>