63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2666 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2666  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 175 aa  363  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.271242  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5172  NUDIX hydrolase  84.97 
 
 		 177 aa  310  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1356  putative MutT/NUDIX family protein  52.33 
 
 		 173 aa  191  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2946  NUDIX hydrolase  48.02 
 
 		 180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.908367  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2723  NUDIX hydrolase  48.04 
 
 		 178 aa  178  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.346967  hitchhiker  0.000510454 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000745  MutT/nudix family protein  46.82 
 
 		 172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1812  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  44 
 
 		 205 aa  171  3.9999999999999995e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04903  hypothetical protein  46.24 
 
 		 172 aa  169  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1157  MutT/NUDIX family protein  44.19 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0536  MutT/nudix family protein  48.19 
 
 		 186 aa  167  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1553  NUDIX hydrolase  45.66 
 
 		 176 aa  167  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000488772 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0463  NUDIX hydrolase  45.66 
 
 		 172 aa  167  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1878  NUDIX hydrolase  47.19 
 
 		 176 aa  163  9e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1933  NUDIX hydrolase  47.19 
 
 		 176 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.39617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2100  NUDIX hydrolase  46.63 
 
 		 176 aa  162  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00137936  normal  0.649808 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2448  MutT/nudix family protein  47.19 
 
 		 176 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2327  NUDIX hydrolase  46.33 
 
 		 180 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2327  NUDIX hydrolase  45.2 
 
 		 176 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.345384  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2443  NUDIX hydrolase  45.2 
 
 		 176 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2019  NUDIX hydrolase  46.33 
 
 		 180 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.172298  hitchhiker  0.00570807 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1918  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 		 177 aa  156  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0760  NUDIX hydrolase  47.4 
 
 		 182 aa  153  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0906  NUDIX hydrolase  46.5 
 
 		 187 aa  147  6e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0782  MutT/nudix family protein, putative  34.42 
 
 		 171 aa  94.7  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0794  NUDIX family hydrolase  33.77 
 
 		 171 aa  93.2  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147035  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2869  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 		 145 aa  51.6  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.855553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1208  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 145 aa  51.6  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00522859  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2646  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 145 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0278305  normal  0.974409 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2888  NUDIX hydrolase  29.92 
 
 		 147 aa  48.5  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1457  NUDIX family hydrolase  29.63 
 
 		 174 aa  48.1  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0054523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3486  NUDIX hydrolase  26.03 
 
 		 150 aa  47.4  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 303 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 151 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 151 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  46.67 
 
 		 343 aa  45.1  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1607  MutT/nudix family protein  32.65 
 
 		 174 aa  44.7  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.188927  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  28.41 
 
 		 148 aa  44.7  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  28.41 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0170  dinucleoside polyphosphate hydrolase  31.58 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  25.24 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 341 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  28.41 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0555  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00430973 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0494  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  28.41 
 
 		 142 aa  43.5  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2925  mutT/nudix family protein  30.34 
 
 		 164 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.38475e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2926  mutT/nudix family protein  30.34 
 
 		 164 aa  42  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2669  MutT/Nudix family protein  30.34 
 
 		 164 aa  42  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277246  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2718  mutT/nudix family protein  30.34 
 
 		 164 aa  42  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215744  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2965  mutT/nudix family protein  28.09 
 
 		 164 aa  42  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.223919  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0411  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29 
 
 		 173 aa  41.6  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229765 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 		 216 aa  42  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0582  dinucleoside polyphosphate hydrolase  25.47 
 
 		 134 aa  42  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 		 149 aa  41.6  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1950  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 		 255 aa  41.6  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666959  hitchhiker  0.00341622 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 		 151 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  29.52 
 
 		 172 aa  41.2  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2915  hypothetical protein  39.29 
 
 		 148 aa  41.2  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13474  normal  0.624718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 		 456 aa  40.8  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  37.18 
 
 		 200 aa  40.8  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 163 aa  40.8  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>