111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1457 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1457  NUDIX family hydrolase  100 
 
 		 174 aa  359  9e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0054523  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1607  MutT/nudix family protein  68.82 
 
 		 174 aa  256  1e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.188927  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 		 169 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0576  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 		 169 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2666  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 175 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.271242  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 		 164 aa  48.1  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  35.92 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  28.57 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1878  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2100  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00137936  normal  0.649808 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2537  NUDIX family hydrolase  38.75 
 
 		 146 aa  47.4  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1933  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.39617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  40.3 
 
 		 570 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  35.63 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1602  hypothetical protein  74.07 
 
 		 36 aa  46.6  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2424  MutT/Nudix family protein  34.83 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.919203  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 		 200 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  28.76 
 
 		 441 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1805  NUDIX hydrolase  28.76 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2691  mutT/nudix family protein  34.83 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000651612 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2492  mutT/nudix family protein  34.83 
 
 		 148 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802073  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  28.93 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  31.07 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  44.07 
 
 		 132 aa  45.8  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  31.96 
 
 		 141 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2453  MutT/Nudix family protein  34.83 
 
 		 148 aa  45.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0206727  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 138 aa  45.4  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2742  mutT/nudix family protein  34.83 
 
 		 148 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000947125  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2611  mutT/nudix family protein  34.83 
 
 		 148 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000504287 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0647  MutT/nudix family protein  32.28 
 
 		 152 aa  45.1  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2714  mutT/nudix family protein  34.83 
 
 		 148 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0283427  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2699  mutT/nudix family protein  33.71 
 
 		 148 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  43.1 
 
 		 130 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3925  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0241724  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  25.45 
 
 		 144 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3815  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0183  NUDIX hydrolase  34.41 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  36.76 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  32.18 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  36.76 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2117  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 		 237 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  27.37 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17541  A/G-specific DNA glycosylase  33.7 
 
 		 399 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  31.82 
 
 		 134 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  30.09 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  36.49 
 
 		 133 aa  43.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2925  mutT/nudix family protein  40.35 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.38475e-24 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01990  ADP-ribose pyrophosphatase  33.93 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  36.76 
 
 		 149 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2676  mutT/nudix family protein  43.64 
 
 		 136 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870264  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3008  NUDIX hydrolase  27.97 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  36.76 
 
 		 149 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  36.76 
 
 		 149 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  36.76 
 
 		 149 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2463  NUDIX hydrolase  34.83 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.101073  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 		 147 aa  42.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03840  ADP-ribose pyrophosphatase  31.31 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  28.71 
 
 		 179 aa  42  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  44 
 
 		 131 aa  42  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  28.45 
 
 		 128 aa  42  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2824  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 		 153 aa  42  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  28.45 
 
 		 128 aa  42  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  28.45 
 
 		 128 aa  42  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5172  NUDIX hydrolase  25.47 
 
 		 177 aa  42  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  29.9 
 
 		 456 aa  42  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  38.96 
 
 		 141 aa  42  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2718  mutT/nudix family protein  38.6 
 
 		 164 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2669  MutT/Nudix family protein  38.6 
 
 		 164 aa  41.6  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277246  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  47.27 
 
 		 312 aa  42  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2926  mutT/nudix family protein  38.6 
 
 		 164 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 157 aa  42  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  27.59 
 
 		 144 aa  41.6  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 138 aa  41.6  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  42.59 
 
 		 147 aa  41.6  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  28.28 
 
 		 129 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  28.28 
 
 		 129 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  30.34 
 
 		 149 aa  41.6  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2448  MutT/nudix family protein  29.73 
 
 		 176 aa  41.6  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2664  NUDIX hydrolase family protein  36.67 
 
 		 161 aa  41.6  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0475  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 		 152 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  38.33 
 
 		 134 aa  41.6  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0500  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 		 152 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 		 169 aa  41.6  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 		 137 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0487  MutT/nudix family protein  32.93 
 
 		 151 aa  41.2  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.450276  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  28.28 
 
 		 129 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 155 aa  41.2  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 		 137 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  36.84 
 
 		 135 aa  41.2  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 		 153 aa  41.2  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 		 171 aa  41.2  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>