More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2460 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 165 aa  334  3.9999999999999995e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  30.86 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1805  NUDIX hydrolase  31.48 
 
 		 174 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  30.54 
 
 		 441 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0576  NUDIX hydrolase  42.25 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  33.95 
 
 		 341 aa  61.6  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 456 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1607  MutT/nudix family protein  30.93 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.188927  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17470  ADP-ribose pyrophosphatase  46.38 
 
 		 205 aa  57.8  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.580494  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  33.99 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1987  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587721 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  33.11 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 179 aa  53.9  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2012  NUDIX hydrolase, MutT  36.13 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  31.2 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0722  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 		 146 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.421237  normal  0.366527 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1457  NUDIX family hydrolase  30 
 
 		 174 aa  53.5  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0054523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  39.78 
 
 		 134 aa  52.4  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2664  NUDIX hydrolase family protein  27.87 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  43.28 
 
 		 184 aa  51.6  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3480  NUDIX hydrolase  27.92 
 
 		 151 aa  51.6  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4049  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 		 169 aa  51.6  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3352  NUDIX hydrolase  28.1 
 
 		 170 aa  51.2  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 305 aa  50.8  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  31.97 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0234  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.425088  normal  0.397447 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3059  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446727  normal  0.591536 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  38.03 
 
 		 129 aa  49.7  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  34.32 
 
 		 340 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0684  dinucleoside polyphosphate hydrolase  31.07 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0609  dinucleoside polyphosphate hydrolase  31.07 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4799  nudix hydrolase  42.19 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2017  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.64 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00712308  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  28.19 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2915  hypothetical protein  43.66 
 
 		 148 aa  48.5  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13474  normal  0.624718 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1088  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.71 
 
 		 156 aa  48.5  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 		 120 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  26.35 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1372  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 		 172 aa  48.5  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241238  normal  0.0421052 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  46.15 
 
 		 320 aa  48.5  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 		 134 aa  48.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 		 146 aa  48.1  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2258  putative NUDIX hydrolase  43.08 
 
 		 173 aa  48.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 		 187 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3443  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 		 525 aa  47.8  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000281945  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4022  NUDIX hydrolase  43.06 
 
 		 153 aa  47.4  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  43.75 
 
 		 173 aa  47.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  46.15 
 
 		 320 aa  47.4  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  30.36 
 
 		 187 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4195  NUDIX hydrolase  46.03 
 
 		 162 aa  47.4  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.566986 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0396  NUDIX hydrolase  26.92 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000159718  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1905  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 377 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  30.84 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 		 140 aa  46.6  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  32.08 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  30.84 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2912  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3259  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1666  mutT/nudix family protein  38.36 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  hitchhiker  1.00436e-21 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3476  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  40.85 
 
 		 319 aa  46.6  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2278  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.369324  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3242  hypothetical protein  47.69 
 
 		 132 aa  45.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  40.3 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  27.85 
 
 		 327 aa  45.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2633  NUDIX hydrolase  29.32 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.748492  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0449  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.46 
 
 		 187 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0852291  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  44.07 
 
 		 133 aa  45.8  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0017  MutT/nudix family protein  36.92 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025421 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 187 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  42.86 
 
 		 317 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1648  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000051086  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  40.32 
 
 		 306 aa  45.1  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  38.03 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  46.55 
 
 		 318 aa  45.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1602  NUDIX hydrolase  43.06 
 
 		 151 aa  45.4  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973125  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2654  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 		 139 aa  45.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0730  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.189359  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3934  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3651  mutT/nudix family protein  35.62 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 167 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  40.3 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0794  NUDIX family hydrolase  41.94 
 
 		 171 aa  44.7  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147035  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 193 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.744983 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>