226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1987 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1987  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 204 aa  398  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587721 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  61.14 
 
 		 200 aa  192  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17470  ADP-ribose pyrophosphatase  58.38 
 
 		 205 aa  192  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.580494  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  53.11 
 
 		 184 aa  165  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1372  NUDIX hydrolase  49.7 
 
 		 172 aa  154  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241238  normal  0.0421052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3059  NUDIX hydrolase  47.98 
 
 		 174 aa  132  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446727  normal  0.591536 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  41.72 
 
 		 327 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 		 159 aa  102  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  43.57 
 
 		 340 aa  91.3  9e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 166 aa  88.6  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  41.83 
 
 		 341 aa  87.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  38.13 
 
 		 148 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  37.09 
 
 		 347 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12628  hypothetical protein  37.17 
 
 		 351 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4022  NUDIX hydrolase  40.76 
 
 		 153 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  39.49 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3833  NUDIX hydrolase  35.76 
 
 		 347 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604823  normal  0.0662029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  36.47 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4799  nudix hydrolase  33.11 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3529  hypothetical protein  39.13 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3815  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 		 151 aa  72  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 		 169 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1805  NUDIX hydrolase  35.22 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  32.19 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2912  NUDIX hydrolase  37.68 
 
 		 149 aa  64.3  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2448  NUDIX hydrolase  28.28 
 
 		 137 aa  64.3  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0479485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 456 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2247  NUDIX hydrolase  38.56 
 
 		 337 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2294  NUDIX hydrolase  38.56 
 
 		 337 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2286  NUDIX hydrolase  38.56 
 
 		 337 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3352  NUDIX hydrolase  28.76 
 
 		 170 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3480  NUDIX hydrolase  28.76 
 
 		 151 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4004  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 		 166 aa  61.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0598  NUDIX hydrolase  26.49 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  37.18 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0227  hypothetical protein  36.84 
 
 		 167 aa  52.8  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  49.21 
 
 		 137 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 		 137 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  32.81 
 
 		 146 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2509  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44.12 
 
 		 163 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.815631  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  38.06 
 
 		 169 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 		 137 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2971  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 		 153 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000073091  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3699  NUDIX hydrolase  32.97 
 
 		 152 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224452  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  46.58 
 
 		 165 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5260  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 152 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5005  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 152 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4834  MutT/Nudix family protein  33.33 
 
 		 152 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4849  MutT/Nudix family protein  33.33 
 
 		 152 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5385  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 152 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5682  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 152 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 		 155 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5317  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 152 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 		 155 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 		 155 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5275  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 152 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5241  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 152 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4949  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 152 aa  49.3  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.626782  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  40.96 
 
 		 137 aa  48.9  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2310  dinucleoside polyphosphate hydrolase  31.58 
 
 		 173 aa  48.9  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.905992 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2664  NUDIX hydrolase family protein  29.57 
 
 		 161 aa  48.5  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  49.23 
 
 		 167 aa  48.5  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1522  NUDIX hydrolase  46.88 
 
 		 137 aa  48.1  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.241436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 155 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 155 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 137 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2007  dinucleoside polyphosphate hydrolase  30.59 
 
 		 173 aa  47  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 		 146 aa  47.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0576  NUDIX hydrolase  23.81 
 
 		 141 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0396  NUDIX hydrolase  28.44 
 
 		 171 aa  47.4  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000159718  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5556  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 130 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  38.55 
 
 		 155 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  38 
 
 		 160 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  38.14 
 
 		 158 aa  46.6  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1043  NUDIX family hydrolase  31.58 
 
 		 159 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 		 143 aa  46.6  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2406  NUDIX hydrolase  28.87 
 
 		 148 aa  45.8  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2535  NUDIX hydrolase  27.07 
 
 		 140 aa  45.8  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.240977  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4221  NUDIX hydrolase  45.59 
 
 		 315 aa  45.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292609  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  31.72 
 
 		 156 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3752  NUDIX hydrolase  41.33 
 
 		 156 aa  45.8  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  39.77 
 
 		 160 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  39.77 
 
 		 160 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 299 aa  45.4  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 		 155 aa  45.4  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1228  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.85 
 
 		 174 aa  44.7  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000133704  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1261  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.85 
 
 		 174 aa  44.7  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000399476  normal  0.124645 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3129  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.85 
 
 		 174 aa  44.7  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000022986  normal  0.998128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3443  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 		 525 aa  45.1  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000281945  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1184  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.85 
 
 		 174 aa  44.7  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515571  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 		 197 aa  45.1  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0514  dinucleoside polyphosphate hydrolase  33.08 
 
 		 216 aa  44.7  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.561307 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0489  dinucleoside polyphosphate hydrolase  33.08 
 
 		 216 aa  44.7  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244879  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0586  dinucleoside polyphosphate hydrolase  33.08 
 
 		 214 aa  44.7  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0927743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>