78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2535 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2535  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 140 aa  288  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.240977  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2839  NUDIX hydrolase  90.71 
 
 		 140 aa  264  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00261887  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3633  NUDIX hydrolase  43.17 
 
 		 153 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0007  NUDIX hydrolase  42.75 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.768142  normal  0.930196 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2640  NUDIX hydrolase  40.58 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3750  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0938  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4467  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4745  mutT/nudix family protein  35.29 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.710264  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4771  mutT/nudix family protein  35.29 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4772  mutT/nudix family protein  35.29 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1483  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.084812  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4380  MutT/Nudix family protein  34.56 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0490  mutT/nudix family protein  34.56 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4534  mutT/nudix family protein  33.82 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1760  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.411853 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1482  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0123215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4887  mutT/nudix family protein  33.82 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4754  mutT/nudix family protein  33.09 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4370  MutT/Nudix family protein  33.87 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0858  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000460761 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2781  mutT/nudix family protein  30.71 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0324228  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2593  mutT/nudix family protein  30.71 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00926746  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2836  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927915  normal  0.666703 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2810  mutT/nudix family protein  31.62 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00396019  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2832  MutT/nudix family protein  29.71 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0990574  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0614  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 169 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287275  normal  0.48295 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3244  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0317  ADP-ribose pyrophosphatase  38.64 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  25.49 
 
 		 200 aa  51.2  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2790  phosphohydrolase  29.63 
 
 		 153 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  26.53 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3223  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 170 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3611  MutT/nudix family protein  29.46 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1319  ADP-ribose pyrophosphatase  36.14 
 
 		 148 aa  47.4  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0720149  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0073  MutT/nudix family protein  29.77 
 
 		 162 aa  47  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16380  ADP-ribose pyrophosphatase  29.6 
 
 		 158 aa  46.2  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2503  phosphohydrolase  27.74 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.792116 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1987  NUDIX hydrolase  27.07 
 
 		 204 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587721 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3074  mutT/nudix family protein  28.69 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3048  MutT/Nudix family protein  31.45 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2802  MutT/Nudix family protein  29.51 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187325  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3081  mutT/nudix family protein  29.27 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3056  mutT/nudix family protein  28.69 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 		 340 aa  44.7  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3518  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 170 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  35.23 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2037  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3612  MutT/nudix family protein  26.88 
 
 		 169 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.463705  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2765  MutT/Nudix family protein  34.07 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08300  NUDIX hydrolase  28.28 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  28.08 
 
 		 327 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2511  MutT/Nudix family protein  31.19 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343264  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  27.08 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 143 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  25.32 
 
 		 184 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  27.12 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1479  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 135 aa  41.2  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142432  hitchhiker  0.00620383 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1043  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1854  NUDIX hydrolase  27.61 
 
 		 163 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17470  ADP-ribose pyrophosphatase  26.62 
 
 		 205 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.580494  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2787  MutT/Nudix family protein  28.74 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0338674 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2611  mutT/nudix family protein  38.46 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000504287 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2202  phosphohydrolase  30.56 
 
 		 155 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.784536  hitchhiker  0.000000000000369619 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2545  MutT/Nudix family protein  29.36 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103897  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1888  mutT/nudix family protein  32.35 
 
 		 161 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0131213  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2431  NUDIX hydrolase  31.46 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960036  normal  0.286625 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2831  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 		 155 aa  40.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00779282  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  25.9 
 
 		 179 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1648  NUDIX hydrolase  23.81 
 
 		 172 aa  40.4  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000051086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4321  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 181 aa  40  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00183396  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2424  MutT/Nudix family protein  40 
 
 		 148 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.919203  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2691  mutT/nudix family protein  40 
 
 		 148 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000651612 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1805  NUDIX hydrolase  26.5 
 
 		 174 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2492  mutT/nudix family protein  40 
 
 		 148 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802073  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2699  mutT/nudix family protein  36.92 
 
 		 148 aa  40  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>