85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1760 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1760  NUDIX hydrolase  100 
 
 
151 aa  304  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.411853 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1482  NUDIX hydrolase  96.69 
 
 
151 aa  295  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0123215  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1483  NUDIX hydrolase  89.86 
 
 
148 aa  270  5.000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.084812  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0938  NUDIX hydrolase  64.08 
 
 
151 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244188  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0858  NUDIX hydrolase  50.74 
 
 
144 aa  118  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000460761 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4380  MutT/Nudix family protein  31.69 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4771  mutT/nudix family protein  33.1 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4534  mutT/nudix family protein  31.91 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4887  mutT/nudix family protein  31.91 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2839  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00261887  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4772  mutT/nudix family protein  32.39 
 
 
144 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4370  MutT/Nudix family protein  30.5 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0490  mutT/nudix family protein  30.5 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4467  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4745  mutT/nudix family protein  31.21 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.710264  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4754  mutT/nudix family protein  33.58 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2535  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.240977  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3633  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2640  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249433  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0007  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 
143 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.768142  normal  0.930196 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3750  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 
143 aa  52  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0317  ADP-ribose pyrophosphatase  27.64 
 
 
156 aa  51.2  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
157 aa  49.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  44.12 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2037  NUDIX hydrolase  28.04 
 
 
155 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0614  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 
169 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287275  normal  0.48295 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1319  ADP-ribose pyrophosphatase  29.41 
 
 
148 aa  48.1  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0720149  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3611  MutT/nudix family protein  25.83 
 
 
169 aa  47.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0234  NUDIX hydrolase  40.28 
 
 
163 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.425088  normal  0.397447 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2611  mutT/nudix family protein  41.67 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000504287 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2664  NUDIX hydrolase family protein  36.92 
 
 
161 aa  45.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472799  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2699  mutT/nudix family protein  40 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  45.76 
 
 
316 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2742  mutT/nudix family protein  45.61 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000947125  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2463  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.101073  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1593  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 
166 aa  45.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2714  mutT/nudix family protein  43.86 
 
 
148 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0283427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2453  MutT/Nudix family protein  45.61 
 
 
148 aa  44.7  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0206727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2202  phosphohydrolase  33.61 
 
 
155 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.784536  hitchhiker  0.000000000000369619 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  33.57 
 
 
163 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2492  mutT/nudix family protein  43.86 
 
 
148 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802073  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2691  mutT/nudix family protein  43.86 
 
 
148 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000651612 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2676  mutT/nudix family protein  43.86 
 
 
136 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870264  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2424  MutT/Nudix family protein  43.86 
 
 
148 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.919203  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 
169 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2289  NUDIX hydrolase  41.89 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3223  NUDIX hydrolase  30.59 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
170 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0073  MutT/nudix family protein  33.9 
 
 
162 aa  41.6  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  43.08 
 
 
153 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3518  NUDIX hydrolase  44 
 
 
170 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 
172 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0227  hypothetical protein  29.7 
 
 
167 aa  41.2  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2201  NUDIX hydrolase  39.77 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4321  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 
181 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00183396  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  50 
 
 
334 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  50 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  50 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2824  NUDIX hydrolase  50 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852185  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  50 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  50 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  50 
 
 
149 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 
151 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0431808 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  50 
 
 
149 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0500  NUDIX hydrolase  50 
 
 
152 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  50 
 
 
149 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0475  NUDIX hydrolase  50 
 
 
152 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  50 
 
 
149 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  50 
 
 
149 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  50 
 
 
149 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  50 
 
 
149 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2546  NUDIX family hydrolase  32.52 
 
 
141 aa  40.8  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2831  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 
155 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00779282  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3074  mutT/nudix family protein  31.13 
 
 
155 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2396  NUDIX family hydrolase  32.52 
 
 
141 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.64074  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02177  predicted NUDIX hydrolase  32.52 
 
 
141 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256653  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02136  hypothetical protein  32.52 
 
 
141 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.284783  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1398  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 
141 aa  40  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.708086  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  34.15 
 
 
314 aa  40  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  50 
 
 
147 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2765  MutT/Nudix family protein  33.7 
 
 
157 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1407  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 
141 aa  40  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>