70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3633 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3633  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 153 aa  311  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2640  NUDIX hydrolase  62.59 
 
 		 148 aa  188  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2839  NUDIX hydrolase  43.88 
 
 		 140 aa  115  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00261887  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2535  NUDIX hydrolase  43.17 
 
 		 140 aa  113  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.240977  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0007  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.768142  normal  0.930196 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3750  NUDIX hydrolase  30.66 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4745  mutT/nudix family protein  34.4 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.710264  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4467  NUDIX hydrolase  32.59 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0490  mutT/nudix family protein  35.56 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4887  mutT/nudix family protein  31.43 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4534  mutT/nudix family protein  31.43 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4380  MutT/Nudix family protein  29.08 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0938  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1482  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0123215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4754  mutT/nudix family protein  31.43 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4771  mutT/nudix family protein  32.59 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4772  mutT/nudix family protein  32.59 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4370  MutT/Nudix family protein  33.04 
 
 		 144 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1483  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.084812  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1760  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.411853 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0858  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000460761 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0317  ADP-ribose pyrophosphatase  36.84 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0073  MutT/nudix family protein  33.65 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2832  MutT/nudix family protein  25.83 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0990574  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2765  MutT/Nudix family protein  27.86 
 
 		 157 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2831  NUDIX hydrolase  32.97 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00779282  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3048  MutT/Nudix family protein  28.17 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2802  MutT/Nudix family protein  30.77 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187325  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2790  phosphohydrolase  29.07 
 
 		 153 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3081  mutT/nudix family protein  29.67 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2202  phosphohydrolase  30.49 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.784536  hitchhiker  0.000000000000369619 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2503  phosphohydrolase  29.55 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.792116 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3074  mutT/nudix family protein  30.68 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0614  NUDIX hydrolase  26.14 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287275  normal  0.48295 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3056  mutT/nudix family protein  33.9 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  29.01 
 
 		 200 aa  45.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5566  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.600891  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5931  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2511  MutT/Nudix family protein  39.29 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343264  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2810  mutT/nudix family protein  30.59 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00396019  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2037  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2699  mutT/nudix family protein  35.59 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4321  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00183396  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0246  NUDIX hydrolase  25.93 
 
 		 271 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2836  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927915  normal  0.666703 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  28.21 
 
 		 305 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2463  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 		 148 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.101073  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3518  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 		 170 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1987  NUDIX hydrolase  32.63 
 
 		 204 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587721 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2714  mutT/nudix family protein  30.63 
 
 		 148 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0283427  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3223  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 		 170 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2611  mutT/nudix family protein  33.9 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000504287 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1377  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.054711  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  41.27 
 
 		 173 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  31.73 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1264  NUDIX hydrolase  29.53 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.879303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4696  NUDIX hydrolase  28.1 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.67554  normal  0.0300067 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3044  mutT/nudix family protein  32.2 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2830  mutT/nudix family protein  32.2 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.582109  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3244  NUDIX hydrolase  31.52 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2664  NUDIX hydrolase family protein  36.14 
 
 		 161 aa  41.2  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472799  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2593  mutT/nudix family protein  25.66 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00926746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2781  mutT/nudix family protein  25.66 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0324228  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3611  MutT/nudix family protein  35.85 
 
 		 169 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  34 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2545  MutT/Nudix family protein  33.93 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>