More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_7095 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  100 
 
 
155 aa  316  7.999999999999999e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  53.19 
 
 
142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  47.55 
 
 
173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4567  NUDIX hydrolase  41.78 
 
 
158 aa  113  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.790014  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1264  NUDIX hydrolase  46.27 
 
 
146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.879303 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  50 
 
 
299 aa  99.8  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16380  ADP-ribose pyrophosphatase  40.8 
 
 
158 aa  97.8  5e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  42.24 
 
 
305 aa  86.3  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1537  NUDIX hydrolase  39.44 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.537681  normal  0.0457282 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0754  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 
282 aa  82.4  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00528415  hitchhiker  0.00425905 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4845  NUDIX hydrolase  37.41 
 
 
298 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  37.98 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3831  NUDIX hydrolase  40.83 
 
 
361 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.363079  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4221  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 
315 aa  72  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292609  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1680  hypothetical protein  36.55 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  34.82 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2810  mutT/nudix family protein  36.36 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0728884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  33.9 
 
 
229 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  40 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3133  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07700  NTP pyrophosphohydrolase  36.51 
 
 
241 aa  63.2  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.054443  normal  0.43952 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0149  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 
171 aa  63.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  35.11 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  35.11 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2524  MutT/nudix family protein  39.13 
 
 
99 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.921198  hitchhiker  0.00375744 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  35.11 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2763  mutT/nudix family protein  34.96 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000181576 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  35.11 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 
155 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  34.17 
 
 
153 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  32.77 
 
 
153 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  32.77 
 
 
153 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 
155 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2490  MutT/Nudix family protein  34.35 
 
 
145 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0847665  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15360  ADP-ribose pyrophosphatase  34.17 
 
 
152 aa  61.2  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314217  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 
153 aa  60.8  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  31.06 
 
 
143 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3121  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  36.94 
 
 
156 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  32.23 
 
 
153 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 
141 aa  60.5  0.000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2789  mutT/nudix family protein  31.4 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000364509  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2525  MutT/Nudix family protein  34.15 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000393058  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3830  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 
301 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  33.06 
 
 
212 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0673  NUDIX hydrolase  33.83 
 
 
158 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.612507  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  30.4 
 
 
236 aa  58.5  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2569  mutT/nudix family protein  31.4 
 
 
145 aa  58.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0391668  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2755  mutT/nudix family protein  31.4 
 
 
145 aa  58.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.801064  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 
137 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 
162 aa  57  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  37.39 
 
 
167 aa  57.4  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03840  ADP-ribose pyrophosphatase  33.06 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
154 aa  57  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4220  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 
304 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288399  normal  0.0172337 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2705  mutT/nudix family protein  28.95 
 
 
147 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3252  MutT/Nudix family protein  42.86 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000005811  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  29.46 
 
 
164 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3651  mutT/nudix family protein  28.46 
 
 
131 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3337  mutT/nudix family protein  41.94 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000625808  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  46.27 
 
 
155 aa  55.5  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3598  mutT/nudix family protein  41.94 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000783119  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5566  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.600891  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0381  ADP-ribose pyrophosphatase  37 
 
 
164 aa  55.1  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.225605  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5931  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  28 
 
 
141 aa  54.7  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  31.11 
 
 
230 aa  55.1  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
136 aa  55.1  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  27.5 
 
 
147 aa  55.1  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1385  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 
209 aa  54.7  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 
146 aa  55.1  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2664  NUDIX hydrolase family protein  40 
 
 
161 aa  54.7  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472799  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0494  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 
146 aa  55.1  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1666  mutT/nudix family protein  29.06 
 
 
132 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  hitchhiker  1.00436e-21 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3244  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 
158 aa  54.3  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3552  mutT/nudix family protein  41.27 
 
 
131 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6173699999999999e-43 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 
163 aa  54.7  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2457  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 
147 aa  54.3  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0350138  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2714  mutT/nudix family protein  27.4 
 
 
148 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0283427  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 
156 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2605  mutT/nudix family protein  28.07 
 
 
147 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000292929 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2406  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 
148 aa  53.9  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 
156 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2699  mutT/nudix family protein  42.42 
 
 
148 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0508  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 
157 aa  53.9  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0799439  hitchhiker  0.00145151 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3561  mutT/nudix family protein  41.38 
 
 
131 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000836995  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  37.07 
 
 
139 aa  53.9  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3557  mutT/nudix family protein  41.38 
 
 
131 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239001  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3971  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 
179 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 
184 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 
135 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  34.82 
 
 
473 aa  53.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>