More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0715 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 299 aa  581  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4845  NUDIX hydrolase  34.73 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  34.6 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3831  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 361 aa  112  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.363079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4221  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 315 aa  108  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292609  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0754  NUDIX hydrolase  44 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00528415  hitchhiker  0.00425905 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 155 aa  99.8  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4220  NUDIX hydrolase  32.53 
 
 		 304 aa  97.4  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288399  normal  0.0172337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3830  NUDIX hydrolase  30.54 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  44.27 
 
 		 173 aa  87  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  45.6 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1680  hypothetical protein  38.46 
 
 		 269 aa  75.1  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4567  NUDIX hydrolase  41.8 
 
 		 158 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.790014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07700  NTP pyrophosphohydrolase  40.48 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.054443  normal  0.43952 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1950  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 		 255 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666959  hitchhiker  0.00341622 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0697  MutT related protein  34.59 
 
 		 145 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  normal  0.361701 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 		 168 aa  62  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16380  ADP-ribose pyrophosphatase  34.65 
 
 		 158 aa  60.8  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2057  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 		 168 aa  60.5  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169928  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1463  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116619  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  34.62 
 
 		 139 aa  57.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  50.82 
 
 		 146 aa  58.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1264  NUDIX hydrolase  37.24 
 
 		 146 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.879303 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1648  NUDIX hydrolase  31.68 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000051086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1811  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 		 145 aa  57  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1556  NUDIX hydrolase  31.2 
 
 		 206 aa  57  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0717  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  33.63 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1195  MutT/nudix family protein  30.43 
 
 		 153 aa  55.5  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0912  NUDIX hydrolase  34.03 
 
 		 146 aa  55.5  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2546  NUDIX family hydrolase  32.77 
 
 		 141 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 153 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4302  dinucleoside polyphosphate hydrolase  30.86 
 
 		 175 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0490  NUDIX/MutT family protein  32.99 
 
 		 168 aa  54.3  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000225283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03840  ADP-ribose pyrophosphatase  34.09 
 
 		 155 aa  54.3  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  26.12 
 
 		 352 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  33.63 
 
 		 140 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2396  NUDIX family hydrolase  32.23 
 
 		 141 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.64074  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03438  MutT-nudix family protein  31.58 
 
 		 149 aa  53.9  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0659  mutT/nudix family protein  33.63 
 
 		 140 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  26.12 
 
 		 352 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  33.79 
 
 		 137 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  35.87 
 
 		 140 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0503  ADP-ribose pyrophosphatase  32.35 
 
 		 206 aa  53.5  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2447  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 129 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000652481  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02177  predicted NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 141 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256653  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1407  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 141 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  33.79 
 
 		 137 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02136  hypothetical protein  31.4 
 
 		 141 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.284783  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1398  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 141 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.708086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1522  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 		 137 aa  53.1  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.241436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 		 132 aa  53.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1799  NUDIX hydrolase  41.43 
 
 		 205 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000483875  normal  0.809218 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3887  dinucleoside polyphosphate hydrolase  42.86 
 
 		 177 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144161  normal  0.0314277 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.18 
 
 		 135 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 135 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  41.18 
 
 		 135 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.18 
 
 		 135 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2915  hypothetical protein  43.06 
 
 		 148 aa  52.8  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13474  normal  0.624718 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 		 146 aa  52.4  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1043  NUDIX family hydrolase  33.94 
 
 		 159 aa  52.4  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 		 265 aa  52.4  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  35.05 
 
 		 159 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.18 
 
 		 135 aa  52  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.71 
 
 		 135 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  45.21 
 
 		 153 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  31.97 
 
 		 158 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3252  MutT/Nudix family protein  37.65 
 
 		 129 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000005811  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2012  NUDIX hydrolase, MutT  41.89 
 
 		 158 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2289  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 132 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1657  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 		 132 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.809555  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.71 
 
 		 134 aa  52  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2201  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 132 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0722  NUDIX hydrolase  41.89 
 
 		 146 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.421237  normal  0.366527 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  38.78 
 
 		 164 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  43.66 
 
 		 154 aa  52  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2406  putative Nudix hydrolase family protein  35.19 
 
 		 149 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  27.66 
 
 		 229 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4211  dinucleoside polyphosphate hydrolase  45.28 
 
 		 177 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.165705 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2810  mutT/nudix family protein  30.16 
 
 		 145 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0728884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3337  mutT/nudix family protein  32.5 
 
 		 131 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000625808  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  35.65 
 
 		 158 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  35.65 
 
 		 158 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  32.86 
 
 		 132 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  32.86 
 
 		 132 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3598  mutT/nudix family protein  32.5 
 
 		 131 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000783119  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  35.65 
 
 		 158 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 		 156 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2037  NUDIX hydrolase  26.05 
 
 		 155 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13920  ADP-ribose pyrophosphatase  44.19 
 
 		 220 aa  51.6  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.625001  normal  0.785558 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  37.62 
 
 		 153 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 		 137 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5237  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 		 150 aa  50.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.598281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 		 158 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0561  dinucleoside polyphosphate hydrolase  46.67 
 
 		 169 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.655956 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  36.26 
 
 		 132 aa  50.8  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 155 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3552  mutT/nudix family protein  36.47 
 
 		 131 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6173699999999999e-43 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2672  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 158 aa  50.4  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0408434 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  33.63 
 
 		 140 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>