155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4220 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4220  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 304 aa  587  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288399  normal  0.0172337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3830  NUDIX hydrolase  72.33 
 
 		 301 aa  393  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  44.88 
 
 		 305 aa  228  8e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4221  NUDIX hydrolase  43.56 
 
 		 315 aa  226  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292609  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3831  NUDIX hydrolase  43.23 
 
 		 361 aa  221  8e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.363079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4845  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1950  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666959  hitchhiker  0.00341622 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1680  hypothetical protein  34.5 
 
 		 269 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  32.53 
 
 		 299 aa  97.4  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16380  ADP-ribose pyrophosphatase  39.53 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0754  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00528415  hitchhiker  0.00425905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 		 173 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4567  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 158 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.790014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07700  NTP pyrophosphohydrolase  34.62 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.054443  normal  0.43952 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 		 142 aa  54.7  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5155  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 222 aa  53.5  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  41.24 
 
 		 347 aa  52.8  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  44.29 
 
 		 161 aa  50.8  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  49.02 
 
 		 329 aa  50.8  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  49.02 
 
 		 329 aa  50.8  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 		 166 aa  50.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  33.91 
 
 		 141 aa  50.4  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4195  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 		 162 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.566986 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 160 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  41.43 
 
 		 153 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  45.31 
 
 		 170 aa  48.5  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.1 
 
 		 128 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.1 
 
 		 128 aa  48.5  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.1 
 
 		 128 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 		 149 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 		 149 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  47.69 
 
 		 151 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0347  (di)nucleoside polyphosphate hydrolase, putative  32.63 
 
 		 170 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.163328  normal  0.0864315 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  27.21 
 
 		 137 aa  47.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  46.55 
 
 		 135 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1537  NUDIX hydrolase  34.27 
 
 		 148 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.537681  normal  0.0457282 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 		 142 aa  47.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1170  NUDIX hydrolase  28.95 
 
 		 137 aa  47.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 		 155 aa  47.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  46.81 
 
 		 171 aa  47.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 143 aa  47  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  46.43 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 		 184 aa  46.6  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  45.61 
 
 		 138 aa  46.6  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  51.06 
 
 		 144 aa  46.6  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13920  ADP-ribose pyrophosphatase  31.82 
 
 		 220 aa  46.6  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.625001  normal  0.785558 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3686  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 		 151 aa  46.6  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  29.29 
 
 		 152 aa  46.2  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.78 
 
 		 134 aa  46.2  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  45.71 
 
 		 193 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  53.19 
 
 		 165 aa  46.2  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 		 200 aa  46.2  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 153 aa  46.2  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  47.76 
 
 		 315 aa  45.8  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0697  MutT related protein  37.5 
 
 		 145 aa  45.8  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  normal  0.361701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  31.48 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 		 136 aa  45.4  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.38 
 
 		 131 aa  45.8  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  51.06 
 
 		 132 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  46.81 
 
 		 136 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0762  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 148 aa  45.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  51.06 
 
 		 132 aa  45.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  51.06 
 
 		 132 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  51.06 
 
 		 132 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  34.15 
 
 		 139 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4874  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 162 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  31.48 
 
 		 314 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2965  mutT/nudix family protein  27.22 
 
 		 164 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.223919  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  42.37 
 
 		 138 aa  45.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  46.81 
 
 		 128 aa  45.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  47.06 
 
 		 142 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 151 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  48.84 
 
 		 164 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0799  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 148 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.428384 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  51.11 
 
 		 137 aa  45.1  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 		 136 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  29.63 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  42.37 
 
 		 138 aa  45.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  48.94 
 
 		 132 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0149  NUDIX hydrolase  29.92 
 
 		 171 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 		 172 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 156 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  41.27 
 
 		 318 aa  43.9  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  49.06 
 
 		 163 aa  43.9  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1264  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 146 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.879303 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 		 169 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.82 
 
 		 132 aa  43.9  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  47.06 
 
 		 137 aa  44.3  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  46.81 
 
 		 133 aa  43.9  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  49.02 
 
 		 149 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0998  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.57 
 
 		 154 aa  43.9  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.393526  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  34.83 
 
 		 161 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  31.48 
 
 		 314 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  52.08 
 
 		 138 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0870  mutator mutT protein  36.36 
 
 		 137 aa  43.5  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  46.81 
 
 		 137 aa  43.9  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  37.74 
 
 		 132 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  41.51 
 
 		 130 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0203  dinucleoside polyphosphate hydrolase  26.72 
 
 		 193 aa  43.5  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>