292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4874 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4874  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 162 aa  330  5e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4049  NUDIX hydrolase  80.25 
 
 		 169 aa  263  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4195  NUDIX hydrolase  78.4 
 
 		 162 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.566986 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3259  NUDIX hydrolase  77.22 
 
 		 168 aa  253  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  70.37 
 
 		 193 aa  236  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2258  putative NUDIX hydrolase  68.94 
 
 		 173 aa  234  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2633  NUDIX hydrolase  71.52 
 
 		 162 aa  230  5e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.748492  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  53.69 
 
 		 156 aa  159  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2186  NUDIX hydrolase  52.74 
 
 		 165 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3051  NUDIX hydrolase  51.68 
 
 		 154 aa  151  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2282  NUDIX hydrolase  48.7 
 
 		 163 aa  150  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725543  normal  0.213019 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1602  NUDIX hydrolase  48.97 
 
 		 151 aa  149  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973125  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1511  MutT/nudix family protein  49.66 
 
 		 151 aa  147  5e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1563  MutT/nudix family protein  49.66 
 
 		 151 aa  147  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.752749  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  48.37 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3784  NUDIX hydrolase  47.68 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2799  NUDIX hydrolase  46.9 
 
 		 159 aa  140  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3674  NUDIX hydrolase  47.02 
 
 		 175 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3063  NUDIX hydrolase  44.14 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3476  NUDIX hydrolase  46.36 
 
 		 175 aa  134  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0779  NUDIX hydrolase  45.86 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0032986  normal  0.0903569 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  50.38 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  48.48 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  46.21 
 
 		 156 aa  120  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3242  hypothetical protein  45.93 
 
 		 132 aa  117  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  36.84 
 
 		 160 aa  90.5  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3444  NUDIX hydrolase  37.12 
 
 		 179 aa  84.3  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.578568 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  32.59 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2655  NUDIX hydrolase  28.36 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  39.36 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4359  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  34.65 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  30 
 
 		 212 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  37.62 
 
 		 148 aa  51.6  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 		 230 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1510  NUDIX hydrolase  31.96 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  40.62 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  36.17 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  37.93 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1287  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0960276  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  36.17 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  36.17 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  37.08 
 
 		 147 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  37.08 
 
 		 147 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  37.08 
 
 		 147 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  37.08 
 
 		 137 aa  48.1  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5852  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 		 122 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  33.67 
 
 		 150 aa  47.8  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  27.94 
 
 		 155 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0515  ADP-ribose pyrophosphatase  29.63 
 
 		 168 aa  47.4  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1501  NUDIX hydrolase  51.11 
 
 		 102 aa  47.4  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0954993  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1033  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 		 542 aa  47  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0906744 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  37.08 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000745  MutT/nudix family protein  43.55 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4221  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 315 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292609  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  35.11 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  35.37 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  35.11 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  28.57 
 
 		 524 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  35.11 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  51.02 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  35.8 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  34 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3754  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  28.95 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0752  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 400 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  30.84 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0017  MutT/nudix family protein  29.77 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5350  NUDIX hydrolase  27.36 
 
 		 205 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.46762  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  37.8 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1553  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000488772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  28.04 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3209  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1102  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.142351  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  37.08 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  28.04 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1805  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 253 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  42.17 
 
 		 319 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 		 456 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  39.73 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  29.37 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  38.37 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4220  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 304 aa  45.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288399  normal  0.0172337 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  46.43 
 
 		 317 aa  45.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>