231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3784 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3784  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 158 aa  318  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3476  NUDIX hydrolase  95.57 
 
 		 175 aa  306  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3674  NUDIX hydrolase  85.44 
 
 		 175 aa  277  5e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  67.39 
 
 		 156 aa  190  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3051  NUDIX hydrolase  61.69 
 
 		 154 aa  181  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  59.21 
 
 		 156 aa  175  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2186  NUDIX hydrolase  55.32 
 
 		 165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4874  NUDIX hydrolase  47.68 
 
 		 162 aa  141  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2633  NUDIX hydrolase  51.08 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.748492  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4195  NUDIX hydrolase  48.34 
 
 		 162 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.566986 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  50.33 
 
 		 193 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3259  NUDIX hydrolase  49.01 
 
 		 168 aa  136  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2258  putative NUDIX hydrolase  50.36 
 
 		 173 aa  133  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1563  MutT/nudix family protein  49.65 
 
 		 151 aa  131  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.752749  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4049  NUDIX hydrolase  45.7 
 
 		 169 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1511  MutT/nudix family protein  49.65 
 
 		 151 aa  131  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1602  NUDIX hydrolase  50.35 
 
 		 151 aa  130  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973125  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3063  NUDIX hydrolase  44.03 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2799  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2282  NUDIX hydrolase  45.33 
 
 		 163 aa  120  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725543  normal  0.213019 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3242  hypothetical protein  47.41 
 
 		 132 aa  120  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  52.17 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  43.28 
 
 		 158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0779  NUDIX hydrolase  43.17 
 
 		 156 aa  101  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0032986  normal  0.0903569 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  44.62 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  38.06 
 
 		 160 aa  89  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3444  NUDIX hydrolase  41.04 
 
 		 179 aa  85.5  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.578568 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2655  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 		 188 aa  60.8  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 		 174 aa  60.5  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8438  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.370098 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  32.35 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2394  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 		 191 aa  53.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.772855 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0900  NUDIX hydrolase  32.11 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 155 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2547  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 		 142 aa  52.4  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  43 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  40 
 
 		 129 aa  50.4  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1472  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181973  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  32.54 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  40 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 		 120 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  34.48 
 
 		 473 aa  48.9  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1319  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 		 143 aa  48.5  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0515  ADP-ribose pyrophosphatase  31.48 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 		 185 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 		 185 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3076  NUDIX hydrolase  46.94 
 
 		 216 aa  47.8  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3063  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.253855  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0578  mutT/nudix family protein  29.2 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0149  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6153  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  41.67 
 
 		 255 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0784  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  36.36 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0685  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 218 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1287  NUDIX hydrolase  28.85 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0960276  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3121  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  54.76 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 194 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  30.7 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2195  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  32.38 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0946  ADP-ribose pyrophosphatase  30.36 
 
 		 207 aa  45.8  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000804497  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  26.85 
 
 		 229 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0450  MutT/NUDIX family protein  28.78 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290469  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0620  NUDIX hydrolase  28 
 
 		 282 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.253457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2270  NUDIX hydrolase  27.68 
 
 		 174 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.792713 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3328  NUDIX hydrolase  29.81 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0511  mutT/nudix family protein  28.67 
 
 		 164 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0633443  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  41.27 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0542  mutT/nudix family protein  28.67 
 
 		 164 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000238457  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0542  mutT/nudix family protein  28.78 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16009e-47 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0454  MutT/NUDIX family protein  29.29 
 
 		 153 aa  44.7  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000159368  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  31.96 
 
 		 289 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  28.93 
 
 		 158 aa  44.3  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  32.94 
 
 		 179 aa  44.3  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0457  NUDIX hydrolase  28.32 
 
 		 153 aa  44.3  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0641725  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1221  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 221 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  33.77 
 
 		 308 aa  43.9  0.0009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4359  NUDIX hydrolase  28.69 
 
 		 163 aa  43.9  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0508  NUDIX hydrolase  24.81 
 
 		 157 aa  43.9  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0799439  hitchhiker  0.00145151 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0523  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 187 aa  43.9  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.329737  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0988  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000252657  hitchhiker  0.00430366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>