More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5306 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 156 aa  311  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  79.49 
 
 		 156 aa  242  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3674  NUDIX hydrolase  65.79 
 
 		 175 aa  189  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3476  NUDIX hydrolase  60.53 
 
 		 175 aa  176  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3784  NUDIX hydrolase  59.21 
 
 		 158 aa  175  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3051  NUDIX hydrolase  62.24 
 
 		 154 aa  167  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2258  putative NUDIX hydrolase  49.36 
 
 		 173 aa  150  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  55.24 
 
 		 193 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4195  NUDIX hydrolase  51.01 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.566986 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4874  NUDIX hydrolase  48.37 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2186  NUDIX hydrolase  52.32 
 
 		 165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2633  NUDIX hydrolase  53.15 
 
 		 162 aa  143  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.748492  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4049  NUDIX hydrolase  54.42 
 
 		 169 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3063  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 158 aa  143  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2799  NUDIX hydrolase  49.33 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3259  NUDIX hydrolase  51.37 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1602  NUDIX hydrolase  51.39 
 
 		 151 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973125  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1563  MutT/nudix family protein  49.31 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.752749  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1511  MutT/nudix family protein  49.31 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2282  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725543  normal  0.213019 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3242  hypothetical protein  51.49 
 
 		 132 aa  125  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0779  NUDIX hydrolase  49.29 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0032986  normal  0.0903569 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  48.87 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  44.59 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  43.88 
 
 		 156 aa  97.4  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  33.83 
 
 		 160 aa  84.3  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3444  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.578568 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0900  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2547  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  44.78 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  53.57 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  29.05 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4018  NUDIX hydrolase  33.67 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0511  mutT/nudix family protein  31.97 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0633443  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0578  mutT/nudix family protein  33.96 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0450  MutT/NUDIX family protein  31.97 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290469  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3895  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0542  mutT/nudix family protein  31.97 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000238457  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2655  NUDIX hydrolase  32.88 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  51.61 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  50.98 
 
 		 169 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 		 145 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  37.37 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2278  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.369324  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0596  mutT/nudix family protein  33.02 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000504952  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3822  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 		 145 aa  51.2  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  40.66 
 
 		 160 aa  51.2  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  40.66 
 
 		 160 aa  51.2  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 135 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  48.89 
 
 		 230 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0457  NUDIX hydrolase  33.02 
 
 		 153 aa  50.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0641725  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0542  mutT/nudix family protein  32.38 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16009e-47 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0454  MutT/NUDIX family protein  32.38 
 
 		 153 aa  50.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000159368  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0229  putative MutT family protein  34.78 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  40.91 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0616  mutT/nudix family protein  30 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189637  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  48.44 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  32.58 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  44.64 
 
 		 131 aa  49.7  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  26.61 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4760  mutT/nudix family protein  33.96 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000960716  hitchhiker  5.01668e-23 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  49.02 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3378  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  39 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1132  NUDIX family hydrolase  32.58 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  32.94 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0464  MutT/nudix family protein  32.22 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  38.95 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2270  NUDIX hydrolase  66.67 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.792713 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1593  NUDIX hydrolase  46.81 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  38.37 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  38.37 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  32.22 
 
 		 135 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  32.22 
 
 		 135 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  48.89 
 
 		 218 aa  48.5  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  33.63 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  39.78 
 
 		 137 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 		 299 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0017  MutT/nudix family protein  40.23 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025421 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 340 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 140 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 		 169 aa  48.1  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3983  NUDIX hydrolase  52 
 
 		 161 aa  48.1  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1992  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 		 145 aa  48.1  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0853  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 		 130 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>