More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2221 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  100 
 
 
146 aa  290  6e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2633  NUDIX hydrolase  51.88 
 
 
162 aa  130  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.748492  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3259  NUDIX hydrolase  51.88 
 
 
168 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4874  NUDIX hydrolase  50.38 
 
 
162 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2282  NUDIX hydrolase  50 
 
 
163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725543  normal  0.213019 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3476  NUDIX hydrolase  52.9 
 
 
175 aa  122  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  50.38 
 
 
193 aa  120  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3784  NUDIX hydrolase  52.17 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4049  NUDIX hydrolase  47.79 
 
 
169 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2799  NUDIX hydrolase  44.52 
 
 
159 aa  117  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4195  NUDIX hydrolase  48.12 
 
 
162 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.566986 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  53.73 
 
 
156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3674  NUDIX hydrolase  48.92 
 
 
175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3063  NUDIX hydrolase  43.15 
 
 
158 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3242  hypothetical protein  47.01 
 
 
132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2258  putative NUDIX hydrolase  46.97 
 
 
173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  47.01 
 
 
156 aa  111  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  44.59 
 
 
156 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2186  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
165 aa  104  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3051  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
154 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1602  NUDIX hydrolase  43.38 
 
 
151 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973125  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1563  MutT/nudix family protein  42.22 
 
 
151 aa  100  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.752749  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1511  MutT/nudix family protein  42.22 
 
 
151 aa  100  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
158 aa  99  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  37.59 
 
 
160 aa  86.3  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0779  NUDIX hydrolase  40 
 
 
156 aa  85.5  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0032986  normal  0.0903569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  42.45 
 
 
174 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3444  NUDIX hydrolase  39.85 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.578568 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 
164 aa  61.6  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1510  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
157 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2655  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 
158 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  39.81 
 
 
153 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2595  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 
148 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  34.12 
 
 
158 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  40 
 
 
212 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0620  NUDIX hydrolase  34.56 
 
 
282 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.253457 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 
170 aa  57.4  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15110  NUDIX family protein  35.62 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  41.56 
 
 
156 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1805  NUDIX hydrolase  32.59 
 
 
253 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2394  NUDIX hydrolase  50 
 
 
191 aa  55.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.772855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  41.56 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6512  NUDIX hydrolase  38.76 
 
 
167 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.877846  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4226  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 
162 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2289  mutT/nudix family protein  30.08 
 
 
149 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2044  MutT/Nudix family protein  30.89 
 
 
149 aa  53.9  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00937843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2286  mutT/nudix family protein  30.89 
 
 
149 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02194e-25 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  30.7 
 
 
151 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  30.7 
 
 
151 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2371  mutT/nudix family protein  30.08 
 
 
149 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0511564  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 
150 aa  53.9  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3081  mutT/nudix family protein  30.08 
 
 
149 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000075135 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  32 
 
 
157 aa  53.5  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2105  mutT/nudix family protein  33.04 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2042  MutT/Nudix family protein  30.08 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  32.56 
 
 
159 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4077  mutT/nudix family protein  27.34 
 
 
185 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.811281  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3933  mutT/nudix family protein  27.48 
 
 
161 aa  52  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3766  MutT/Nudix family protein  27.34 
 
 
161 aa  52  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3781  MutT/Nudix family protein  27.34 
 
 
161 aa  52  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4044  mutT/nudix family protein  27.34 
 
 
149 aa  52  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4241  mutT/nudix family protein  27.48 
 
 
161 aa  52  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.602945  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4151  mutT/nudix family protein  27.34 
 
 
149 aa  52  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0315306  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  35.24 
 
 
166 aa  51.6  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  31.4 
 
 
158 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  33.6 
 
 
148 aa  51.2  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 
140 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  30 
 
 
155 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  35.64 
 
 
172 aa  50.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  34.82 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 
155 aa  50.4  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  32.21 
 
 
162 aa  50.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  46.03 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
171 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1108  mutT/nudix family protein  28.7 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.979518  normal  0.39926 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  38.39 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  37.33 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  28.7 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  28.7 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  38.05 
 
 
168 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0883  NUDIX hydrolase  46.48 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1823  NUDIX hydrolase  39.24 
 
 
143 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.24885  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 
184 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0752  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
400 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3464  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0508  NUDIX hydrolase  30 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0799439  hitchhiker  0.00145151 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  40 
 
 
155 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2639  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  40 
 
 
155 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>