193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2282 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2282  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 163 aa  333  7e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725543  normal  0.213019 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2799  NUDIX hydrolase  60 
 
 		 159 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3063  NUDIX hydrolase  58 
 
 		 158 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3242  hypothetical protein  60.9 
 
 		 132 aa  164  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4874  NUDIX hydrolase  48.7 
 
 		 162 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1602  NUDIX hydrolase  49.67 
 
 		 151 aa  147  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973125  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  52 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2186  NUDIX hydrolase  48.68 
 
 		 165 aa  144  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1563  MutT/nudix family protein  48.34 
 
 		 151 aa  143  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.752749  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  49.66 
 
 		 193 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1511  MutT/nudix family protein  48.34 
 
 		 151 aa  143  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4195  NUDIX hydrolase  51.09 
 
 		 162 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.566986 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2633  NUDIX hydrolase  46.9 
 
 		 162 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.748492  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3259  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 		 168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4049  NUDIX hydrolase  43.64 
 
 		 169 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2258  putative NUDIX hydrolase  48.61 
 
 		 173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3051  NUDIX hydrolase  47.97 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 		 156 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3476  NUDIX hydrolase  46 
 
 		 175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3674  NUDIX hydrolase  46.71 
 
 		 175 aa  124  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3784  NUDIX hydrolase  45.33 
 
 		 158 aa  120  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  44.7 
 
 		 158 aa  120  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  43.42 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0779  NUDIX hydrolase  43.42 
 
 		 156 aa  107  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0032986  normal  0.0903569 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  36.07 
 
 		 160 aa  86.3  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3444  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 179 aa  70.9  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.578568 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  34.42 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2885  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000755007  normal  0.649673 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0453  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2655  NUDIX hydrolase  31.72 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  36.73 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0508  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0799439  hitchhiker  0.00145151 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 		 137 aa  51.2  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 		 161 aa  51.2  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 		 155 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 		 156 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2394  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 191 aa  50.8  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.772855 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3370  MutT/nudix family protein  25.36 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.312506  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3754  NUDIX hydrolase  30.1 
 
 		 132 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3076  NUDIX hydrolase  26.12 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  30.23 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 		 218 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6512  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.877846  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1510  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3045  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  24.31 
 
 		 153 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3372  mutT/nudix family protein  24.31 
 
 		 153 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 		 160 aa  48.5  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 		 255 aa  48.1  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 		 153 aa  48.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0149  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 171 aa  48.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13920  ADP-ribose pyrophosphatase  33.9 
 
 		 220 aa  47.8  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.625001  normal  0.785558 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3137  mutT/nudix family protein  24.64 
 
 		 153 aa  47.8  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0554874  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 155 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 155 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 155 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6876  putative ATP/GTP-binding protein  32.63 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0214  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  27.73 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3352  phosphohydrolase  23.91 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4359  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1799  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 		 205 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000483875  normal  0.809218 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  29.01 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1029  NUDIX hydrolase  43.1 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1593  NUDIX hydrolase  32.05 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  32.95 
 
 		 184 aa  45.4  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  46.15 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0631  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 		 144 aa  45.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  40 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3374  MutT/nudix family protein  25.56 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00196022  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5852  NUDIX hydrolase  35.35 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2756  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  41.82 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  40.21 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  31.68 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  30.99 
 
 		 181 aa  45.1  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0234  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 		 163 aa  45.1  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.425088  normal  0.397447 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  30.61 
 
 		 164 aa  45.1  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  31.68 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3567  hypothetical protein  30.88 
 
 		 181 aa  44.3  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.76977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1851  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  44 
 
 		 362 aa  44.3  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289338 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>