More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1029 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1029  NUDIX hydrolase  100 
 
 
127 aa  248  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3701  NUDIX hydrolase  53.62 
 
 
144 aa  135  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.899383  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  43.38 
 
 
149 aa  96.7  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  43.38 
 
 
155 aa  93.6  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0631  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
144 aa  90.5  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  42.34 
 
 
142 aa  87  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0473  protein of unknown function DUF1152  39.39 
 
 
530 aa  83.2  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0589  NUDIX hydrolase  38.97 
 
 
141 aa  73.9  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000226266  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  42.86 
 
 
148 aa  58.9  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 
153 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1778  NUDIX hydrolase  41.43 
 
 
126 aa  54.7  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  50 
 
 
160 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  51.11 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  50.98 
 
 
169 aa  52.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  52 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0099  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  34.83 
 
 
396 aa  51.6  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0722569  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  44.93 
 
 
314 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4359  NUDIX hydrolase  49.02 
 
 
163 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  40 
 
 
314 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  48 
 
 
155 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  48.44 
 
 
161 aa  51.2  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1033  NUDIX hydrolase  39.44 
 
 
542 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0906744 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  40 
 
 
314 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  39.36 
 
 
314 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  48 
 
 
155 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  48 
 
 
155 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  48 
 
 
155 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  48 
 
 
155 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  48 
 
 
155 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  33.33 
 
 
363 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  34.34 
 
 
158 aa  50.8  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0866  NUDIX hydrolase  50 
 
 
274 aa  50.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0186051  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  48 
 
 
156 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  47.17 
 
 
181 aa  50.4  0.000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  42.65 
 
 
316 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  44 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  36 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  45.65 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0515  ADP-ribose pyrophosphatase  30.49 
 
 
168 aa  50.1  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  39.77 
 
 
157 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  44 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  50.85 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  42.65 
 
 
316 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  43.18 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2595  NUDIX hydrolase  59.52 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  40.32 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  43.18 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  51.85 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  51.22 
 
 
183 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  50.94 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  48.78 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  40.74 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1593  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 
166 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  46.34 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0784  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
155 aa  48.9  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  37.86 
 
 
570 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0697  MutT related protein  43.1 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  normal  0.361701 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  48.78 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  42.37 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  42.37 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3063  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 
158 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  44 
 
 
158 aa  48.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3137  mutT/nudix family protein  44 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0554874  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  45.28 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  44.64 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  40.91 
 
 
140 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  40.91 
 
 
140 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3374  MutT/nudix family protein  44 
 
 
149 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00196022  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  40.4 
 
 
312 aa  48.1  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  40.91 
 
 
140 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  31 
 
 
360 aa  47.8  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4195  NUDIX hydrolase  55 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.566986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  50 
 
 
157 aa  47.8  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
136 aa  47.4  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2971  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 
153 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000073091  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  38.46 
 
 
524 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3370  MutT/nudix family protein  44 
 
 
149 aa  47  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.312506  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  37.62 
 
 
149 aa  47  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1921  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 
133 aa  47  0.00009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.11755  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3150  phosphohydrolase  44 
 
 
108 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.696001  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3352  phosphohydrolase  46 
 
 
148 aa  47  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2885  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 
175 aa  47  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000755007  normal  0.649673 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 
132 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
158 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  42.31 
 
 
147 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2044  MutT/Nudix family protein  40.74 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00937843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2286  mutT/nudix family protein  40.74 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02194e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3076  NUDIX hydrolase  44 
 
 
149 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2042  MutT/Nudix family protein  42.59 
 
 
149 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  37.31 
 
 
162 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3733  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  47.37 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0829824  normal  0.0242018 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3081  mutT/nudix family protein  42.59 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000075135 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3309  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  42.31 
 
 
147 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2282  NUDIX hydrolase  43.1 
 
 
163 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725543  normal  0.213019 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>