More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0589 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0589  NUDIX hydrolase  100 
 
 
141 aa  285  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000226266  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  51.09 
 
 
155 aa  141  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0631  NUDIX hydrolase  53.68 
 
 
144 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  45.77 
 
 
149 aa  130  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0473  protein of unknown function DUF1152  47.52 
 
 
530 aa  128  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3701  NUDIX hydrolase  48.18 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.899383  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  48.59 
 
 
142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1501  NUDIX hydrolase  39.36 
 
 
102 aa  75.9  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0954993  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1029  NUDIX hydrolase  38.97 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  37.84 
 
 
181 aa  72  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  32.61 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  32.82 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  31.39 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  35.14 
 
 
158 aa  63.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 
155 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 
265 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0219  NUDIX hydrolase  34.56 
 
 
158 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203556  normal  0.450694 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2976  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
162 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 
156 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0682  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0132833  normal  0.0334373 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1799  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 
205 aa  61.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000483875  normal  0.809218 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4760  mutT/nudix family protein  34.59 
 
 
153 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000960716  hitchhiker  5.01668e-23 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1980  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
209 aa  61.2  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.280065 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1178  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 
156 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0049447  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1561  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 
149 aa  60.8  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00297198  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0457  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 
153 aa  60.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0641725  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1249  NUDIX hydrolase  34.58 
 
 
156 aa  60.1  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000159356 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1679  NUDIX hydrolase  35.24 
 
 
163 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.164244  normal  0.63188 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 
184 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2631  MutT/nudix family protein  32.85 
 
 
158 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  40.62 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  33.33 
 
 
163 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3541  NUDIX hydrolase  38.84 
 
 
138 aa  58.9  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0450  MutT/NUDIX family protein  30.66 
 
 
164 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290469  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0967  hydrolase, NUDIX family  44.07 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00369926  normal  0.920839 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0415  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 
154 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0616  mutT/nudix family protein  30.37 
 
 
169 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189637  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0596  mutT/nudix family protein  30.37 
 
 
153 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000504952  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0454  MutT/NUDIX family protein  29.93 
 
 
153 aa  57.4  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000159368  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1604  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 
163 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00941783  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0511  mutT/nudix family protein  29.93 
 
 
164 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0633443  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0542  mutT/nudix family protein  29.93 
 
 
164 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000238457  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5571  NUDIX hydrolase  39.85 
 
 
156 aa  57  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0243609  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  29.71 
 
 
152 aa  57  0.00000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0542  mutT/nudix family protein  29.93 
 
 
153 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16009e-47 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 
160 aa  57  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4267  hydrolase, NUDIX family  42.37 
 
 
154 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.555582  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  30.65 
 
 
153 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1505  MutT/nudix family protein  36.36 
 
 
158 aa  56.2  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000663569  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 
155 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  36.04 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  34.48 
 
 
163 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  32 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0578  mutT/nudix family protein  33.08 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2704  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
158 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0109153 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1536  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 
205 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.058172  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1748  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 
163 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2116  mutT/nudix family protein  31.78 
 
 
205 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.610477  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  29.84 
 
 
153 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  29.84 
 
 
153 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3909  MutT/Nudix family protein  42.37 
 
 
154 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0016299  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  31.15 
 
 
170 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  29.84 
 
 
153 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  30.84 
 
 
156 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  29.84 
 
 
153 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 
229 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  27.97 
 
 
154 aa  54.7  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  28.23 
 
 
160 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  29.84 
 
 
153 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 
154 aa  55.1  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  29.84 
 
 
153 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 
146 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13920  ADP-ribose pyrophosphatase  32.81 
 
 
220 aa  54.7  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.625001  normal  0.785558 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 
155 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4287  hydrolase, NUDIX family  42.37 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000426319  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15360  ADP-ribose pyrophosphatase  32.11 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314217  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 
155 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 
155 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  33.07 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  28.7 
 
 
212 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2148  mutT/nudix family protein  31.78 
 
 
205 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.992633  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2037  mutT/nudix family protein  32.32 
 
 
205 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  40.68 
 
 
156 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2802  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 
159 aa  54.3  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.44267  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  30.84 
 
 
156 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 
157 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1309  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 
122 aa  53.9  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 
194 aa  53.9  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4229  mutT/nudix family protein  40.68 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000345145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3901  MutT/Nudix family protein  40.68 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267829  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  29.32 
 
 
352 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0508  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 
157 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0799439  hitchhiker  0.00145151 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  29.55 
 
 
363 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4178  hydrolase, NUDIX family  40.68 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0036026 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1863  MutT/NUDIX family hydrolase  31.63 
 
 
205 aa  52  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>