More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3541 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3541  NUDIX hydrolase  100 
 
 
138 aa  284  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  72.22 
 
 
164 aa  192  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1282  NUDIX hydrolase  57.6 
 
 
136 aa  147  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.838379  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3754  NUDIX hydrolase  46.22 
 
 
132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3429  NUDIX hydrolase  45.69 
 
 
129 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5143  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753323  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3228  NUDIX hydrolase  38.84 
 
 
122 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043036  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5139  NUDIX hydrolase  38.84 
 
 
122 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 
136 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  35.38 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0589  NUDIX hydrolase  38.84 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000226266  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1689  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1259  hypothetical protein  29.23 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1170  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 
137 aa  52  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  26.96 
 
 
164 aa  51.6  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2490  MutT/Nudix family protein  29.63 
 
 
145 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0847665  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0415  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 
154 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 
136 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  38.82 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1980  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 
209 aa  50.8  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.280065 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0870  mutator mutT protein  33.72 
 
 
137 aa  50.1  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  47.73 
 
 
139 aa  49.7  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1501  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 
102 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0954993  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  36.47 
 
 
155 aa  49.7  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2037  NUDIX hydrolase  35.53 
 
 
155 aa  48.9  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 
324 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  40 
 
 
173 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  39.44 
 
 
153 aa  48.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  29.92 
 
 
473 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0450  MutT/NUDIX family protein  31.19 
 
 
164 aa  48.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290469  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2763  mutT/nudix family protein  29.63 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000181576 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1536  NUDIX hydrolase  24.63 
 
 
205 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.058172  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 
166 aa  48.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1561  NUDIX hydrolase  27.93 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00297198  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1799  NUDIX hydrolase  27.69 
 
 
205 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000483875  normal  0.809218 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0457  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 
153 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0641725  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  28.09 
 
 
171 aa  47.8  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3528  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.321169  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  30.56 
 
 
143 aa  47.8  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3272  mutT/nudix family protein  23.7 
 
 
205 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  30.61 
 
 
154 aa  47.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
135 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
135 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
141 aa  47.4  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  26.61 
 
 
190 aa  47.4  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  24.62 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  32 
 
 
134 aa  47.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2037  mutT/nudix family protein  23.7 
 
 
205 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1900  mutT/nudix family protein  24.81 
 
 
205 aa  47.4  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0454  MutT/NUDIX family protein  30.28 
 
 
153 aa  47  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000159368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2047  mutT/nudix family protein  24.81 
 
 
205 aa  47.4  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1138  NUDIX hydrolase  26.92 
 
 
140 aa  47  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
132 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2116  mutT/nudix family protein  24.81 
 
 
205 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.610477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0542  mutT/nudix family protein  30.28 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16009e-47 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1195  MutT/nudix family protein  38.33 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  45.45 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0511  mutT/nudix family protein  30.28 
 
 
164 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0633443  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  26.96 
 
 
171 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2569  mutT/nudix family protein  27.78 
 
 
145 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0391668  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0631  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3111  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
163 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0922721  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1853  MutT/NUDIX family hydrolase  24.81 
 
 
205 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.252059  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0542  mutT/nudix family protein  30.28 
 
 
164 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000238457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2755  mutT/nudix family protein  27.78 
 
 
145 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.801064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2079  mutT/nudix family protein  24.81 
 
 
205 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  30.23 
 
 
396 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  29.57 
 
 
140 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2810  mutT/nudix family protein  27.78 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0728884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2148  mutT/nudix family protein  24.81 
 
 
205 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.992633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1863  MutT/NUDIX family hydrolase  24.03 
 
 
205 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  32.38 
 
 
178 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2447  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000652481  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  30.86 
 
 
131 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
229 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  29.57 
 
 
140 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 
142 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 
179 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3008  NUDIX hydrolase  38.75 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4804  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 
188 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.483514 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2525  MutT/Nudix family protein  28.7 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000393058  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  31.11 
 
 
128 aa  45.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  33.06 
 
 
365 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 
157 aa  45.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2554  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 
160 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  25.22 
 
 
177 aa  45.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0685  NUDIX hydrolase  30.09 
 
 
218 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01990  ADP-ribose pyrophosphatase  35.51 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1385  NUDIX hydrolase  31.08 
 
 
209 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0596  mutT/nudix family protein  29.36 
 
 
153 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000504952  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2802  MutT/Nudix family protein  35.71 
 
 
157 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>