240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3008 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3008  NUDIX hydrolase  100 
 
 
149 aa  300  4.0000000000000003e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3873  NUDIX hydrolase  37.24 
 
 
147 aa  100  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.666215  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5237  NUDIX hydrolase  40.94 
 
 
150 aa  95.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.598281  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0912  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.51 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.14 
 
 
135 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.14 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  32.14 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.14 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.85 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.14 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0852  putative hydrolase  34.55 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.696744 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1760  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
134 aa  54.7  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2259  NUDIX hydrolase  31.73 
 
 
157 aa  54.7  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.14 
 
 
135 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.91 
 
 
138 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2664  NUDIX hydrolase family protein  27.64 
 
 
161 aa  52  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472799  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.91 
 
 
138 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.91 
 
 
138 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  35.85 
 
 
399 aa  51.2  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2714  mutT/nudix family protein  27.78 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0283427  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.3 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.3 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.3 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.04 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.04 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2463  NUDIX hydrolase  26.61 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.101073  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 
164 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0596  mutT/nudix family protein  29.31 
 
 
153 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000504952  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  33.98 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1265  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2611  mutT/nudix family protein  29.91 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000504287 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2699  mutT/nudix family protein  29.36 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1463  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
165 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116619  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2492  mutT/nudix family protein  27.27 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2453  MutT/Nudix family protein  26.36 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0206727  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2424  MutT/Nudix family protein  27.27 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.919203  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6013  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 
166 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2691  mutT/nudix family protein  27.27 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000651612 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1106  NUDIX hydrolase  40 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00400603  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2704  NUDIX hydrolase  33.02 
 
 
158 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0109153 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2742  mutT/nudix family protein  26.36 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000947125  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2676  mutT/nudix family protein  27.27 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870264  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 
340 aa  47.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2718  mutT/nudix family protein  48.98 
 
 
164 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2669  MutT/Nudix family protein  48.98 
 
 
164 aa  47.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277246  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0450  MutT/NUDIX family protein  28 
 
 
164 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290469  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2926  mutT/nudix family protein  48.98 
 
 
164 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  30 
 
 
473 aa  47.4  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0631  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
144 aa  47  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3328  NUDIX hydrolase  30.1 
 
 
160 aa  47  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672481  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1561  NUDIX hydrolase  31.68 
 
 
149 aa  47  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00297198  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1718  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
142 aa  47  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  34.21 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0454  MutT/NUDIX family protein  27.2 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000159368  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2925  mutT/nudix family protein  46.94 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.38475e-24 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  29.75 
 
 
169 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0542  mutT/nudix family protein  27.2 
 
 
153 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16009e-47 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3541  NUDIX hydrolase  38.75 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0511  mutT/nudix family protein  27.2 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0633443  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  35.24 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0542  mutT/nudix family protein  27.2 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000238457  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00222  NADH pyrophosphatase  30.6 
 
 
269 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0463  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 
172 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1356  putative MutT/NUDIX family protein  31.9 
 
 
173 aa  45.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0690  NUDIX hydrolase  28 
 
 
159 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.093357  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1195  MutT/nudix family protein  34.31 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  30 
 
 
321 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.14 
 
 
360 aa  45.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 
162 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2521  NUDIX hydrolase  32 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28701  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4760  mutT/nudix family protein  28.45 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000960716  hitchhiker  5.01668e-23 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2559  NUDIX hydrolase  25.2 
 
 
154 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.340623 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0234  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 
163 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.425088  normal  0.397447 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.25 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 
137 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  31.71 
 
 
147 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  31.71 
 
 
147 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  39.74 
 
 
154 aa  45.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1282  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 
136 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.838379  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  31.71 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2544  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 
165 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 
141 aa  44.7  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2547  NUDIX hydrolase  33.98 
 
 
143 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  35.63 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  38.82 
 
 
139 aa  44.7  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3830  NUDIX hydrolase  28.69 
 
 
301 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3733  mutT/nudix family protein  31.96 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412613  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1639  MutT/NUDIX family NTP pyrophosphohydrolase  29.7 
 
 
151 aa  44.3  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  28.18 
 
 
138 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0589  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000226266  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  31.46 
 
 
128 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4370  MutT/Nudix family protein  32.79 
 
 
144 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67120  hypothetical protein  31.08 
 
 
158 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4321  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
181 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00183396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>