More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1282 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1282  NUDIX hydrolase  100 
 
 
136 aa  280  5.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.838379  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  62.2 
 
 
164 aa  160  5.0000000000000005e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3541  NUDIX hydrolase  57.6 
 
 
138 aa  147  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3754  NUDIX hydrolase  52.03 
 
 
132 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3429  NUDIX hydrolase  51.69 
 
 
129 aa  117  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5143  NUDIX hydrolase  35 
 
 
122 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753323  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3228  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 
122 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043036  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5139  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 
122 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  39.13 
 
 
146 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1863  MutT/NUDIX family hydrolase  29.23 
 
 
205 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2079  mutT/nudix family protein  30 
 
 
205 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 
135 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1853  MutT/NUDIX family hydrolase  30 
 
 
205 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.252059  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  31.34 
 
 
396 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0464  MutT/nudix family protein  40.45 
 
 
135 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3272  mutT/nudix family protein  29.23 
 
 
205 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1900  mutT/nudix family protein  29.23 
 
 
205 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2047  mutT/nudix family protein  29.23 
 
 
205 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2037  mutT/nudix family protein  29.23 
 
 
205 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1259  hypothetical protein  35.35 
 
 
153 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0794  NUDIX family hydrolase  40.74 
 
 
171 aa  53.9  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147035  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  40.79 
 
 
138 aa  53.9  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0782  MutT/nudix family protein, putative  40.74 
 
 
171 aa  53.9  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1897  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 
205 aa  53.5  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.018697  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0870  mutator mutT protein  30.11 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0924  NUDIX hydrolase  28.43 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2116  mutT/nudix family protein  29.23 
 
 
205 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.610477  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2148  mutT/nudix family protein  29.23 
 
 
205 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.992633  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  34.56 
 
 
365 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  33.33 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
142 aa  52  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2763  mutT/nudix family protein  31.13 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000181576 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1689  NUDIX hydrolase  35.35 
 
 
140 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1170  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
137 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0179  NUDIX hydrolase  52.27 
 
 
137 aa  52  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0431401  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2654  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 
139 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2490  MutT/Nudix family protein  30.19 
 
 
145 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0847665  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3111  NUDIX hydrolase  50 
 
 
163 aa  51.6  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0922721  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2080  NUDIX hydrolase  52.27 
 
 
190 aa  51.6  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.397171  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2569  mutT/nudix family protein  31.13 
 
 
145 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0391668  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  35.16 
 
 
146 aa  50.4  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2755  mutT/nudix family protein  31.13 
 
 
145 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.801064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2810  mutT/nudix family protein  30.19 
 
 
145 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0728884  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 
134 aa  50.4  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0830  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 
291 aa  50.4  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3733  mutT/nudix family protein  41.67 
 
 
147 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412613  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2789  mutT/nudix family protein  30.36 
 
 
145 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000364509  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  29.93 
 
 
163 aa  50.4  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1536  NUDIX hydrolase  26.92 
 
 
205 aa  50.4  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.058172  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  54.76 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  43.33 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  34.82 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  43.33 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3309  NUDIX hydrolase  30 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  43.33 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1584  mutT/nudix family protein  41.67 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0325451 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1980  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 
209 aa  48.9  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.280065 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  30.3 
 
 
153 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2525  MutT/Nudix family protein  30.19 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000393058  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  35.63 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  49.12 
 
 
143 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3822  NUDIX hydrolase  34.82 
 
 
145 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  30.23 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3377  MutT/Nudix family protein  43.33 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  30.3 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  43.1 
 
 
373 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  59.52 
 
 
172 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3895  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0578  mutT/nudix family protein  31.45 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  30.3 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  28.81 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  33 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  48.21 
 
 
152 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0099  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.11 
 
 
396 aa  48.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0722569  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  38.71 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  30.3 
 
 
153 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  30.3 
 
 
153 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3327  MutT/Nudix family protein  41.67 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  32.54 
 
 
365 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  30.3 
 
 
153 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1138  NUDIX hydrolase  25 
 
 
140 aa  47.8  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2554  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
160 aa  47.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  32.54 
 
 
365 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  30.3 
 
 
153 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2466  hypothetical protein  46.15 
 
 
136 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  48 
 
 
129 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  35.8 
 
 
329 aa  47.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  46.51 
 
 
132 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5502  NUDIX hydrolase  32.97 
 
 
134 aa  47.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0631  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
144 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1385  NUDIX hydrolase  29.29 
 
 
209 aa  47  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 
175 aa  47  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  42.55 
 
 
129 aa  47  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>