More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0325 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 129 aa  253  5e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  68.55 
 
 		 169 aa  165  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  67.2 
 
 		 130 aa  157  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  52.38 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1102  NUDIX hydrolase  48.39 
 
 		 136 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.142351  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1760  NUDIX hydrolase  47.15 
 
 		 134 aa  102  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  48.41 
 
 		 329 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  48.41 
 
 		 329 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  40.65 
 
 		 128 aa  99.8  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  49.52 
 
 		 142 aa  98.2  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  49.52 
 
 		 141 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2654  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 139 aa  97.8  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  43.44 
 
 		 147 aa  97.8  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  51.92 
 
 		 147 aa  97.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  45.8 
 
 		 313 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  47.29 
 
 		 347 aa  95.1  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  49.52 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  44.35 
 
 		 317 aa  93.6  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 132 aa  93.6  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 147 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  47.62 
 
 		 153 aa  92  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 147 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  43.41 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 147 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  44.62 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  45.8 
 
 		 313 aa  91.7  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  48.57 
 
 		 149 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  44.54 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  47.01 
 
 		 325 aa  91.7  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  48.57 
 
 		 149 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  49.04 
 
 		 149 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2824  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 		 153 aa  90.9  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  45.38 
 
 		 132 aa  90.5  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  45.38 
 
 		 132 aa  90.5  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  48.08 
 
 		 149 aa  90.1  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03249  mutator mutT protein  38.4 
 
 		 127 aa  89.4  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  43.59 
 
 		 138 aa  89.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  49.5 
 
 		 172 aa  90.1  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  48.08 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  48.08 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  38.58 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  48.08 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  48.08 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  48.08 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  42.74 
 
 		 319 aa  89  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  44.72 
 
 		 314 aa  88.2  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0500  NUDIX hydrolase  44.95 
 
 		 152 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0475  NUDIX hydrolase  44.95 
 
 		 152 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  48.08 
 
 		 334 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  44.44 
 
 		 310 aa  88.2  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  41.54 
 
 		 132 aa  87.8  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  36.36 
 
 		 133 aa  87.8  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  43.41 
 
 		 142 aa  87.4  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  37.39 
 
 		 132 aa  87.4  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  44.55 
 
 		 312 aa  87.4  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3686  NUDIX hydrolase  52 
 
 		 151 aa  87  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  43.41 
 
 		 137 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1156  mutator MutT protein  29.37 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000464506  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  41.94 
 
 		 314 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 		 150 aa  84.7  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  38.66 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  41.98 
 
 		 314 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.51 
 
 		 134 aa  84.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  36.15 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  43.55 
 
 		 316 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  45.53 
 
 		 315 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  35.83 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  40.32 
 
 		 134 aa  84  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  44.62 
 
 		 144 aa  84  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  46.96 
 
 		 138 aa  84  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4229  NUDIX hydrolase  48 
 
 		 150 aa  84  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0351267  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.7 
 
 		 135 aa  83.6  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  41.98 
 
 		 314 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  43.41 
 
 		 135 aa  83.6  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  43.41 
 
 		 135 aa  83.6  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  38.1 
 
 		 129 aa  83.6  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  41.98 
 
 		 314 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4453  mutator mutT protein  35.46 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0347377  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  46.96 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  40.94 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  46.96 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  39.52 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  41.32 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0762  NUDIX hydrolase  49.49 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  42.98 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  41.86 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  41.03 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  39.17 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  41.98 
 
 		 314 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3510  mutator MutT protein  34.92 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.39786  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0991  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  40 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  38.52 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.7 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.89 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  45.22 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.4 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  47.52 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  44.72 
 
 		 315 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.4 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  44.76 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0431808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>