More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5494 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 172 aa  348  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3686  NUDIX hydrolase  81.75 
 
 		 151 aa  234  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0799  NUDIX hydrolase  78.47 
 
 		 148 aa  233  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.428384 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4229  NUDIX hydrolase  78.26 
 
 		 150 aa  233  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0351267  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0762  NUDIX hydrolase  77.78 
 
 		 148 aa  231  5e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3925  NUDIX hydrolase  73.1 
 
 		 155 aa  218  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0241724  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  63.95 
 
 		 151 aa  186  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0431808 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2908  NUDIX hydrolase  61.22 
 
 		 159 aa  179  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0831  NUDIX hydrolase  61.22 
 
 		 166 aa  179  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.556383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  65.12 
 
 		 137 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  56.55 
 
 		 149 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0544  NUDIX hydrolase  60.14 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  56.55 
 
 		 149 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  55.03 
 
 		 153 aa  170  6.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  58.5 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  57.14 
 
 		 142 aa  166  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  59.4 
 
 		 141 aa  166  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  57.64 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  57.64 
 
 		 147 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  57.64 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  57.64 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  59.26 
 
 		 149 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  59.54 
 
 		 149 aa  160  6e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  58.52 
 
 		 334 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  60.47 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  58.52 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  58.52 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  58.52 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  58.52 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  58.52 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0475  NUDIX hydrolase  55.8 
 
 		 152 aa  156  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0500  NUDIX hydrolase  55.8 
 
 		 152 aa  156  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  58.14 
 
 		 147 aa  154  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2824  NUDIX hydrolase  52 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  55.38 
 
 		 138 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  51.16 
 
 		 137 aa  124  9e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  48.09 
 
 		 314 aa  117  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  47.01 
 
 		 312 aa  114  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  46.28 
 
 		 325 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  45.95 
 
 		 316 aa  111  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  47.33 
 
 		 310 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  49.04 
 
 		 130 aa  98.2  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  48 
 
 		 329 aa  97.8  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  48 
 
 		 329 aa  97.8  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  47.79 
 
 		 169 aa  97.4  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  48.08 
 
 		 134 aa  96.7  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  40.3 
 
 		 347 aa  95.5  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  46.15 
 
 		 128 aa  94.7  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  46.15 
 
 		 128 aa  94.7  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  46.15 
 
 		 128 aa  94.7  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  41.04 
 
 		 135 aa  90.5  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  49.5 
 
 		 129 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  43.41 
 
 		 133 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  46.02 
 
 		 313 aa  89.4  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  42.02 
 
 		 315 aa  89  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  31.78 
 
 		 132 aa  88.6  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  42.34 
 
 		 316 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  40.68 
 
 		 315 aa  88.2  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  40.77 
 
 		 141 aa  87.4  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  40.88 
 
 		 316 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  40.31 
 
 		 132 aa  87  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  43.27 
 
 		 132 aa  87  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  37.98 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 		 151 aa  86.3  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  40.31 
 
 		 132 aa  86.3  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  44.35 
 
 		 144 aa  85.5  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  44 
 
 		 128 aa  85.1  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  37.59 
 
 		 314 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  41.35 
 
 		 130 aa  84.3  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  40.19 
 
 		 129 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  43.65 
 
 		 128 aa  84  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.37 
 
 		 131 aa  84  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  45.19 
 
 		 136 aa  83.6  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1102  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.142351  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  42.4 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  46.23 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  45.37 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  42.4 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  40.74 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  40.71 
 
 		 383 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  39.85 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  38.71 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1760  NUDIX hydrolase  42.57 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  45.28 
 
 		 315 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  33.64 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  36.84 
 
 		 314 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  40.6 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  36.84 
 
 		 314 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  41.35 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  40.98 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.58 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  40.38 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  42.19 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03249  mutator mutT protein  39.17 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  39.53 
 
 		 314 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  45.83 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  41.35 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3510  mutator MutT protein  45.19 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.39786  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  36.54 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>