More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2380 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 169 aa  337  5.9999999999999996e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  67.97 
 
 		 129 aa  167  4e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  67.74 
 
 		 130 aa  167  6e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  47.22 
 
 		 153 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  49.19 
 
 		 141 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  50.37 
 
 		 149 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  50.37 
 
 		 149 aa  114  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1102  NUDIX hydrolase  43.41 
 
 		 136 aa  112  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.142351  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2824  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  44.2 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  43.17 
 
 		 147 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  44.14 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  45.24 
 
 		 142 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  42.45 
 
 		 147 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  42.45 
 
 		 147 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0475  NUDIX hydrolase  49.11 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  42.45 
 
 		 147 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0500  NUDIX hydrolase  49.11 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  47.15 
 
 		 329 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.15 
 
 		 138 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  42.57 
 
 		 347 aa  100  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  45.53 
 
 		 147 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  47.15 
 
 		 329 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  43.45 
 
 		 149 aa  99.8  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  43.45 
 
 		 149 aa  99.8  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  43.45 
 
 		 149 aa  99.8  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  43.45 
 
 		 149 aa  99.8  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  46.67 
 
 		 149 aa  98.6  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3925  NUDIX hydrolase  49.19 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0241724  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  44.53 
 
 		 312 aa  98.6  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.32 
 
 		 138 aa  98.6  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  42.76 
 
 		 334 aa  98.2  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.32 
 
 		 138 aa  98.2  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.32 
 
 		 138 aa  98.2  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.32 
 
 		 138 aa  98.2  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  42.76 
 
 		 149 aa  98.2  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  42.4 
 
 		 319 aa  97.8  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  47.79 
 
 		 172 aa  97.8  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0799  NUDIX hydrolase  45.77 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.428384 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  44.78 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0762  NUDIX hydrolase  45.77 
 
 		 148 aa  97.1  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  41.46 
 
 		 128 aa  96.3  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3686  NUDIX hydrolase  51.46 
 
 		 151 aa  96.3  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  47.58 
 
 		 310 aa  96.3  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  39.2 
 
 		 129 aa  95.5  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  45.16 
 
 		 141 aa  95.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  42.74 
 
 		 314 aa  94.7  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  43.31 
 
 		 313 aa  94.4  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  42.5 
 
 		 137 aa  94.4  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4229  NUDIX hydrolase  52.75 
 
 		 150 aa  94.4  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0351267  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  37.3 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 		 138 aa  93.2  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1760  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  40.74 
 
 		 325 aa  92.8  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  42.75 
 
 		 318 aa  92.8  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 		 137 aa  92  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  41.35 
 
 		 138 aa  91.7  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  41.98 
 
 		 134 aa  91.7  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.84 
 
 		 135 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.84 
 
 		 135 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  38.84 
 
 		 135 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  40 
 
 		 317 aa  89.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  41.6 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  38.84 
 
 		 135 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.84 
 
 		 135 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.84 
 
 		 135 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  44.66 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  42.52 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0431808 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  37.8 
 
 		 134 aa  89  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  38.4 
 
 		 132 aa  89  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.02 
 
 		 135 aa  88.6  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0544  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 166 aa  88.2  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  41.09 
 
 		 144 aa  88.2  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  40.48 
 
 		 314 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  35.16 
 
 		 134 aa  87.8  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  41.94 
 
 		 134 aa  87.8  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 		 153 aa  87.8  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  40.94 
 
 		 316 aa  87.4  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  39.68 
 
 		 130 aa  87.4  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  41.09 
 
 		 132 aa  87.4  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  38.89 
 
 		 132 aa  87.4  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  37.6 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  37.6 
 
 		 130 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 131 aa  87  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  37.01 
 
 		 132 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  37.01 
 
 		 132 aa  87  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  41.27 
 
 		 315 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  33.33 
 
 		 133 aa  87  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  35.43 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  38.89 
 
 		 130 aa  86.3  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  42.86 
 
 		 313 aa  86.3  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  40.48 
 
 		 314 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  35.56 
 
 		 139 aa  85.5  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.19 
 
 		 135 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  38.89 
 
 		 130 aa  85.5  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2908  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 159 aa  85.9  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  40.48 
 
 		 314 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0831  NUDIX hydrolase  42.15 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.556383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2654  NUDIX hydrolase  40.44 
 
 		 139 aa  85.5  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  40.94 
 
 		 314 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>