147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0179 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0179  NUDIX hydrolase  100 
 
 
137 aa  282  9e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0431401  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0812  NUDIX hydrolase  62.77 
 
 
140 aa  181  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00112519  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1443  NUDIX hydrolase  60.14 
 
 
142 aa  176  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2080  NUDIX hydrolase  50.36 
 
 
190 aa  149  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.397171  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 
536 aa  82.8  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  31.34 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  36 
 
 
147 aa  62.8  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 
129 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  27.48 
 
 
229 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  25.36 
 
 
160 aa  56.6  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 
272 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  29.6 
 
 
146 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  26.77 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  27.21 
 
 
158 aa  54.3  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  27.2 
 
 
315 aa  54.3  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 
237 aa  53.9  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  26.56 
 
 
143 aa  52.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  26.12 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1155  hypothetical protein  30.4 
 
 
231 aa  52.8  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 
270 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 
270 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 
270 aa  52  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  27.72 
 
 
174 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1282  NUDIX hydrolase  52.27 
 
 
136 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.838379  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.87 
 
 
315 aa  51.6  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  37.84 
 
 
258 aa  51.6  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  28.57 
 
 
169 aa  50.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  28.57 
 
 
305 aa  50.4  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
153 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  24.82 
 
 
153 aa  50.4  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  28.8 
 
 
211 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  28.12 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  25.74 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 
282 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  29.41 
 
 
248 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  37.33 
 
 
430 aa  49.3  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  25 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  25.38 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  27.56 
 
 
289 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  25.41 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0396  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 
188 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal  0.770982 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  27.14 
 
 
182 aa  47  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  30.61 
 
 
229 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  26.42 
 
 
166 aa  47  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  27.21 
 
 
268 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  26.89 
 
 
336 aa  46.2  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  25.93 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  26.42 
 
 
182 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3028  NUDIX hydrolase  55 
 
 
174 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  45.1 
 
 
524 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  27.52 
 
 
146 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  24.03 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5143  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753323  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  36.67 
 
 
156 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
141 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3228  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 
122 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043036  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5139  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 
122 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2333  NUDIX hydrolase  24.09 
 
 
143 aa  45.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  44.23 
 
 
322 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2509  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.06 
 
 
163 aa  44.7  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.815631  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  27.12 
 
 
143 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3705  mutT/nudix family protein  28.12 
 
 
137 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  27.13 
 
 
301 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1000  NUDIX hydrolase  26.53 
 
 
165 aa  43.9  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000136038  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.78 
 
 
577 aa  43.9  0.0007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  25.9 
 
 
424 aa  43.9  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1770  dinucleoside polyphosphate hydrolase  26.81 
 
 
190 aa  43.9  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  26.02 
 
 
139 aa  43.9  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3541  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
138 aa  43.5  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  42.86 
 
 
229 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  26.77 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  24.81 
 
 
195 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  29.29 
 
 
216 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  26.79 
 
 
301 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  22.83 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6695  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
175 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.412462  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  26.98 
 
 
216 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  22.69 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  42.86 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  42.86 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  42.86 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  22.83 
 
 
302 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4302  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.23 
 
 
175 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  42.86 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1550  NUDIX hydrolase  24.82 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.979768  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0227  hypothetical protein  25.51 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  42.22 
 
 
164 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 
166 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  27.52 
 
 
317 aa  42  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  25.78 
 
 
296 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  42.86 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  42.86 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  42.86 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  42.86 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  22.5 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>