More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2605 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 216 aa  434  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  52.33 
 
 		 208 aa  176  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1651  NUDIX hydrolase  45.6 
 
 		 194 aa  175  4e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1465  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 		 207 aa  125  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.650531 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  36.68 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 		 237 aa  105  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 		 229 aa  102  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1155  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  96.3  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2668  hypothetical protein  33.49 
 
 		 255 aa  93.6  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 		 137 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  30.5 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 		 148 aa  60.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  27.08 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  30.6 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  31.93 
 
 		 315 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 141 aa  57.4  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 164 aa  57  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  34.35 
 
 		 536 aa  54.7  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  28.37 
 
 		 143 aa  54.3  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 161 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1550  NUDIX hydrolase  32.67 
 
 		 158 aa  54.3  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.979768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  32.37 
 
 		 430 aa  53.9  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  30.94 
 
 		 258 aa  53.5  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 139 aa  53.9  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  38.24 
 
 		 424 aa  53.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  34.9 
 
 		 153 aa  53.9  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  24.64 
 
 		 136 aa  52.8  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 		 139 aa  52.8  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  30.22 
 
 		 166 aa  52  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  32.8 
 
 		 155 aa  52.4  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 		 151 aa  52  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26314  predicted protein  40 
 
 		 243 aa  51.6  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  32.63 
 
 		 314 aa  51.2  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3773  NUDIX hydrolase  26.96 
 
 		 161 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000523575 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  31.09 
 
 		 351 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1119  dinucleoside polyphosphate hydrolase  30 
 
 		 162 aa  50.4  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 272 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  38.37 
 
 		 156 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0382  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 153 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  25 
 
 		 341 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 		 155 aa  50.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3460  mutT/nudix family protein  30.23 
 
 		 137 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284792  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4359  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 		 163 aa  50.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3377  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  29.92 
 
 		 137 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3688  mutT/nudix family protein  30.23 
 
 		 137 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.237209 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3732  mutT/nudix family protein  30.23 
 
 		 137 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  26.56 
 
 		 360 aa  50.1  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  28.69 
 
 		 146 aa  50.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 		 169 aa  49.7  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  37.68 
 
 		 146 aa  50.1  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  28.03 
 
 		 324 aa  49.3  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2723  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 178 aa  49.7  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.346967  hitchhiker  0.000510454 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  31.97 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 157 aa  49.3  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 		 140 aa  49.7  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1356  putative MutT/NUDIX family protein  37.5 
 
 		 173 aa  49.3  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 174 aa  48.9  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 		 268 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 145 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  28.21 
 
 		 321 aa  48.5  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2765  NUDIX hydrolase  29.36 
 
 		 151 aa  48.5  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000522672  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  29.36 
 
 		 151 aa  48.5  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 		 147 aa  48.5  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  43.14 
 
 		 163 aa  48.1  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2798  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.38 
 
 		 167 aa  48.1  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.779042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  27.34 
 
 		 336 aa  48.1  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  27.27 
 
 		 383 aa  48.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0697  NUDIX hydrolase  24.82 
 
 		 153 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.276525 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2036  NUDIX hydrolase  46 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 		 270 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 		 270 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2686  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  29.36 
 
 		 151 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310131  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  47.92 
 
 		 142 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  47.06 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3705  mutT/nudix family protein  34.52 
 
 		 137 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 147 aa  47  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 322 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  31.53 
 
 		 313 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3426  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  39.34 
 
 		 137 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0344425  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00240  deadenylation-dependent decapping-related protein, putative  40 
 
 		 888 aa  47  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.390509  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 		 270 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  30.08 
 
 		 169 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  39.39 
 
 		 343 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  31.2 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2457  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 		 168 aa  47.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.815124  normal  0.223342 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  28.91 
 
 		 400 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3020  dinucleoside polyphosphate hydrolase  26.36 
 
 		 167 aa  46.6  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.614658  normal  0.0272519 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 		 340 aa  47  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 		 156 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  31.86 
 
 		 158 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 		 158 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 		 155 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2419  NUDIX hydrolase  25.53 
 
 		 162 aa  46.6  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.217512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>