More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_25640 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  100 
 
 		 314 aa  621  1e-177  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  46.31 
 
 		 343 aa  246  3e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  45.11 
 
 		 324 aa  245  9e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  46.39 
 
 		 326 aa  242  5e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  42.2 
 
 		 356 aa  239  5e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 322 aa  236  5.0000000000000005e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  43.71 
 
 		 336 aa  227  2e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  42.07 
 
 		 351 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  43.2 
 
 		 341 aa  216  5e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 		 303 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  39.67 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  38.41 
 
 		 292 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4264  NUDIX hydrolase  42.33 
 
 		 286 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  37.42 
 
 		 325 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  36.95 
 
 		 310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  37.73 
 
 		 299 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  39.05 
 
 		 305 aa  159  5e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0876  NUDIX hydrolase  40.81 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.679959  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 333 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  37.02 
 
 		 317 aa  155  7e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  41.22 
 
 		 315 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1592  NTP pyrophosphohydrolase for oxidative damage repair  34 
 
 		 395 aa  154  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.985327  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  40.46 
 
 		 303 aa  149  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 		 302 aa  147  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 		 314 aa  145  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  38.06 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  38.06 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  38.06 
 
 		 311 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.44 
 
 		 315 aa  139  7e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0081  hydrolase, NUDIX family  28.74 
 
 		 398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000209436 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  35.47 
 
 		 301 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  38.02 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  41.2 
 
 		 296 aa  135  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 322 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  38.07 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  43.97 
 
 		 139 aa  81.3  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 		 195 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  37.3 
 
 		 216 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 		 150 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 		 149 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 322 aa  62.4  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 164 aa  62  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 		 143 aa  57.4  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1651  NUDIX hydrolase  29.77 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  31.15 
 
 		 159 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03438  MutT-nudix family protein  38.14 
 
 		 149 aa  55.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 142 aa  55.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  24.46 
 
 		 208 aa  54.7  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 153 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 146 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1522  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 		 137 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.241436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 		 137 aa  53.9  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 		 155 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 		 147 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 161 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4015  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.55 
 
 		 134 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  36.46 
 
 		 147 aa  53.1  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  32.86 
 
 		 136 aa  53.1  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1465  NUDIX hydrolase  29.75 
 
 		 207 aa  53.1  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.650531 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.66 
 
 		 583 aa  52.4  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2704  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 158 aa  52.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0109153 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 140 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  31 
 
 		 129 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  29.71 
 
 		 139 aa  51.2  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  32.63 
 
 		 216 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  27.97 
 
 		 158 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 		 140 aa  50.8  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  48.33 
 
 		 155 aa  50.4  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  31.18 
 
 		 140 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  39.56 
 
 		 158 aa  50.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  27.87 
 
 		 153 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01990  ADP-ribose pyrophosphatase  36.36 
 
 		 149 aa  49.7  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  31.86 
 
 		 147 aa  49.7  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 		 138 aa  49.7  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 158 aa  49.7  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  27.21 
 
 		 158 aa  49.7  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  28.46 
 
 		 229 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0463  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 172 aa  49.3  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  30.6 
 
 		 141 aa  48.5  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  27.87 
 
 		 153 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  27.87 
 
 		 153 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1264  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 		 146 aa  48.9  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.879303 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3426  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  40.68 
 
 		 137 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0344425  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  27.87 
 
 		 153 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2635  hypothetical protein  33.06 
 
 		 313 aa  48.5  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2766  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 144 aa  48.5  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0392  NUDIX family hydrolase  28.69 
 
 		 149 aa  48.5  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000292752 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 142 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3460  mutT/nudix family protein  38.98 
 
 		 137 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284792  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3688  mutT/nudix family protein  38.98 
 
 		 137 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.237209 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3377  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  38.98 
 
 		 137 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2570  hypothetical protein  31.91 
 
 		 172 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00072063  normal  0.0208228 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 147 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3732  mutT/nudix family protein  38.98 
 
 		 137 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 		 174 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0659  mutT/nudix family protein  30.11 
 
 		 140 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0906  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 		 187 aa  48.5  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>