More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6228 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 208 aa  426  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1651  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 		 194 aa  125  6e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  36.68 
 
 		 216 aa  122  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1465  NUDIX hydrolase  37 
 
 		 207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.650531 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 		 237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  37.93 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2668  hypothetical protein  36.42 
 
 		 255 aa  99  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 		 229 aa  93.6  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1155  hypothetical protein  36.76 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  32.62 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  42.39 
 
 		 137 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  31.85 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 270 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  42.16 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 270 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  29.25 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  29.45 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  27.42 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 		 272 aa  58.2  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 		 174 aa  57.8  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  32.03 
 
 		 430 aa  56.2  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  30.83 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 322 aa  55.1  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  30.93 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  28.1 
 
 		 143 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  28.35 
 
 		 158 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 		 142 aa  53.9  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 143 aa  52.8  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  29.57 
 
 		 144 aa  53.1  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2036  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  55.36 
 
 		 343 aa  52.8  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1319  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 143 aa  52.4  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 		 142 aa  52  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  37.25 
 
 		 536 aa  52  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  29.13 
 
 		 203 aa  52  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 143 aa  52  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 161 aa  51.6  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 153 aa  51.6  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 289 aa  51.2  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  26.67 
 
 		 155 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  28.15 
 
 		 182 aa  51.2  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  33.33 
 
 		 317 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4233  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 		 135 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257262  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 139 aa  51.2  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3028  NUDIX hydrolase  46.55 
 
 		 174 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  32.71 
 
 		 147 aa  51.2  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0697  NUDIX hydrolase  28.47 
 
 		 153 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.276525 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 140 aa  51.2  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  29.52 
 
 		 158 aa  51.2  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  39.24 
 
 		 146 aa  50.8  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0596  mutT/nudix family protein  46.3 
 
 		 153 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000504952  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0542  mutT/nudix family protein  46.3 
 
 		 153 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16009e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0511  mutT/nudix family protein  46.3 
 
 		 164 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0633443  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0454  MutT/NUDIX family protein  46.3 
 
 		 153 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000159368  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0450  MutT/NUDIX family protein  46.3 
 
 		 164 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290469  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0542  mutT/nudix family protein  46.3 
 
 		 164 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000238457  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 		 296 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  49.12 
 
 		 341 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  32.59 
 
 		 157 aa  50.1  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0094  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 		 170 aa  49.7  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.126747  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 149 aa  49.7  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 150 aa  49.7  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  29.75 
 
 		 169 aa  49.7  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4760  mutT/nudix family protein  46.3 
 
 		 153 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000960716  hitchhiker  5.01668e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0616  mutT/nudix family protein  46.3 
 
 		 169 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189637  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1501  NUDIX hydrolase  29.67 
 
 		 102 aa  49.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0954993  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0763  NUDIX hydrolase  25.69 
 
 		 153 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0534462 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0411  dinucleoside polyphosphate hydrolase  33.75 
 
 		 173 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229765 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0457  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 153 aa  49.3  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0641725  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  27.94 
 
 		 302 aa  49.3  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  28.97 
 
 		 473 aa  49.3  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 		 229 aa  48.9  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 180 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  30.5 
 
 		 322 aa  48.5  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  45.28 
 
 		 181 aa  48.9  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1206  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 		 154 aa  48.9  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.483034 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0527  dinucleoside polyphosphate hydrolase  30.77 
 
 		 179 aa  48.5  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.741334  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1443  NUDIX hydrolase  31.68 
 
 		 142 aa  48.5  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  33.33 
 
 		 321 aa  48.5  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0099  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  34.96 
 
 		 396 aa  48.1  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0722569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0578  mutT/nudix family protein  46.3 
 
 		 153 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0168  dinucleoside polyphosphate hydrolase  30.77 
 
 		 175 aa  48.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  29.45 
 
 		 132 aa  48.1  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 		 155 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 195 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  29.06 
 
 		 155 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3773  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 161 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000523575 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 		 155 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  27.34 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>