258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_33510 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  100 
 
 		 343 aa  674    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  63.98 
 
 		 324 aa  396  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  55.65 
 
 		 356 aa  362  4e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  58.73 
 
 		 326 aa  335  5.999999999999999e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  49.11 
 
 		 341 aa  259  7e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  47.49 
 
 		 314 aa  258  8e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  46.95 
 
 		 322 aa  252  8.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  44.05 
 
 		 351 aa  246  4e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  40.51 
 
 		 308 aa  215  7e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  42.5 
 
 		 336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0081  hydrolase, NUDIX family  32.2 
 
 		 398 aa  200  3e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000209436 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1592  NTP pyrophosphohydrolase for oxidative damage repair  33.24 
 
 		 395 aa  176  5e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.985327  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4264  NUDIX hydrolase  42.91 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  39.94 
 
 		 303 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0876  NUDIX hydrolase  38.56 
 
 		 333 aa  155  8e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.679959  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  37.36 
 
 		 292 aa  155  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  36.16 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  34.39 
 
 		 325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 299 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  37.41 
 
 		 322 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  32.3 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 		 303 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  36.16 
 
 		 310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  34.7 
 
 		 302 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  34.16 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  35.41 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  34.08 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  34.8 
 
 		 315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  34.08 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  34.08 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.85 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  37.05 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 		 296 aa  116  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  35.53 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  32.48 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  41.11 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0564  phosphoglycerate mutase  43.21 
 
 		 205 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1980  NUDIX hydrolase  36.64 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.28 
 
 		 577 aa  57.8  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  43.02 
 
 		 140 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 149 aa  57  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  30.89 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 153 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 		 140 aa  54.3  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  34.58 
 
 		 142 aa  53.5  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  36.09 
 
 		 160 aa  53.5  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  38.54 
 
 		 139 aa  53.5  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 211 aa  53.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  54.84 
 
 		 208 aa  52.8  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  44.62 
 
 		 139 aa  52.4  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 		 583 aa  52  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 		 164 aa  52.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0392  NUDIX family hydrolase  43.86 
 
 		 149 aa  52.4  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000292752 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  31.34 
 
 		 148 aa  50.8  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 195 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  39.76 
 
 		 144 aa  50.8  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 146 aa  50.8  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 		 129 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1651  NUDIX hydrolase  27.66 
 
 		 194 aa  50.4  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  35.07 
 
 		 161 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  41.67 
 
 		 424 aa  50.1  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3701  NUDIX hydrolase  34.58 
 
 		 144 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.899383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 322 aa  50.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  31.2 
 
 		 150 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  35.71 
 
 		 158 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  35.71 
 
 		 158 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 		 155 aa  49.3  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  41.35 
 
 		 143 aa  49.3  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  35.71 
 
 		 158 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2100  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 139 aa  48.9  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 		 139 aa  48.9  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2570  hypothetical protein  30 
 
 		 172 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00072063  normal  0.0208228 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  43.28 
 
 		 160 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 237 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 216 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2817  NUDIX hydrolase  31.72 
 
 		 152 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  31.07 
 
 		 140 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 		 147 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  40 
 
 		 129 aa  47.4  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  38.24 
 
 		 163 aa  47.4  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  28.67 
 
 		 208 aa  47.4  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 169 aa  47.4  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 		 147 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 		 155 aa  47  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  59.52 
 
 		 153 aa  47  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1034  NUDIX hydrolase  30.67 
 
 		 185 aa  47  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 		 132 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  45.9 
 
 		 153 aa  47  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  40.7 
 
 		 229 aa  46.6  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22390  ADP-ribose pyrophosphatase  27.89 
 
 		 196 aa  46.6  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  34.31 
 
 		 314 aa  46.6  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 		 180 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 147 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2879  NUDIX hydrolase  47.83 
 
 		 157 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  42.53 
 
 		 134 aa  46.6  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2923  NUDIX hydrolase  47.83 
 
 		 157 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.928534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2909  NUDIX hydrolase  47.83 
 
 		 157 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188033  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  45 
 
 		 329 aa  46.6  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  45 
 
 		 329 aa  46.6  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>