269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0564 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0564  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
205 aa  417  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1619  phosphoglycerate mutase family protein  29.41 
 
 
191 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391089  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1745  phosphoglycerate mutase family protein  29.41 
 
 
191 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1619  phosphoglycerate mutase  28.16 
 
 
191 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.958559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1435  phosphoglycerate mutase  29.05 
 
 
193 aa  102  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1822  phosphoglycerate mutase family protein  28.82 
 
 
191 aa  101  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.125465  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1795  phosphoglycerate mutase family protein  28.82 
 
 
191 aa  101  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1580  phosphoglycerate mutase family protein; fructose-2,6-bisphosphatase  29.41 
 
 
191 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000315491  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1875  phosphoglycerate mutase family protein  29.78 
 
 
193 aa  99.4  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1876  phosphoglycerate mutase family protein  28.24 
 
 
189 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1571  phosphoglycerate mutase family protein; fructose-2,6-bisphosphatase  27.27 
 
 
191 aa  98.6  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1761  phosphoglycerate mutase family protein  27.84 
 
 
191 aa  97.8  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3581  phosphoglycerate mutase family protein  28.41 
 
 
191 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0209  phosphoglycerate mutase family protein  27.75 
 
 
189 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000155223 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1754  phosphoglycerate mutase family protein  26.86 
 
 
189 aa  85.5  5e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1977  Phosphoglycerate mutase  27.43 
 
 
190 aa  85.5  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00635412  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3758  putative phosphoglycerate mutase family protein  25.41 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000119395 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3778  phosphoglycerate mutase family protein, putative  26.7 
 
 
191 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.229093  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3491  phosphoglycerate mutase  25.97 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181451  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0783  phosphoglycerate mutase family protein  30.56 
 
 
177 aa  76.3  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3514  phosphoglycerate mutase  25.7 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0342189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3591  phosphoglycerate mutase family protein  24.86 
 
 
191 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3876  phosphoglycerate mutase family protein  24.86 
 
 
191 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3503  phosphoglycerate mutase  24.58 
 
 
191 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0158096  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1453  putative phosphoglycerate mutase family protein  25.56 
 
 
191 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000204628 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3845  putative phosphoglycerate mutase family protein  26.14 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0088  phosphoglycerate mutase family protein  30.41 
 
 
246 aa  70.1  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5107  phosphoglycerate mutase family protein, putative  29.22 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0711  phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1203  phosphoglycerate mutase  36.13 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0126  putative phosphoglycerate mutase family protein  27.63 
 
 
184 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.023216  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5112  putative phosphoglycerate mutase family protein  26.85 
 
 
184 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000628786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4837  phosphoglycerate mutase family protein  26.8 
 
 
184 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5203  phosphoglycerate mutase family protein  26.8 
 
 
184 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  31.66 
 
 
221 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  31.66 
 
 
221 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5074  putative phosphoglycerate mutase family protein  26.8 
 
 
184 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  32.16 
 
 
220 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5114  putative phosphoglycerate mutase family protein  25.29 
 
 
184 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0497299  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  31.5 
 
 
220 aa  62  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 
223 aa  61.6  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  31.41 
 
 
212 aa  61.6  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  31.93 
 
 
230 aa  61.6  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4680  phosphoglycerate mutase  26.8 
 
 
184 aa  60.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0245  phosphoglycerate mutase  31 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.044549 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  31.01 
 
 
227 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4970  phosphoglycerate mutase  35.67 
 
 
203 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5058  phosphoglycerate mutase  35.67 
 
 
203 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5604  phosphoglycerate mutase  36.13 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.335394  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5351  phosphoglycerate mutase  35.67 
 
 
203 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4696  phosphoglycerate mutase  25.97 
 
 
184 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  43.21 
 
 
343 aa  59.7  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  31.31 
 
 
220 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 
221 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  33.92 
 
 
223 aa  58.5  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  33.12 
 
 
223 aa  58.5  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 
213 aa  58.5  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4794  phosphoglycerate mutase  25.97 
 
 
184 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  26.54 
 
 
221 aa  57.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  31.44 
 
 
229 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  31.37 
 
 
233 aa  57  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  31.33 
 
 
223 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  32.7 
 
 
226 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 
411 aa  55.8  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  30.12 
 
 
223 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0290  phosphoglycerate mutase  29.5 
 
 
220 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.438239  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 
240 aa  55.5  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  32.62 
 
 
227 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0587  Phosphoglycerate mutase  33.56 
 
 
183 aa  55.5  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  25.81 
 
 
196 aa  55.5  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  31.37 
 
 
224 aa  55.1  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  32.08 
 
 
226 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3949  Phosphoglycerate mutase  30.68 
 
 
232 aa  55.1  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00773926  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  28.84 
 
 
214 aa  54.7  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  36.08 
 
 
452 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 
216 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1144  phosphoglycerate mutase family protein  29.3 
 
 
193 aa  54.3  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.445332  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  29.02 
 
 
220 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  27.22 
 
 
208 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  26.63 
 
 
209 aa  53.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  29.02 
 
 
220 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  29.02 
 
 
220 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  29.02 
 
 
220 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  31.65 
 
 
215 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  29.02 
 
 
229 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  26.54 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  29.02 
 
 
229 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4770  Phosphoglycerate mutase  42.47 
 
 
168 aa  52.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.12947  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  33.77 
 
 
207 aa  52.4  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 
378 aa  52  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  25.31 
 
 
204 aa  52  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 
245 aa  52  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  28.3 
 
 
205 aa  52  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 
199 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  29.75 
 
 
213 aa  51.6  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  29.03 
 
 
214 aa  51.6  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  35.48 
 
 
224 aa  51.6  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  28.02 
 
 
202 aa  51.6  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.56 
 
 
369 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  28.93 
 
 
209 aa  51.6  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>