More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3618 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  100 
 
 		 369 aa  737    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  78.59 
 
 		 356 aa  578  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  73.44 
 
 		 365 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  73.44 
 
 		 365 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  73.44 
 
 		 365 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  69.38 
 
 		 364 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  61.32 
 
 		 391 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  62.17 
 
 		 383 aa  431  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  54.28 
 
 		 382 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  54.86 
 
 		 378 aa  345  6e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  55.65 
 
 		 378 aa  342  8e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  54.45 
 
 		 378 aa  341  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  46.65 
 
 		 411 aa  311  1e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  49.32 
 
 		 363 aa  300  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  46.78 
 
 		 412 aa  300  4e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  51.02 
 
 		 402 aa  294  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  46.59 
 
 		 370 aa  290  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  44.42 
 
 		 401 aa  266  5e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  65.55 
 
 		 215 aa  263  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  61.97 
 
 		 218 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  46.47 
 
 		 366 aa  240  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  54.68 
 
 		 427 aa  216  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  55.22 
 
 		 440 aa  199  5e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  39.95 
 
 		 412 aa  193  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  52.86 
 
 		 452 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  63.64 
 
 		 137 aa  163  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  55.8 
 
 		 322 aa  135  8e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  54.14 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  39.23 
 
 		 205 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  50 
 
 		 253 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  50 
 
 		 253 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  49.19 
 
 		 168 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  47.15 
 
 		 198 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  45.38 
 
 		 254 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  35.32 
 
 		 208 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  36.26 
 
 		 207 aa  113  5e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  34.16 
 
 		 211 aa  113  5e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  36.1 
 
 		 202 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2587  ribonuclease H  47.73 
 
 		 197 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  36.63 
 
 		 209 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1173  ribonuclease H  40.6 
 
 		 194 aa  109  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  33.33 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 		 209 aa  107  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  37.38 
 
 		 205 aa  107  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4219  ribonuclease H  39.55 
 
 		 313 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  34.42 
 
 		 253 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  39.6 
 
 		 210 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0341  ribonuclease H  46.97 
 
 		 142 aa  103  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3066  ribonuclease H  46.21 
 
 		 197 aa  103  7e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1556  ribonuclease H  38.93 
 
 		 154 aa  102  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0088  ribonuclease H  41.55 
 
 		 211 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  45.24 
 
 		 132 aa  101  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  31.98 
 
 		 200 aa  101  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  31.98 
 
 		 200 aa  101  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  31.98 
 
 		 200 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  35.83 
 
 		 213 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  41.94 
 
 		 222 aa  99.8  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  41.94 
 
 		 222 aa  99.8  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  31.89 
 
 		 206 aa  100  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 200 aa  99.4  9e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  33.01 
 
 		 243 aa  99.4  9e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  33.67 
 
 		 200 aa  98.6  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  40.99 
 
 		 240 aa  98.6  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2817  phosphoglycerate mutase  38.22 
 
 		 206 aa  99  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00859935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  37.95 
 
 		 212 aa  98.2  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0307  ribonuclease H  47.73 
 
 		 198 aa  98.2  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483531  normal  0.133717 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  33 
 
 		 209 aa  97.4  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  45.28 
 
 		 228 aa  97.4  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  39.43 
 
 		 214 aa  97.1  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  43.29 
 
 		 205 aa  96.7  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1207  ribonuclease H  46.15 
 
 		 198 aa  96.3  8e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623117  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  37.63 
 
 		 214 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  34.01 
 
 		 203 aa  96.3  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  35.03 
 
 		 203 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  33.83 
 
 		 214 aa  95.9  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0309  ribonuclease H  47.73 
 
 		 197 aa  95.5  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2434  phosphoglyceromutase  34.9 
 
 		 212 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  35.03 
 
 		 203 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  43.9 
 
 		 205 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  39.13 
 
 		 214 aa  94.7  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.25 
 
 		 201 aa  95.1  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  40.85 
 
 		 205 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  39.13 
 
 		 212 aa  94.7  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3809  phosphoglyceromutase  38.34 
 
 		 206 aa  94.4  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  34.41 
 
 		 215 aa  93.6  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  42.28 
 
 		 208 aa  93.6  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  34.94 
 
 		 223 aa  93.6  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  34.01 
 
 		 203 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  43.17 
 
 		 223 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0273  ribonuclease H  41.04 
 
 		 199 aa  93.2  6e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.442052 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  34.01 
 
 		 203 aa  92.8  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  43.88 
 
 		 226 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  43.88 
 
 		 226 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  43.88 
 
 		 226 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  34.01 
 
 		 203 aa  92  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  33.33 
 
 		 213 aa  92  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  38.41 
 
 		 224 aa  92.4  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2729  phosphoglyceromutase  34.38 
 
 		 212 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.228083 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_8015  predicted protein  40.8 
 
 		 126 aa  92.4  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00418489  normal  0.339866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  35.47 
 
 		 223 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>