235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0341 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0341  ribonuclease H  100 
 
 		 142 aa  288  2e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1556  ribonuclease H  46.32 
 
 		 154 aa  134  5e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1437  ribonuclease H  50.38 
 
 		 134 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  46.97 
 
 		 369 aa  103  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  43.75 
 
 		 254 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  44.53 
 
 		 253 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  44.53 
 
 		 253 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  44.06 
 
 		 383 aa  100  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  41.18 
 
 		 137 aa  100  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  43.75 
 
 		 168 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  42.65 
 
 		 370 aa  99.8  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  48.7 
 
 		 412 aa  97.4  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2587  ribonuclease H  46.09 
 
 		 197 aa  96.7  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.42 
 
 		 356 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  41.35 
 
 		 391 aa  95.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4219  ribonuclease H  36.11 
 
 		 313 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1173  ribonuclease H  37.4 
 
 		 194 aa  91.3  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  44.68 
 
 		 401 aa  91.3  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  43.8 
 
 		 452 aa  90.5  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3066  ribonuclease H  43.41 
 
 		 197 aa  90.5  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  45.8 
 
 		 411 aa  89.7  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  45.52 
 
 		 440 aa  89.4  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  45.11 
 
 		 382 aa  88.6  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  41.27 
 
 		 198 aa  89.4  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  42.19 
 
 		 363 aa  88.2  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  44.83 
 
 		 378 aa  87.8  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  46.62 
 
 		 378 aa  86.7  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  45.45 
 
 		 412 aa  86.7  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1207  ribonuclease H  43.75 
 
 		 198 aa  86.3  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623117  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  47.75 
 
 		 378 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0273  ribonuclease H  46.83 
 
 		 199 aa  85.1  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.442052 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  41.22 
 
 		 133 aa  84.3  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.39 
 
 		 365 aa  84  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.39 
 
 		 365 aa  84  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.39 
 
 		 365 aa  84  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0309  ribonuclease H  44.53 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  39.71 
 
 		 322 aa  80.5  0.000000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  44.62 
 
 		 132 aa  80.1  0.000000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.58 
 
 		 364 aa  78.6  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  46.09 
 
 		 402 aa  77.4  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0088  ribonuclease H  37.01 
 
 		 211 aa  77  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0307  ribonuclease H  40.16 
 
 		 198 aa  76.6  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483531  normal  0.133717 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  43.44 
 
 		 366 aa  73.6  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.21 
 
 		 427 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_8015  predicted protein  36.22 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00418489  normal  0.339866 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0891  ribonuclease H  38.85 
 
 		 139 aa  67  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000481849  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5423  ribonuclease H  39.13 
 
 		 2805 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1739  ribonuclease H  35 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0755  ribonuclease H  33.33 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2246  ribonuclease H  34.19 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.454266  hitchhiker  0.00558183 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0162  ribonuclease H  32.39 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.765291  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3014  hypothetical protein  37.12 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1985  ribonuclease H  33.33 
 
 		 230 aa  60.1  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000102134  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1714  ribonuclease H  31.25 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1764  ribonuclease H  31.25 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1507  ribonuclease H  31.25 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1479  ribonuclease H  31.25 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.221091  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1469  ribonuclease H  31.25 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.718462  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1384  ribonuclease H  34.75 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000297522  normal  0.0974241 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1691  ribonuclease H  31.25 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1623  ribonuclease H  31.25 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8140  ribonuclease H  43.04 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1511  ribonuclease H  31.25 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2679  hypothetical protein  34.09 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.207946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2066  ribonuclease H  31.41 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043986  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08950  Ribonuclease H  42.68 
 
 		 269 aa  54.3  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1321  ribonuclease H  31.11 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00120412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3686  ribonuclease H  29.69 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0484  ribonuclease H  39.29 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416034 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4135  ribonuclease H  40.51 
 
 		 176 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.204286  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1659  ribonuclease H  29.69 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2527  RNase HI  36.17 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1616  ribonuclease H  40.79 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000113365  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0667  ribonuclease HI  40.51 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.652902  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0628  ribonuclease H  42.86 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.702855  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6404  ribonuclease H  37.21 
 
 		 215 aa  51.2  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3678  ribonuclease H  36.11 
 
 		 217 aa  50.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.66661  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0600  ribonuclease H  39.74 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.42246  normal  0.0270163 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4711  ribonuclease H  30.65 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_303  hypothetical protein  35.9 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2066  ribonuclease H  43.75 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2969  Ribonuclease H  36.36 
 
 		 175 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113773  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1340  Ribonuclease H  34.94 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154889  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1612  ribonuclease H  35 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44751  predicted protein  33.12 
 
 		 376 aa  48.5  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155872  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1607  ribonuclease H  37.5 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1354  Ribonuclease HI-like protein  28.32 
 
 		 417 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.384272  hitchhiker  0.000000713582 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0262  Ribonuclease H  36.78 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1325  hypothetical protein  28.32 
 
 		 417 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1976  ribonuclease H  41.03 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  35.29 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6005  ribonuclease H  38.96 
 
 		 220 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.266469  normal  0.0613425 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0446  Ribonuclease H  38.37 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2115  RNase HI  38.46 
 
 		 238 aa  47.4  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0673  ribonuclease H  37.84 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335449  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1763  ribonuclease H  30.52 
 
 		 150 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.890131 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3467  ribonuclease H  29.33 
 
 		 148 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41060  ribonuclease H  38.1 
 
 		 148 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3481  ribonuclease H  38.1 
 
 		 148 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2706  ribonuclease HI  31.9 
 
 		 159 aa  47  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>