More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3342 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  100 
 
 		 365 aa  731    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  100 
 
 		 365 aa  731    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  100 
 
 		 365 aa  731    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  76.16 
 
 		 356 aa  544  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  73.44 
 
 		 369 aa  535  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  71.78 
 
 		 364 aa  481  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  61.54 
 
 		 391 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  60.05 
 
 		 383 aa  418  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  54.99 
 
 		 378 aa  347  3e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  52.79 
 
 		 382 aa  345  6e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  51.85 
 
 		 378 aa  324  2e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  51.86 
 
 		 378 aa  323  4e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  46.21 
 
 		 440 aa  305  7e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  48.37 
 
 		 363 aa  300  3e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  45.68 
 
 		 411 aa  298  7e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  48.37 
 
 		 370 aa  295  6e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  50.63 
 
 		 402 aa  287  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  44.74 
 
 		 412 aa  281  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  43.12 
 
 		 401 aa  265  8.999999999999999e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  67.94 
 
 		 215 aa  261  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  61.03 
 
 		 218 aa  238  9e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  45.9 
 
 		 366 aa  237  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  53.69 
 
 		 427 aa  205  9e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 		 412 aa  186  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  47.54 
 
 		 452 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  61.65 
 
 		 137 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  53.49 
 
 		 322 aa  126  8.000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  51.13 
 
 		 133 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  35.96 
 
 		 208 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  35.32 
 
 		 198 aa  117  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  49.21 
 
 		 132 aa  114  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  46.77 
 
 		 168 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  44.52 
 
 		 222 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  44.52 
 
 		 222 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  46.77 
 
 		 253 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  46.77 
 
 		 253 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  34.24 
 
 		 211 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  45.97 
 
 		 254 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  39.02 
 
 		 205 aa  109  9.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  35.82 
 
 		 213 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0088  ribonuclease H  44.2 
 
 		 211 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2587  ribonuclease H  48.41 
 
 		 197 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  37.62 
 
 		 209 aa  109  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1173  ribonuclease H  39.85 
 
 		 194 aa  107  4e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  42.58 
 
 		 228 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 209 aa  106  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 205 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 214 aa  102  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  32.79 
 
 		 206 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  40.3 
 
 		 210 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4219  ribonuclease H  40.31 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  35.32 
 
 		 213 aa  100  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  35.12 
 
 		 202 aa  100  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3066  ribonuclease H  46.03 
 
 		 197 aa  99.8  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  31.5 
 
 		 200 aa  97.4  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  34.95 
 
 		 235 aa  97.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  33.49 
 
 		 253 aa  96.3  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  33.52 
 
 		 207 aa  96.3  8e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0309  ribonuclease H  47.62 
 
 		 197 aa  95.9  9e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  33.19 
 
 		 243 aa  95.5  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  31.19 
 
 		 201 aa  95.5  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  39.63 
 
 		 214 aa  95.5  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  31.19 
 
 		 201 aa  95.5  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  33.33 
 
 		 213 aa  95.5  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  34.98 
 
 		 214 aa  95.1  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30.5 
 
 		 200 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30.5 
 
 		 200 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  35.44 
 
 		 223 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  30.5 
 
 		 200 aa  93.6  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  38.78 
 
 		 212 aa  93.2  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  33.83 
 
 		 213 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0307  ribonuclease H  47.24 
 
 		 198 aa  92.4  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483531  normal  0.133717 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.81 
 
 		 201 aa  91.3  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  34.72 
 
 		 227 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  42.41 
 
 		 234 aa  91.7  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  37.19 
 
 		 205 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  39.7 
 
 		 205 aa  90.5  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  39.19 
 
 		 198 aa  90.1  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1513  phosphoribosyltransferase, putative/phosphoglycerate mutase family protein  32.98 
 
 		 438 aa  89.7  7e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000537342 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  43.2 
 
 		 205 aa  89.4  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  42.65 
 
 		 226 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  42.65 
 
 		 226 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  42.65 
 
 		 226 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_8015  predicted protein  40 
 
 		 126 aa  89.4  9e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00418489  normal  0.339866 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1207  ribonuclease H  46.46 
 
 		 198 aa  89.4  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623117  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  33.66 
 
 		 213 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 		 210 aa  88.6  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  42.97 
 
 		 223 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  35.78 
 
 		 224 aa  87.4  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  41.94 
 
 		 207 aa  87  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  42.77 
 
 		 210 aa  87.4  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  33.67 
 
 		 202 aa  87.4  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.37 
 
 		 442 aa  87.4  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  39.53 
 
 		 208 aa  87  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1437  ribonuclease H  35.11 
 
 		 134 aa  87  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 		 203 aa  87  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  38.93 
 
 		 203 aa  86.7  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0273  ribonuclease H  39.17 
 
 		 199 aa  85.9  9e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.442052 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.44 
 
 		 442 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  38.69 
 
 		 240 aa  85.5  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>