144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3066 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_3066  ribonuclease H  100 
 
 		 197 aa  391  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2587  ribonuclease H  69.04 
 
 		 197 aa  276  1e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0309  ribonuclease H  70.05 
 
 		 197 aa  267  7e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0307  ribonuclease H  70.56 
 
 		 198 aa  254  4e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483531  normal  0.133717 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1207  ribonuclease H  68.53 
 
 		 198 aa  247  7e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623117  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  49.62 
 
 		 133 aa  110  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  43.55 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  43.08 
 
 		 254 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  49.23 
 
 		 132 aa  103  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  46.21 
 
 		 369 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  43.65 
 
 		 168 aa  101  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  43.65 
 
 		 253 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  43.65 
 
 		 253 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  43.85 
 
 		 391 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0088  ribonuclease H  44.44 
 
 		 211 aa  99.4  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  46.03 
 
 		 365 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  46.03 
 
 		 365 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  46.03 
 
 		 365 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1556  ribonuclease H  41.27 
 
 		 154 aa  99.8  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  46.03 
 
 		 356 aa  99  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4219  ribonuclease H  38.71 
 
 		 313 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_8015  predicted protein  46.03 
 
 		 126 aa  92.8  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00418489  normal  0.339866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  42.4 
 
 		 137 aa  92.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  42.4 
 
 		 370 aa  91.3  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0341  ribonuclease H  43.41 
 
 		 142 aa  90.5  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1173  ribonuclease H  42.4 
 
 		 194 aa  90.5  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  42.74 
 
 		 383 aa  89.4  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  44.44 
 
 		 382 aa  86.7  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  43.33 
 
 		 364 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  44 
 
 		 401 aa  84.7  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  41.94 
 
 		 427 aa  80.5  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1384  ribonuclease H  38.89 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000297522  normal  0.0974241 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  39.37 
 
 		 363 aa  79.3  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  41.48 
 
 		 440 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  44.53 
 
 		 378 aa  78.2  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1437  ribonuclease H  36.22 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1714  ribonuclease H  34.11 
 
 		 128 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461816  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1507  ribonuclease H  34.11 
 
 		 128 aa  77  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1479  ribonuclease H  34.11 
 
 		 128 aa  77  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.221091  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1469  ribonuclease H  34.11 
 
 		 128 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.718462  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1623  ribonuclease H  34.11 
 
 		 128 aa  77  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  43.36 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  40.6 
 
 		 452 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1511  ribonuclease H  34.11 
 
 		 128 aa  77  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1764  ribonuclease H  34.11 
 
 		 128 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1691  ribonuclease H  34.11 
 
 		 128 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1659  ribonuclease H  34.88 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3686  ribonuclease H  34.88 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.5 
 
 		 378 aa  75.9  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44751  predicted protein  38.46 
 
 		 376 aa  75.5  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155872  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0273  ribonuclease H  36.76 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.442052 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1321  ribonuclease H  34.11 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00120412  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  40.31 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  38.89 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.64 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  39.39 
 
 		 366 aa  68.6  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0891  ribonuclease H  36.57 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000481849  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  41.96 
 
 		 402 aa  66.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0755  ribonuclease H  36.03 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1739  ribonuclease H  36.84 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2246  ribonuclease H  31.85 
 
 		 148 aa  63.9  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.454266  hitchhiker  0.00558183 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_303  hypothetical protein  42.67 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  39.29 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1510  hypothetical protein  26.8 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00387825  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1626  hypothetical protein  26.8 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1324  hypothetical protein  28.57 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000515383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1482  hypothetical protein  26.8 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00299732  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1472  hypothetical protein  26.14 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0667267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1694  hypothetical protein  26.8 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4711  ribonuclease H  31.82 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1768  hypothetical protein  26.14 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5423  ribonuclease H  28.8 
 
 		 2805 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0162  ribonuclease H  32.85 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.765291  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1663  hypothetical protein  26.8 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1717  hypothetical protein  26.14 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3655  ribonuclease H  27.74 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499502  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1923  hypothetical protein  35.71 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1010  cell wall enzyme EbsB, putative  29.01 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1514  hypothetical protein  27.45 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.988638  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3682  hypothetical protein  26.14 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4830  ribonuclease H  31.75 
 
 		 145 aa  53.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.935261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1103  ribonuclease H  31.97 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2183  RNase HI  39.47 
 
 		 259 aa  52.4  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1351  ribonuclease H  33.06 
 
 		 152 aa  52.4  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3678  ribonuclease H  32.82 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.66661  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1494  ribonuclease HI-like protein  27.2 
 
 		 133 aa  51.2  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1523  cell wall enzyme EbsB-like protein  27.2 
 
 		 133 aa  51.2  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1511  ribonuclease H  40 
 
 		 302 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1354  Ribonuclease HI-like protein  26.98 
 
 		 417 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.384272  hitchhiker  0.000000713582 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3313  Ribonuclease H  38.46 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1325  hypothetical protein  26.98 
 
 		 417 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2679  hypothetical protein  32 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.207946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2706  ribonuclease HI  30.22 
 
 		 159 aa  48.9  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  32.62 
 
 		 154 aa  48.5  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0428  ribonuclease H  38.67 
 
 		 302 aa  47.8  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2151  ribonuclease HI  39.02 
 
 		 247 aa  47  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3014  hypothetical protein  32.54 
 
 		 154 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2143  hypothetical protein  30.66 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3467  ribonuclease H  29.22 
 
 		 148 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3712  ribonuclease HI  31.29 
 
 		 150 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0350909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>