207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0088 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0088  ribonuclease H  100 
 
 		 211 aa  430  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  48.44 
 
 		 137 aa  117  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  47.2 
 
 		 254 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  47.58 
 
 		 253 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  47.58 
 
 		 253 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  46.77 
 
 		 168 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  44.44 
 
 		 365 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  44.53 
 
 		 133 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  44.44 
 
 		 365 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  44.44 
 
 		 365 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1173  ribonuclease H  43.24 
 
 		 194 aa  106  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  39.86 
 
 		 370 aa  105  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  41.55 
 
 		 369 aa  102  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4219  ribonuclease H  41.18 
 
 		 313 aa  101  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  39.33 
 
 		 383 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.41 
 
 		 356 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3066  ribonuclease H  44.44 
 
 		 197 aa  99.4  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1207  ribonuclease H  44.88 
 
 		 198 aa  98.6  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623117  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  44.8 
 
 		 364 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  43.75 
 
 		 411 aa  94.7  8e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  44.7 
 
 		 363 aa  94  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1437  ribonuclease H  35.61 
 
 		 134 aa  93.6  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0309  ribonuclease H  46.09 
 
 		 197 aa  93.2  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2587  ribonuclease H  41.86 
 
 		 197 aa  93.2  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  42.03 
 
 		 378 aa  92.4  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  40 
 
 		 132 aa  92  6e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  40.74 
 
 		 401 aa  91.3  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  41.86 
 
 		 391 aa  90.5  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  41.56 
 
 		 452 aa  89.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  36.51 
 
 		 198 aa  88.2  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40 
 
 		 382 aa  86.7  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_8015  predicted protein  40.8 
 
 		 126 aa  85.9  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00418489  normal  0.339866 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  40.91 
 
 		 440 aa  85.1  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 412 aa  85.5  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  41.6 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  41.41 
 
 		 322 aa  82.8  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0307  ribonuclease H  41.41 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483531  normal  0.133717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.62 
 
 		 427 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.8 
 
 		 378 aa  78.2  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  42.72 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0341  ribonuclease H  37.01 
 
 		 142 aa  77  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  39.29 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1714  ribonuclease H  36.29 
 
 		 128 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461816  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1507  ribonuclease H  36.29 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1691  ribonuclease H  36.29 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1479  ribonuclease H  36.29 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.221091  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1469  ribonuclease H  36.29 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.718462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1764  ribonuclease H  36.29 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1623  ribonuclease H  36.29 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1511  ribonuclease H  36.29 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1556  ribonuclease H  29.93 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1321  ribonuclease H  35.61 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00120412  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 402 aa  71.6  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0891  ribonuclease H  34.31 
 
 		 139 aa  70.9  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000481849  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1659  ribonuclease H  36.72 
 
 		 128 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44751  predicted protein  36.53 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155872  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3686  ribonuclease H  36.72 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0273  ribonuclease H  34.87 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.442052 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1384  ribonuclease H  33.33 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000297522  normal  0.0974241 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2246  ribonuclease H  37.36 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.454266  hitchhiker  0.00558183 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_303  hypothetical protein  43.75 
 
 		 81 aa  66.6  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1680  ribonuclease H  30.91 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.254579  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2382  ribonuclease H  32.86 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.227808  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4711  ribonuclease H  31.54 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6404  ribonuclease H  30.83 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5423  ribonuclease H  29.85 
 
 		 2805 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0593  ribonuclease H  32.19 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1985  ribonuclease H  34.03 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000102134  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0755  ribonuclease H  31.01 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3678  ribonuclease H  28.97 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.66661  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2217  RNase HI  32.21 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203756 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5115  hypothetical protein  33.03 
 
 		 388 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.503544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4895  ribonuclease H  30.2 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4830  ribonuclease H  30.16 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.935261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1739  ribonuclease H  31.69 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8140  ribonuclease H  49.06 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1763  ribonuclease H  31.71 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0424  ribonuclease H  31.71 
 
 		 154 aa  54.7  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.456208  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10510  ribonuclease HI  29.27 
 
 		 161 aa  54.3  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000169175 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1354  Ribonuclease HI-like protein  25.76 
 
 		 417 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.384272  hitchhiker  0.000000713582 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1325  hypothetical protein  25.76 
 
 		 417 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2679  hypothetical protein  30.83 
 
 		 149 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.207946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2281  ribonuclease H  31.54 
 
 		 159 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1544  ribonuclease H  28.87 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2924  ribonuclease H  31.69 
 
 		 159 aa  52  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3313  Ribonuclease H  29.32 
 
 		 157 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0204  RNase HI  30 
 
 		 152 aa  52  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2653  ribonuclease H  30.07 
 
 		 149 aa  51.6  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.694981  normal  0.0661742 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1523  cell wall enzyme EbsB-like protein  23.26 
 
 		 133 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1992  ribonuclease H  31.69 
 
 		 146 aa  50.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324706 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0399  ribonuclease HI  30.87 
 
 		 158 aa  50.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0563  Ribonuclease H  30.87 
 
 		 158 aa  50.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1494  ribonuclease HI-like protein  23.26 
 
 		 133 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3655  ribonuclease H  30.5 
 
 		 151 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499502  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0852  ribonuclease H  30.82 
 
 		 164 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0719  RNase H  32.21 
 
 		 155 aa  49.7  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0947469  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2875  ribonuclease H  53.19 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.542501 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5247  ribonuclease H  31.03 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.021715 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1923  hypothetical protein  32.59 
 
 		 124 aa  49.7  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2183  RNase HI  35.37 
 
 		 259 aa  49.3  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>