80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2246 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_2246  ribonuclease H  100 
 
 
148 aa  299  8.000000000000001e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.454266  hitchhiker  0.00558183 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0755  ribonuclease H  45.19 
 
 
187 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0273  ribonuclease H  40.74 
 
 
199 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.442052 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1739  ribonuclease H  44.44 
 
 
187 aa  114  3e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0162  ribonuclease H  40.71 
 
 
142 aa  100  6e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.765291  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  36.29 
 
 
253 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  36.29 
 
 
253 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  36.29 
 
 
168 aa  94.4  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  37.1 
 
 
254 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  41.91 
 
 
198 aa  91.7  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  37.31 
 
 
370 aa  87  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.77 
 
 
365 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.77 
 
 
365 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.77 
 
 
365 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  40 
 
 
391 aa  85.9  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.61 
 
 
369 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1384  ribonuclease H  35.82 
 
 
216 aa  82  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000297522  normal  0.0974241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4219  ribonuclease H  39.67 
 
 
313 aa  81.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  45.78 
 
 
364 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  41.67 
 
 
356 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.17 
 
 
378 aa  77.4  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1173  ribonuclease H  37.62 
 
 
194 aa  77  0.00000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  34.85 
 
 
383 aa  77  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  39.56 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  40.91 
 
 
133 aa  72.8  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  39.55 
 
 
440 aa  71.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 
412 aa  70.9  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_303  hypothetical protein  41.89 
 
 
81 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  38.76 
 
 
452 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2587  ribonuclease H  34.35 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.45 
 
 
382 aa  68.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0088  ribonuclease H  37.36 
 
 
211 aa  66.6  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_8015  predicted protein  38.37 
 
 
126 aa  66.6  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00418489  normal  0.339866 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1354  Ribonuclease HI-like protein  36.96 
 
 
417 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.384272  hitchhiker  0.000000713582 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1325  hypothetical protein  36.96 
 
 
417 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  35.25 
 
 
363 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44751  predicted protein  40.21 
 
 
376 aa  64.3  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155872  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3066  ribonuclease H  31.85 
 
 
197 aa  63.9  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.25 
 
 
427 aa  62.8  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0341  ribonuclease H  34.19 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  38.54 
 
 
322 aa  62.8  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  33.85 
 
 
401 aa  61.6  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  40 
 
 
402 aa  61.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  36.73 
 
 
378 aa  61.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  32.56 
 
 
132 aa  61.2  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3014  hypothetical protein  30 
 
 
154 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157547  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4830  ribonuclease H  29.92 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.935261  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1351  ribonuclease H  29.92 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  40.66 
 
 
411 aa  59.3  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  37.29 
 
 
366 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4711  ribonuclease H  30.33 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.42605  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.9 
 
 
378 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5115  hypothetical protein  37.33 
 
 
388 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.503544 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1437  ribonuclease H  34.38 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1207  ribonuclease H  33.87 
 
 
198 aa  56.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623117  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3686  ribonuclease H  36.05 
 
 
128 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1714  ribonuclease H  37.21 
 
 
128 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461816  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1507  ribonuclease H  37.21 
 
 
128 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1479  ribonuclease H  37.21 
 
 
128 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.221091  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1469  ribonuclease H  37.21 
 
 
128 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.718462  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1623  ribonuclease H  37.21 
 
 
128 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1691  ribonuclease H  37.21 
 
 
128 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1659  ribonuclease H  36.05 
 
 
128 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1764  ribonuclease H  37.21 
 
 
128 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0309  ribonuclease H  34.62 
 
 
197 aa  53.9  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1321  ribonuclease H  35.11 
 
 
132 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00120412  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1511  ribonuclease H  37.21 
 
 
128 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2679  hypothetical protein  30.97 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.207946  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0307  ribonuclease H  32.06 
 
 
198 aa  52  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483531  normal  0.133717 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0205  ribonuclease H  32.89 
 
 
118 aa  51.6  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1556  ribonuclease H  28.7 
 
 
154 aa  50.8  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1523  cell wall enzyme EbsB-like protein  30 
 
 
133 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  36 
 
 
412 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1494  ribonuclease HI-like protein  30 
 
 
133 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1923  hypothetical protein  29.1 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2382  ribonuclease H  30 
 
 
209 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.227808  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1261  hypothetical protein  29.41 
 
 
218 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000530874  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2143  hypothetical protein  29.93 
 
 
221 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0891  ribonuclease H  32.84 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000481849  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1010  cell wall enzyme EbsB, putative  27.78 
 
 
131 aa  40.8  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>