More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2183 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2183  RNase HI  100 
 
 		 259 aa  531  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0428  ribonuclease H  51.04 
 
 		 302 aa  263  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1511  ribonuclease H  52.26 
 
 		 302 aa  261  6e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3313  Ribonuclease H  68.15 
 
 		 157 aa  221  8e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2151  ribonuclease HI  44.27 
 
 		 247 aa  202  5e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27831  ribonuclease HI  42.86 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2466  RNase HI  41.6 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.26323 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1567  ribonuclease HI  53.85 
 
 		 161 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02761  ribonuclease HI  53.85 
 
 		 161 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.175549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02181  ribonuclease HI  51.35 
 
 		 163 aa  165  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.959518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0855  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.85 
 
 		 532 aa  157  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1965  ribonuclease H  59.56 
 
 		 160 aa  155  7e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000316146  unclonable  0.00000002511 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0833  bifunctional ribonuclease HI/DNA polymerase III, epsilon subunit  55.56 
 
 		 527 aa  154  1e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02291  ribonuclease HI  38 
 
 		 239 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.818783  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2217  RNase HI  52.38 
 
 		 149 aa  151  8e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203756 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3712  ribonuclease HI  55.63 
 
 		 150 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0350909  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1763  ribonuclease H  55.63 
 
 		 150 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.890131 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  55.07 
 
 		 154 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3467  ribonuclease H  54.93 
 
 		 148 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0955  ribonuclease H  56.93 
 
 		 150 aa  149  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4142  ribonuclease H  53.52 
 
 		 148 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1723  ribonuclease H  53.52 
 
 		 148 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3714  ribonuclease H  53.52 
 
 		 148 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.246358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  55.07 
 
 		 154 aa  148  9e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3481  ribonuclease H  53.15 
 
 		 148 aa  148  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2066  ribonuclease H  57.35 
 
 		 150 aa  148  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043986  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41060  ribonuclease H  53.15 
 
 		 148 aa  148  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  49.35 
 
 		 154 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  49.35 
 
 		 154 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0500  ribonuclease H  52.78 
 
 		 153 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.478203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  50 
 
 		 153 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2873  Ribonuclease H  52.11 
 
 		 148 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00808472  normal  0.318566 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1464  ribonuclease H  53.19 
 
 		 149 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1745  ribonuclease H  52.78 
 
 		 148 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.134383 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2281  ribonuclease H  54.68 
 
 		 159 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1251  ribonuclease H  52.11 
 
 		 148 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1973  ribonuclease H  52.78 
 
 		 148 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1680  ribonuclease H  51.05 
 
 		 161 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.254579  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0593  ribonuclease H  54.42 
 
 		 155 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2653  ribonuclease H  54.01 
 
 		 149 aa  146  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.694981  normal  0.0661742 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  56.52 
 
 		 150 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3054  ribonuclease H  55.88 
 
 		 166 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0453376  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  56.52 
 
 		 161 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3357  ribonuclease H  52.45 
 
 		 142 aa  145  6e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4895  ribonuclease H  51.75 
 
 		 148 aa  145  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1585  ribonuclease H  53.9 
 
 		 149 aa  145  8.000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272644  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2274  ribonuclease H  52.29 
 
 		 156 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.933446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1085  ribonuclease H  52.45 
 
 		 143 aa  145  9e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4395  ribonuclease H  53.62 
 
 		 154 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.480095 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0844  ribonuclease H  51.39 
 
 		 150 aa  144  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1970  ribonuclease H  53.33 
 
 		 160 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.501543 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1014  ribonuclease H  50.69 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.733459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1534  ribonuclease H  54.07 
 
 		 147 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920794  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00207  ribonuclease H  48.63 
 
 		 155 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.851229  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3394  Ribonuclease H  48.63 
 
 		 155 aa  143  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.770336  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  50.33 
 
 		 151 aa  143  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0301  ribonuclease H  50.35 
 
 		 155 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00212  hypothetical protein  48.63 
 
 		 155 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0219  ribonuclease H  48.63 
 
 		 155 aa  143  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.523494  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0293  ribonuclease H  50.35 
 
 		 155 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.358682  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0286  ribonuclease H  50.35 
 
 		 155 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3451  ribonuclease H  48.63 
 
 		 155 aa  143  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.453001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0227  ribonuclease H  48.63 
 
 		 155 aa  143  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0209104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2851  ribonuclease H  48.34 
 
 		 147 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0288  ribonuclease H  50.35 
 
 		 155 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.170302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  51.8 
 
 		 162 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0307  ribonuclease H  50.35 
 
 		 155 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0142891  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0225  ribonuclease H  48.63 
 
 		 155 aa  143  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.367892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0219  ribonuclease H  48.63 
 
 		 155 aa  143  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00237232  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0209  ribonuclease H  48.63 
 
 		 155 aa  143  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2939  ribonuclease H  46.62 
 
 		 163 aa  143  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3617  ribonuclease H  51.75 
 
 		 155 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.919158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  53.28 
 
 		 145 aa  143  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000168272  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29600  ribonuclease H  53.33 
 
 		 152 aa  142  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.891548  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2186  ribonuclease H  52.08 
 
 		 153 aa  142  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0502  ribonuclease H  50 
 
 		 157 aa  142  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  51.41 
 
 		 148 aa  142  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  53.68 
 
 		 155 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2435  Ribonuclease H  50.7 
 
 		 235 aa  142  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000684172  hitchhiker  0.00771463 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1663  ribonuclease HI  50.7 
 
 		 148 aa  142  8e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.835825 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2778  Ribonuclease H  52.17 
 
 		 153 aa  142  8e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0868  ribonuclease H  50 
 
 		 148 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243727  normal  0.451951 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4076  ribonuclease H  52.86 
 
 		 153 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1992  ribonuclease H  55.4 
 
 		 146 aa  141  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324706 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2071  ribonuclease H  50.71 
 
 		 149 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  50.69 
 
 		 147 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000165419  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  50.7 
 
 		 148 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2687  ribonuclease H  52.86 
 
 		 154 aa  139  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.319525  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2815  ribonuclease H  52.11 
 
 		 147 aa  139  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  50.7 
 
 		 148 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0684  ribonuclease H  51.08 
 
 		 150 aa  139  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0484  ribonuclease H  50 
 
 		 157 aa  139  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416034 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3743  ribonuclease H  51.45 
 
 		 151 aa  140  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2573  ribonuclease H  51.05 
 
 		 157 aa  140  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0063199  hitchhiker  0.000000590654 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  50.7 
 
 		 148 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  50.7 
 
 		 148 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  50.7 
 
 		 148 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08950  Ribonuclease H  45.65 
 
 		 269 aa  140  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0748  ribonuclease H  48.94 
 
 		 155 aa  140  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.533393  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  50.7 
 
 		 148 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>