76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1544 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1544  ribonuclease H  100 
 
 
217 aa  422  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3678  ribonuclease H  82.03 
 
 
217 aa  336  9.999999999999999e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.66661  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2875  ribonuclease H  61.4 
 
 
220 aa  202  3e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.542501 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  39.55 
 
 
363 aa  67.4  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.06 
 
 
382 aa  64.3  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  39.13 
 
 
440 aa  63.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  38.41 
 
 
452 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.22 
 
 
427 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  36.3 
 
 
137 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  43.75 
 
 
168 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  43.75 
 
 
253 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  43.75 
 
 
253 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  35.64 
 
 
198 aa  59.7  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1207  ribonuclease H  37.1 
 
 
198 aa  59.7  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623117  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  43.75 
 
 
254 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  34.46 
 
 
378 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_8015  predicted protein  29.37 
 
 
126 aa  56.6  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00418489  normal  0.339866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.82 
 
 
356 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
370 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.21 
 
 
378 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  35.4 
 
 
412 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  49.32 
 
 
366 aa  53.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0088  ribonuclease H  28.87 
 
 
211 aa  52.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  37.37 
 
 
411 aa  52.4  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6404  ribonuclease H  42.5 
 
 
215 aa  51.6  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  40.22 
 
 
391 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  44.58 
 
 
412 aa  51.2  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.78 
 
 
378 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0307  ribonuclease H  39.08 
 
 
198 aa  50.8  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483531  normal  0.133717 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1437  ribonuclease H  31.86 
 
 
134 aa  50.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  34.04 
 
 
383 aa  49.7  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  41.46 
 
 
133 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1321  ribonuclease H  38.46 
 
 
132 aa  49.3  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00120412  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0309  ribonuclease H  32.45 
 
 
197 aa  49.3  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  42.53 
 
 
401 aa  48.9  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  34.59 
 
 
132 aa  48.9  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1906  Ribonuclease H  34.26 
 
 
241 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000526772  normal  0.35014 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.17 
 
 
369 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2587  ribonuclease H  40.91 
 
 
197 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1659  ribonuclease H  38.46 
 
 
128 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3686  ribonuclease H  38.46 
 
 
128 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0341  ribonuclease H  33.61 
 
 
142 aa  46.6  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3655  ribonuclease H  27.86 
 
 
151 aa  45.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499502  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  46.3 
 
 
364 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1556  ribonuclease H  34.83 
 
 
154 aa  45.4  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4219  ribonuclease H  34.41 
 
 
313 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1985  ribonuclease H  35.71 
 
 
230 aa  45.1  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000102134  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  43.37 
 
 
322 aa  44.7  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1507  ribonuclease H  37.18 
 
 
128 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1691  ribonuclease H  37.18 
 
 
128 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1714  ribonuclease H  37.18 
 
 
128 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1479  ribonuclease H  37.18 
 
 
128 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.221091  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1469  ribonuclease H  37.18 
 
 
128 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.718462  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1623  ribonuclease H  37.18 
 
 
128 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  51.85 
 
 
365 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  51.85 
 
 
365 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  51.85 
 
 
365 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1511  ribonuclease H  37.18 
 
 
128 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1764  ribonuclease H  37.18 
 
 
128 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1837  ribonuclease H  30.82 
 
 
153 aa  44.7  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000470607  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3066  ribonuclease H  31.25 
 
 
197 aa  43.5  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0891  ribonuclease H  31.11 
 
 
139 aa  43.9  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000481849  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
402 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1987  ribonuclease H  36.36 
 
 
159 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2729  ribonuclease H  40 
 
 
192 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1024  ribonuclease H  29.67 
 
 
154 aa  43.9  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226266  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1173  ribonuclease H  26.72 
 
 
194 aa  43.1  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1351  ribonuclease H  44.44 
 
 
152 aa  42.4  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8140  ribonuclease H  35.8 
 
 
242 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2939  ribonuclease H  32.97 
 
 
163 aa  42.4  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1285  ribonuclease H  30.95 
 
 
147 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1256  ribonuclease H  30.95 
 
 
147 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262659  normal  0.25341 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0804  ribonuclease H  30.95 
 
 
147 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4711  ribonuclease H  31.33 
 
 
154 aa  42.4  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.42605  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4395  ribonuclease H  34.94 
 
 
154 aa  42  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.480095 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2143  hypothetical protein  32.12 
 
 
221 aa  41.6  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>